Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9ACV9

Protein Details
Accession R9ACV9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-374PRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-82RKTGGR
91-99RHIGGGHKR
336-383GGRGKSKGDKDPRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRQRVRVRGRK
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.333, nucl 3.5, cyto_nucl 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
KEGG wic:J056_001471  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
Amino Acid Sequences MHATAGVLRMGGEATSTSRTNAKANAPAHTRKTAPLVRISNQFKTFKPLTPSLRHVRIPLTDISNSGPFKPLTISKRKTGGRNSSGRVVSRHIGGGHKRRVRTLDFARIEGGVRRVVRLEYDPNRSAHIALLRGESGASEAHPHSSPWSYIIAPKGLKAGDTVQSFRTLSDAGIAKLTAAASQGDFSGDVLSRGGDSDKSTSTPTPTKVSSLDLGLLRMITVRPGNVLPLRLMPVGTLVHCIGLKVGGNGLLCRSAGSYGQVIALHSGPRSRYAQIRLQSGEVRLVLMECCATVGVVSNEHHHLKSLGKAGRSRWLGRRPSVRGVAMNTVDHPLGGGRGKSKGDKDPRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRQRVRVRGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.19
6 0.21
7 0.24
8 0.28
9 0.31
10 0.36
11 0.37
12 0.43
13 0.47
14 0.52
15 0.54
16 0.54
17 0.5
18 0.45
19 0.52
20 0.49
21 0.46
22 0.48
23 0.49
24 0.48
25 0.56
26 0.59
27 0.58
28 0.6
29 0.59
30 0.5
31 0.53
32 0.51
33 0.47
34 0.49
35 0.49
36 0.5
37 0.54
38 0.61
39 0.61
40 0.65
41 0.61
42 0.56
43 0.53
44 0.47
45 0.44
46 0.4
47 0.36
48 0.3
49 0.29
50 0.3
51 0.31
52 0.29
53 0.27
54 0.26
55 0.21
56 0.21
57 0.24
58 0.28
59 0.3
60 0.4
61 0.43
62 0.45
63 0.54
64 0.58
65 0.62
66 0.65
67 0.67
68 0.65
69 0.69
70 0.67
71 0.66
72 0.64
73 0.58
74 0.51
75 0.45
76 0.38
77 0.32
78 0.3
79 0.24
80 0.27
81 0.33
82 0.4
83 0.46
84 0.49
85 0.49
86 0.5
87 0.54
88 0.51
89 0.52
90 0.5
91 0.51
92 0.47
93 0.46
94 0.44
95 0.39
96 0.36
97 0.29
98 0.24
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.25
107 0.26
108 0.33
109 0.36
110 0.35
111 0.37
112 0.36
113 0.33
114 0.27
115 0.23
116 0.18
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.14
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.18
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.16
155 0.11
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.18
198 0.16
199 0.16
200 0.13
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.23
260 0.27
261 0.34
262 0.36
263 0.41
264 0.38
265 0.39
266 0.39
267 0.34
268 0.32
269 0.25
270 0.2
271 0.15
272 0.14
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.06
282 0.07
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.18
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.23
293 0.29
294 0.29
295 0.31
296 0.35
297 0.36
298 0.43
299 0.46
300 0.47
301 0.48
302 0.54
303 0.57
304 0.61
305 0.68
306 0.65
307 0.67
308 0.67
309 0.61
310 0.55
311 0.51
312 0.5
313 0.43
314 0.38
315 0.32
316 0.28
317 0.25
318 0.21
319 0.18
320 0.11
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.19
326 0.23
327 0.28
328 0.33
329 0.4
330 0.48
331 0.55
332 0.61
333 0.65
334 0.69
335 0.7
336 0.66
337 0.59
338 0.58
339 0.54
340 0.54
341 0.54
342 0.57
343 0.6
344 0.69
345 0.75
346 0.77
347 0.82
348 0.85
349 0.86
350 0.86
351 0.87
352 0.89
353 0.9
354 0.88
355 0.85
356 0.77
357 0.78
358 0.77
359 0.75
360 0.69
361 0.66
362 0.66
363 0.69