Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AN36

Protein Details
Accession R9AN36    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-71DADSRGGRRRSRSPRHRPTRAETSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-66RRSDKDERHWRAERDIRDGRSRRDVRDADSRGGRRRSRSPRHRPTR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, cyto 5, cyto_pero 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG wic:J056_003040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MLDYGDGGDGRRYGRNSRDDRRSDKDERHWRAERDIRDGRSRRDVRDADSRGGRRRSRSPRHRPTRAETSHHKVGGLDLRDGSAADRERMLKQIQSKEAEEERKRVEEEHRAIEEGERKAKDAEQRKPEDQEEEDDDEVDQDTLAMQQMMGFGGFDSTKGKKVSGNEEGAAKVHQPRTYRQYMNRVGGFNRALDKPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.43
3 0.5
4 0.58
5 0.66
6 0.69
7 0.73
8 0.75
9 0.75
10 0.73
11 0.72
12 0.74
13 0.74
14 0.74
15 0.76
16 0.75
17 0.69
18 0.72
19 0.71
20 0.64
21 0.62
22 0.62
23 0.57
24 0.61
25 0.63
26 0.58
27 0.61
28 0.61
29 0.56
30 0.58
31 0.55
32 0.5
33 0.55
34 0.54
35 0.48
36 0.52
37 0.54
38 0.52
39 0.58
40 0.57
41 0.52
42 0.59
43 0.64
44 0.68
45 0.74
46 0.77
47 0.8
48 0.87
49 0.9
50 0.86
51 0.83
52 0.83
53 0.77
54 0.72
55 0.68
56 0.65
57 0.62
58 0.56
59 0.49
60 0.38
61 0.35
62 0.34
63 0.28
64 0.21
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.2
80 0.25
81 0.28
82 0.29
83 0.28
84 0.29
85 0.33
86 0.38
87 0.34
88 0.32
89 0.3
90 0.29
91 0.29
92 0.27
93 0.27
94 0.27
95 0.29
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.28
100 0.28
101 0.3
102 0.24
103 0.26
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.3
109 0.33
110 0.39
111 0.42
112 0.48
113 0.5
114 0.53
115 0.52
116 0.49
117 0.41
118 0.37
119 0.33
120 0.3
121 0.27
122 0.24
123 0.22
124 0.18
125 0.17
126 0.13
127 0.08
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.09
144 0.11
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.2
149 0.25
150 0.33
151 0.36
152 0.38
153 0.35
154 0.36
155 0.36
156 0.33
157 0.3
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.26
162 0.27
163 0.34
164 0.41
165 0.49
166 0.54
167 0.55
168 0.61
169 0.66
170 0.71
171 0.68
172 0.63
173 0.56
174 0.55
175 0.49
176 0.41
177 0.38