Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AFE2

Protein Details
Accession R9AFE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24HDTTTPTVRRRRLFRSRSGTQHydrophilic
749-772TSSFTRRPTSNRPREPRQPPDGEKHydrophilic
877-908DPPPSGPRSKQSSRPRKQTKPANIKSKPAPKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
882-905GPRSKQSSRPRKQTKPANIKSKPA
Subcellular Location(s) plas 22, cyto 2, mito 1, cyto_nucl 1, E.R. 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011701  MFS  
IPR036259  MFS_trans_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001958  Tet-R_TetA/multi-R_MdtG  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
KEGG wic:J056_004766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07690  MFS_1  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MEHHDTTTPTVRRRRLFRSRSGTQSALLGTSSTRPTSMPLGRRLGESTIFSQGVPIKTKVEPSNPLPKLPISLLSFSMLSEFLSASVAAPFIFIMVSKFAITHNDESLVGYYTGILGAAFFLSQFITALMWSNIADRYGRRITLFISLFGNAIATSLFGTCRSLGEAICVRLLQGLFSGAIGVSRSAVKDITDSTNEARAYAILSFSWGAGSIFGPIIGGLFESPTVRYPFLFPEEKHKFFAKYPYALPCFVAASILVFGSTLTAFVSRDAGPLFTSIRLPEDANSFKKCAIDFIKRAFSGQVRYERPTSPLHDIRSHSRRTSTVFGNDNNDEALSQSQPNQRMSFAQRLLRAQEENVVSITDLWVQTALTREVERLNQEEEGDNVAIEEEHSGFASHYEDNEDENREENHDENRDFDNETTDFNNHSERDIEELSSSASIRPSPSIGFRNSFRDSAGLGFSRPSSIADRGDRLGEENLALLGSVPRNHLVDNKAARPKSILDNVGLTSQKSWVGLDDQFDDLEGANRRLRAIPEQNQPLITERKPVEMSVMIKIVLSQYAFLALHNTTFDQLFTTFLLTEYTSGGLSLTPSHFSSLIAMMAGFSMFYQFYLYGKIGPPNGNLSHLQMFRISSVIYILTYGLVPFARKLVRPESSSDVLVMTGLAILNAIRYAATTAAYTSITILINVMSPPEISGLTNSYGQSAVSLSRFLGPIFGGYLWKTFLATDIGGYKFTFWLVSGMAVVRSSTSSFTRRPTSNRPREPRQPPDGEKENQVKLSNLHYEINEEMLANIFNGFQLTKLVVKYDKSGRSTGEAVVAFEKSIDADRAIDMFDGKTAKDQEIRVEPYGYFTVDPPSRSGATGSSLLSRLGAKVHSDPPPSGPRSKQSSRPRKQTKPANIKSKPAPKDSDSLDKELDDFMKKPGSNNVNTQDTEMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.75
3 0.78
4 0.8
5 0.8
6 0.8
7 0.8
8 0.79
9 0.7
10 0.6
11 0.55
12 0.45
13 0.37
14 0.29
15 0.21
16 0.15
17 0.18
18 0.2
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.19
23 0.27
24 0.34
25 0.37
26 0.41
27 0.47
28 0.47
29 0.5
30 0.49
31 0.44
32 0.39
33 0.36
34 0.31
35 0.3
36 0.29
37 0.27
38 0.28
39 0.3
40 0.31
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.3
45 0.38
46 0.39
47 0.41
48 0.43
49 0.45
50 0.54
51 0.52
52 0.53
53 0.48
54 0.44
55 0.41
56 0.36
57 0.36
58 0.29
59 0.3
60 0.29
61 0.28
62 0.27
63 0.23
64 0.22
65 0.16
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.15
88 0.19
89 0.21
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.12
124 0.19
125 0.22
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.3
131 0.3
132 0.24
133 0.23
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.18
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.16
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.13
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.19
181 0.2
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.2
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.18
218 0.23
219 0.27
220 0.25
221 0.33
222 0.41
223 0.43
224 0.44
225 0.44
226 0.41
227 0.38
228 0.47
229 0.43
230 0.38
231 0.39
232 0.44
233 0.44
234 0.42
235 0.4
236 0.31
237 0.26
238 0.22
239 0.19
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.09
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.18
270 0.22
271 0.25
272 0.27
273 0.26
274 0.26
275 0.27
276 0.26
277 0.26
278 0.27
279 0.31
280 0.33
281 0.37
282 0.42
283 0.4
284 0.41
285 0.38
286 0.33
287 0.31
288 0.32
289 0.35
290 0.32
291 0.36
292 0.38
293 0.37
294 0.37
295 0.36
296 0.35
297 0.34
298 0.36
299 0.37
300 0.39
301 0.41
302 0.46
303 0.5
304 0.5
305 0.43
306 0.41
307 0.39
308 0.39
309 0.41
310 0.36
311 0.35
312 0.35
313 0.35
314 0.37
315 0.36
316 0.31
317 0.27
318 0.22
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.08
323 0.08
324 0.13
325 0.18
326 0.22
327 0.24
328 0.24
329 0.24
330 0.27
331 0.31
332 0.33
333 0.32
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.34
338 0.33
339 0.29
340 0.22
341 0.23
342 0.2
343 0.18
344 0.16
345 0.14
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.14
366 0.15
367 0.14
368 0.13
369 0.14
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.14
391 0.12
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.14
397 0.16
398 0.18
399 0.18
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.2
404 0.18
405 0.18
