Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AA17

Protein Details
Accession R9AA17    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-159RPGRKPARLTQQRRELKQKSBasic
377-403DERDQRAPPRGYKKRRRETDESNNEEGBasic
426-446LQSPQKRKGGTKDKEKKQSFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-144RK
317-348PRSKSESKSTRGRGGKRKDQGRNSTAAKSKSK
383-393APPRGYKKRRR
417-442ANGSRKDKQLQSPQKRKGGTKDKEKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG wic:J056_002578  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MSDMSEKRGEEEQQQQNATKLEPVDEPIDQEQPMDHDSLEKPQEVSREDVNQEIHQAEEEDEEEDEGGEGGEGVEGGSGETRCVCGNSDEESYGFMIQCETCGCWQHGVCVGLVEEKYAPETYYCEECRPDMHPIVIPGRPGRKPARLTQQRRELKQKSPINNTSNNPNPSRRRSSSSIDTAERARSPKRRSTLNSRDAAYDDAIAASLLDVQNDSIKSQIAEKEKHRWLHYGPPSQQEDEQHHDNNDNDHHPHDPTHPDELEQPEHPPQPEPDHTQHNDSKDLDKEGDLPQQSESDPPTYKDKTEPAPDSEADYKPRSKSESKSTRGRGGKRKDQGRNSTAAKSKSKEKSVVSGVNDEDDRNENSKRSASPPPATDERDQRAPPRGYKKRRRETDESNNEEGFTPPATANGPKRTANGSRKDKQLQSPQKRKGGTKDKEKKQSFDDESSLYWNLPDHLQHLSHLLPTEQPEMLALRIPHGSSTSSMDTVKELPTRVKFPSKRMTIGEMKRRVRSVLEYVGRVQIEAAEKPAPPEVTEDGKAPESIQMLDDLTRELIRFNDKFSTSTKRREEEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.5
4 0.49
5 0.43
6 0.37
7 0.29
8 0.25
9 0.23
10 0.24
11 0.24
12 0.23
13 0.26
14 0.24
15 0.26
16 0.23
17 0.22
18 0.19
19 0.19
20 0.2
21 0.17
22 0.14
23 0.16
24 0.17
25 0.25
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.27
30 0.32
31 0.3
32 0.33
33 0.3
34 0.33
35 0.33
36 0.35
37 0.36
38 0.31
39 0.32
40 0.28
41 0.24
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.04
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.12
72 0.11
73 0.14
74 0.17
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.2
93 0.22
94 0.26
95 0.25
96 0.23
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.12
109 0.14
110 0.2
111 0.22
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.25
116 0.26
117 0.29
118 0.25
119 0.25
120 0.24
121 0.26
122 0.3
123 0.28
124 0.27
125 0.26
126 0.31
127 0.31
128 0.35
129 0.38
130 0.42
131 0.45
132 0.51
133 0.57
134 0.61
135 0.69
136 0.71
137 0.76
138 0.76
139 0.78
140 0.8
141 0.74
142 0.71
143 0.73
144 0.71
145 0.69
146 0.71
147 0.73
148 0.68
149 0.7
150 0.64
151 0.63
152 0.63
153 0.6
154 0.54
155 0.54
156 0.56
157 0.57
158 0.63
159 0.59
160 0.58
161 0.58
162 0.61
163 0.6
164 0.6
165 0.57
166 0.5
167 0.48
168 0.43
169 0.4
170 0.36
171 0.31
172 0.31
173 0.34
174 0.39
175 0.44
176 0.47
177 0.52
178 0.56
179 0.64
180 0.67
181 0.68
182 0.66
183 0.6
184 0.56
185 0.49
186 0.44
187 0.34
188 0.23
189 0.15
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.06
194 0.04
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.16
208 0.19
209 0.24
210 0.27
211 0.35
212 0.4
213 0.45
214 0.44
215 0.42
216 0.39
217 0.44
218 0.5
219 0.5
220 0.47
221 0.49
222 0.5
223 0.48
224 0.47
225 0.4
226 0.37
227 0.33
228 0.34
229 0.29
230 0.27
231 0.28
232 0.26
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.18
