Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AIF0

Protein Details
Accession R9AIF0    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-61VKDYRNQHNHIAKRKPQRQASPNTDSDHydrophilic
98-124ASTCSPSKSPPVSRKNRYNNNLKKSNLHydrophilic
249-271MKELSPKKKKGDKQSRKEKETGDBasic
430-455LLSGDKRPKPKPKARAAKQQNHSNQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-12GKKK
224-273NKSPKFAKNQIGKKRRESVDKKELDMKELSPKKKKGDKQSRKEKETGDAK
432-447SGDKRPKPKPKARAAK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG wic:J056_003670  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSSVFAPKGKKKVGPSAPFKPPGSSKVESISLEQVKDYRNQHNHIAKRKPQRQASPNTDSDEDAQTRQQLIPEKSVAMRNLKQKGPIDFTPDNSFSAASTCSPSKSPPVSRKNRYNNNLKKSNLNKKFSFSPEAETPVEERPARQRNRTNFLLDDITGVSTQSSASPEKEESISPPFQYELRDSGSESPPSLDDAILAPSASKVRKSSLDSLSPIRKKISDNLNKSPKFAKNQIGKKRRESVDKKELDMKELSPKKKKGDKQSRKEKETGDAKKIEPHNTKINVSRSANYEDDEGEPTPKKRRGNNNIQNSTNEDVNENSIEVSNPLASKPKAKKLQRIIVANTKKPSVDPVEQSQKDGLFKECDVINSYITSVSQEEQQKSPKSSGARNRAIATAVRLSEDEDADGDVVQGKKKATTSSQPHPKKESILLSGDKRPKPKPKARAAKQQNHSNQSNIPAFFKPTVKPSDIQLCPVCDNKLPHLRTQHLKTVLKEFLNVAKLSPRTSNPYGMKAHVVAESELCTAHELDTKVIPEGQKKGYPIEHDWNRVSDRIMKLSKKIKVVIKYKESSRFWIKAREDYAKVGSKKANGLDVQFENFEDEQPGYYGEIGLMVISFTLNALSTSKPKSKIKLNQSLTNPLSPKDFIRRVLVPEVANLLIAQDRGVSTEIAEEIRRDSREYGNAVFSADMEDIAWRPQLPTDLISDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.74
3 0.74
4 0.77
5 0.78
6 0.73
7 0.68
8 0.62
9 0.58
10 0.57
11 0.51
12 0.44
13 0.42
14 0.45
15 0.4
16 0.38
17 0.42
18 0.37
19 0.35
20 0.34
21 0.32
22 0.3
23 0.36
24 0.38
25 0.4
26 0.44
27 0.47
28 0.56
29 0.62
30 0.68
31 0.71
32 0.75
33 0.74
34 0.78
35 0.83
36 0.83
37 0.83
38 0.85
39 0.84
40 0.85
41 0.85
42 0.82
43 0.77
44 0.73
45 0.64
46 0.55
47 0.49
48 0.44
49 0.37
50 0.31
51 0.29
52 0.27
53 0.28
54 0.27
55 0.28
56 0.31
57 0.32
58 0.35
59 0.34
60 0.34
61 0.35
62 0.39
63 0.4
64 0.39
65 0.42
66 0.45
67 0.5
68 0.5
69 0.54
70 0.54
71 0.56
72 0.55
73 0.51
74 0.52
75 0.47
76 0.48
77 0.48
78 0.45
79 0.39
80 0.33
81 0.3
82 0.22
83 0.21
84 0.19
85 0.13
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.2
91 0.27
92 0.33
93 0.41
94 0.47
95 0.57
96 0.66
97 0.74
98 0.82
99 0.85
100 0.88
101 0.87
102 0.88
103 0.87
104 0.87
105 0.85
106 0.77
107 0.76
108 0.75
109 0.78
110 0.77
111 0.74
112 0.66
113 0.64
114 0.68
115 0.64
116 0.6
117 0.5
118 0.47
119 0.43
120 0.45
121 0.41
122 0.35
123 0.32
124 0.28
125 0.32
126 0.26
127 0.25
128 0.29
129 0.38
130 0.43
131 0.5
132 0.56
133 0.59
134 0.66
135 0.68
136 0.63
137 0.54
138 0.52
139 0.46
140 0.37
141 0.29
142 0.23
143 0.2
144 0.15
145 0.14
146 0.1
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.1
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.15
155 0.17
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.23
160 0.24
161 0.21
162 0.22
163 0.2
164 0.2
165 0.22
166 0.21
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.25
172 0.27
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.08
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.17
192 0.22
193 0.27
194 0.34
195 0.36
196 0.39
197 0.4
198 0.45
199 0.51
200 0.49
201 0.46
202 0.4
203 0.37
204 0.35
205 0.4
206 0.44
207 0.45
208 0.49
209 0.57
210 0.66
211 0.63
212 0.64
213 0.63
214 0.58
215 0.54
216 0.53
217 0.52
218 0.51
219 0.6
220 0.69
221 0.71
222 0.71
223 0.72
224 0.75
225 0.71
226 0.72
227 0.7
228 0.69
229 0.7
230 0.67
231 0.62
232 0.62
233 0.57
234 0.5
235 0.44
236 0.36
237 0.35
238 0.4
239 0.44
240 0.44
241 0.49
242 0.53
243 0.6
244 0.66
245 0.67
246 0.72
247 0.76
248 0.78
249 0.85
250 0.87
251 0.83
252 0.81
253 0.71
254 0.68
255 0.68
256 0.63
257 0.58
258 0.52
259 0.47
260 0.49
261 0.51
262 0.51
263 0.45
264 0.43
265 0.45
266 0.44
267 0.46
268 0.46
269 0.46
270 0.44
271 0.42