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.13
412 0.16
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.11
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.12
433 0.15
434 0.17
435 0.19
436 0.2
437 0.26
438 0.27
439 0.26
440 0.23
441 0.2
442 0.18
443 0.17
444 0.17
445 0.11
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.09
452 0.1
453 0.11
454 0.14
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.17
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.12
477 0.13
478 0.18
479 0.21
480 0.26
481 0.31
482 0.3
483 0.3
484 0.29
485 0.29
486 0.28
487 0.29
488 0.24
489 0.19
490 0.2
491 0.21
492 0.22
493 0.2
494 0.15
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.07
501 0.09
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.08
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.13
515 0.14
516 0.15
517 0.16
518 0.2
519 0.26
520 0.31
521 0.37
522 0.41
523 0.41
524 0.4
525 0.39
526 0.36
527 0.33
528 0.26
529 0.25
530 0.21
531 0.24
532 0.24
533 0.24
534 0.22
535 0.21
536 0.22
537 0.17
538 0.17
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.11
543 0.09
544 0.07
545 0.06
546 0.05
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.07
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.08
566 0.07
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.05
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.1
584 0.09
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.03
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.08
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.14
603 0.16
604 0.18
605 0.19
606 0.21
607 0.21
608 0.22
609 0.21
610 0.22
611 0.24
612 0.23
613 0.23
614 0.19
615 0.19
616 0.16
617 0.16
618 0.13
619 0.07
620 0.08
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.1
633 0.11
634 0.13
635 0.17
636 0.22
637 0.27
638 0.28
639 0.32
640 0.35
641 0.35
642 0.34
643 0.3
644 0.24
645 0.19
646 0.17
647 0.13
648 0.06
649 0.05
650 0.04
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.04
657 0.03
658 0.03
659 0.04
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.09
669 0.09
670 0.08
671 0.08
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.08
683 0.09
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.12
689 0.12
690 0.11
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.1
710 0.08
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.1
715 0.13
716 0.14
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.12
721 0.12
722 0.11
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.08
729 0.09
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.08
734 0.09
735 0.1
736 0.14
737 0.18
738 0.21
739 0.26
740 0.32
741 0.36
742 0.42
743 0.51
744 0.59
745 0.65
746 0.73
747 0.77
748 0.79
749 0.85
750 0.87
751 0.85
752 0.83
753 0.81
754 0.76
755 0.76
756 0.75
757 0.67
758 0.65
759 0.63
760 0.58
761 0.53
762 0.49
763 0.41
764 0.36
765 0.38
766 0.36
767 0.32
768 0.3
769 0.26
770 0.27
771 0.26
772 0.26
773 0.2
774 0.15
775 0.12
776 0.11
777 0.11
778 0.08
779 0.08
780 0.06
781 0.06
782 0.07
783 0.07
784 0.06
785 0.07
786 0.09
787 0.11
788 0.12
789 0.15
790 0.17
791 0.19
792 0.25
793 0.32
794 0.37
795 0.38
796 0.4
797 0.39
798 0.41
799 0.41
800 0.36
801 0.33
802 0.27
803 0.25
804 0.24
805 0.22
806 0.17
807 0.15
808 0.14
809 0.09
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.1
814 0.11
815 0.12
816 0.12
817 0.12
818 0.11
819 0.1
820 0.12
821 0.12
822 0.11
823 0.16
824 0.18
825 0.21
826 0.25
827 0.26
828 0.3
829 0.37
830 0.42
831 0.39
832 0.38
833 0.35
834 0.35
835 0.35
836 0.29
837 0.22
838 0.18
839 0.24
840 0.25
841 0.26
842 0.24
843 0.27
844 0.27
845 0.27
846 0.27
847 0.2
848 0.21
849 0.22
850 0.21
851 0.2
852 0.2
853 0.19
854 0.19
855 0.18
856 0.15
857 0.15
858 0.15
859 0.16
860 0.2
861 0.27
862 0.32
863 0.35
864 0.36
865 0.4
866 0.48
867 0.49
868 0.51
869 0.49
870 0.51
871 0.56
872 0.62
873 0.65
874 0.67
875 0.74
876 0.78
877 0.84
878 0.86
879 0.87
880 0.91
881 0.92
882 0.92
883 0.92
884 0.91
885 0.91
886 0.86
887 0.84
888 0.84
889 0.83
890 0.78
891 0.74
892 0.71
893 0.64
894 0.65
895 0.63
896 0.63
897 0.58
898 0.55
899 0.5
900 0.43
901 0.4
902 0.37
903 0.35
904 0.28
905 0.25
906 0.24
907 0.3
908 0.3
909 0.32
910 0.38
911 0.43
912 0.44
913 0.51
914 0.55
915 0.53
916 0.53