237 0.17
238 0.18
239 0.17
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.22
245 0.21
246 0.21
247 0.23
248 0.25
249 0.24
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.2
256 0.18
257 0.21
258 0.24
259 0.27
260 0.27
261 0.32
262 0.33
263 0.37
264 0.39
265 0.35
266 0.35
267 0.31
268 0.3
269 0.25
270 0.25
271 0.2
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.19
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.22
290 0.24
291 0.25
292 0.3
293 0.31
294 0.28
295 0.3
296 0.29
297 0.3
298 0.31
299 0.28
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.24
304 0.26
305 0.27
306 0.28
307 0.31
308 0.38
309 0.45
310 0.48
311 0.56
312 0.58
313 0.61
314 0.64
315 0.67
316 0.66
317 0.65
318 0.68
319 0.67
320 0.73
321 0.73
322 0.74
323 0.75
324 0.68
325 0.66
326 0.6
327 0.58
328 0.54
329 0.51
330 0.47
331 0.41
332 0.47
333 0.47
334 0.48
335 0.47
336 0.43
337 0.43
338 0.45
339 0.48
340 0.4
341 0.37
342 0.33
343 0.3
344 0.28
345 0.23
346 0.18
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.23
356 0.29
357 0.32
358 0.35
359 0.36
360 0.4
361 0.42
362 0.44
363 0.44
364 0.43
365 0.41
366 0.43
367 0.42
368 0.4
369 0.44
370 0.44
371 0.48
372 0.52
373 0.58
374 0.63
375 0.72
376 0.79
377 0.81
378 0.86
379 0.88
380 0.85
381 0.84
382 0.85
383 0.85
384 0.81
385 0.74
386 0.65
387 0.57
388 0.49
389 0.4
390 0.3
391 0.19
392 0.14
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.15
397 0.2
398 0.25
399 0.28
400 0.28
401 0.3
402 0.35
403 0.42
404 0.46
405 0.51
406 0.55
407 0.57
408 0.64
409 0.68
410 0.68
411 0.67
412 0.7
413 0.71
414 0.73
415 0.77
416 0.78
417 0.78
418 0.78
419 0.74
420 0.73
421 0.73
422 0.71
423 0.72
424 0.74
425 0.76
426 0.83
427 0.82
428 0.75
429 0.7
430 0.71
431 0.65
432 0.6
433 0.53
434 0.44
435 0.41
436 0.4
437 0.36
438 0.25
439 0.2
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.14
446 0.15
447 0.15
448 0.17
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.16
455 0.19
456 0.16
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.15
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.13
470 0.18
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.19
475 0.2
476 0.21
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.25
481 0.29
482 0.32
483 0.36
484 0.45
485 0.45
486 0.5
487 0.59
488 0.58
489 0.58
490 0.58
491 0.6
492 0.59
493 0.64
494 0.66
495 0.66
496 0.66
497 0.66
498 0.64
499 0.59
500 0.53
501 0.49
502 0.46
503 0.46
504 0.45
505 0.42
506 0.42
507 0.46
508 0.42
509 0.36
510 0.29
511 0.23
512 0.22
513 0.2
514 0.21
515 0.19
516 0.19
517 0.21
518 0.25
519 0.22
520 0.19
521 0.23
522 0.24
523 0.27
524 0.28
525 0.28
526 0.27
527 0.28
528 0.27
529 0.24
530 0.23
531 0.19
532 0.18
533 0.17
534 0.15
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.13
539 0.14
540 0.14
541 0.13
542 0.13
543 0.15
544 0.23
545 0.23
546 0.25
547 0.31
548 0.31
549 0.33
550 0.37
551 0.45
552 0.43
553 0.52
554 0.57
555 0.54