272 0.4
273 0.35
274 0.36
275 0.34
276 0.28
277 0.25
278 0.19
279 0.18
280 0.18
281 0.15
282 0.14
283 0.15
284 0.17
285 0.23
286 0.27
287 0.31
288 0.37
289 0.48
290 0.55
291 0.64
292 0.72
293 0.75
294 0.76
295 0.72
296 0.65
297 0.58
298 0.5
299 0.4
300 0.3
301 0.2
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.1
315 0.1
316 0.18
317 0.23
318 0.31
319 0.39
320 0.44
321 0.52
322 0.57
323 0.64
324 0.62
325 0.62
326 0.57
327 0.58
328 0.58
329 0.53
330 0.46
331 0.39
332 0.33
333 0.28
334 0.28
335 0.23
336 0.22
337 0.21
338 0.26
339 0.35
340 0.35
341 0.36
342 0.34
343 0.29
344 0.27
345 0.25
346 0.21
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.15
353 0.15
354 0.13
355 0.11
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.11
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.25
367 0.27
368 0.28
369 0.29
370 0.28
371 0.27
372 0.32
373 0.39
374 0.43
375 0.45
376 0.45
377 0.45
378 0.42
379 0.4
380 0.33
381 0.27
382 0.2
383 0.15
384 0.14
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.1
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.15
403 0.16
404 0.24
405 0.3
406 0.38
407 0.49
408 0.54
409 0.57
410 0.6
411 0.58
412 0.52
413 0.5
414 0.44
415 0.37
416 0.35
417 0.34
418 0.33
419 0.39
420 0.44
421 0.42
422 0.44
423 0.47
424 0.53
425 0.59
426 0.65
427 0.68
428 0.7
429 0.78
430 0.81
431 0.85
432 0.85
433 0.85
434 0.84
435 0.84
436 0.8
437 0.76
438 0.7
439 0.61
440 0.52
441 0.48
442 0.44
443 0.35
444 0.31
445 0.24
446 0.25
447 0.26
448 0.26
449 0.22
450 0.23
451 0.27
452 0.26
453 0.26
454 0.27
455 0.34
456 0.32
457 0.35
458 0.32
459 0.3
460 0.3
461 0.31
462 0.29
463 0.23
464 0.25
465 0.27
466 0.34
467 0.34
468 0.36
469 0.41
470 0.45
471 0.48
472 0.51
473 0.52
474 0.51
475 0.53
476 0.51
477 0.51
478 0.5
479 0.43
480 0.39
481 0.33
482 0.29
483 0.29
484 0.27
485 0.21
486 0.22
487 0.22
488 0.23
489 0.25
490 0.23
491 0.27
492 0.3
493 0.38
494 0.35
495 0.4
496 0.4
497 0.38
498 0.38
499 0.31
500 0.3
501 0.23
502 0.22
503 0.16
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.13
513 0.12
514 0.13
515 0.15
516 0.16
517 0.16
518 0.18
519 0.19
520 0.19
521 0.23
522 0.26
523 0.27
524 0.28
525 0.31
526 0.32
527 0.35
528 0.37
529 0.42
530 0.43
531 0.46
532 0.46
533 0.46
534 0.44
535 0.41
536 0.37
537 0.34
538 0.31
539 0.34
540 0.39
541 0.37
542 0.43
543 0.5
544 0.53
545 0.51
546 0.54
547 0.53
548 0.56
549 0.62
550 0.63
551 0.64
552 0.64
553 0.65
554 0.68
555 0.64
556 0.62
557 0.62
558 0.58
559 0.53
560 0.57
561 0.54
562 0.52
563 0.55
564 0.55
565 0.49
566 0.47
567 0.5
568 0.49
569 0.47
570 0.45
571 0.43
572 0.39
573 0.41
574 0.39
575 0.39
576 0.32
577 0.33
578 0.34
579 0.32
580 0.31
581 0.27
582 0.25
583 0.23
584 0.22
585 0.21
586 0.16
587 0.15
588 0.13
589 0.13
590 0.14
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.05
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.03
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.07
608 0.09
609 0.15
610 0.21
611 0.28
612 0.35
613 0.4
614 0.46
615 0.55
616 0.63
617 0.68
618 0.73
619 0.73
620 0.74
621 0.74
622 0.77
623 0.69
624 0.66
625 0.57
626 0.48
627 0.45
628 0.38
629 0.38
630 0.38
631 0.4
632 0.36
633 0.41
634 0.43
635 0.44
636 0.48
637 0.47
638 0.38
639 0.35
640 0.35
641 0.28
642 0.25
643 0.19
644 0.15
645 0.12
646 0.12
647 0.1
648 0.08
649 0.08
650 0.1
651 0.11
652 0.1
653 0.09
654 0.11
655 0.13
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.16
660 0.22
661 0.23
662 0.24
663 0.26
664 0.3
665 0.35
666 0.38
667 0.38
668 0.36
669 0.35
670 0.33
671 0.29
672 0.23
673 0.2
674 0.16
675 0.13
676 0.09
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.14
681 0.12
682 0.12
683 0.14
684 0.18
685 0.19
686 0.2
687 0.22