Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AFT6

Protein Details
Accession R9AFT6    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-190HLAQRKEKSKAKRDKARQKQQRKAAERGBasic
225-245PAQPRGKKTRGEKRAAKKVREBasic
305-338LDAPKGPRGGKPQRGRPPRSPRGRGRGRGGKQAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-190RKEKSKAKRDKARQKQQRKAAERG
224-245TPAQPRGKKTRGEKRAAKKVRE
308-336PKGPRGGKPQRGRPPRSPRGRGRGRGGKQ
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto_nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG wic:J056_004849  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MNNAPTSDHKLRAVVRKLPPNLPEDVFYSAVQAWVNGETTAHSYYAKGKLRGADSSKESVASRAYITFNEHTQLLNFHAAFDGHTFRDKQGRESKVSVEYAPFQKTPAARHKVDDRQGTIDQDGDFLSFLQSLQATPTKPDFEANWIASRAAEKPKTTPLLLHLAQRKEKSKAKRDKARQKQQRKAAERGGSGTGAGVGGSSGNGSNAPPTKSPADPSSSASKTPAQPRGKKTRGEKRAAKKVREGISSPSTPKSTPGTPGTPSTPPIKILARPDAPDKPAVAPSAPPASVTNSNNNSHTQSPTLDAPKGPRGGKPQRGRPPRSPRGRGRGRGGKQAATPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.64
4 0.67
5 0.68
6 0.66
7 0.59
8 0.57
9 0.49
10 0.43
11 0.36
12 0.35
13 0.31
14 0.26
15 0.25
16 0.2
17 0.2
18 0.18
19 0.15
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.13
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.13
31 0.19
32 0.28
33 0.33
34 0.32
35 0.34
36 0.38
37 0.41
38 0.47
39 0.46
40 0.43
41 0.41
42 0.43
43 0.41
44 0.37
45 0.34
46 0.29
47 0.26
48 0.21
49 0.18
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.2
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.15
62 0.18
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.12
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.25
75 0.25
76 0.3
77 0.37
78 0.41
79 0.43
80 0.44
81 0.45
82 0.43
83 0.43
84 0.36
85 0.29
86 0.29
87 0.28
88 0.29
89 0.26
90 0.22
91 0.24
92 0.25
93 0.29
94 0.35
95 0.37
96 0.35
97 0.39
98 0.46
99 0.51
100 0.56
101 0.54
102 0.46
103 0.45
104 0.45
105 0.43
106 0.35
107 0.29
108 0.22
109 0.18
110 0.15
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.17
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.18
136 0.19
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.2
142 0.25
143 0.27
144 0.26
145 0.24
146 0.2
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.29
151 0.3
152 0.34
153 0.36
154 0.36
155 0.36
156 0.41
157 0.44
158 0.49
159 0.56
160 0.62
161 0.69
162 0.77
163 0.82
164 0.86
165 0.89
166 0.89
167 0.89
168 0.88
169 0.87
170 0.87
171 0.82
172 0.77
173 0.73
174 0.67
175 0.57
176 0.51
177 0.43
178 0.32
179 0.26
180 0.2
181 0.13
182 0.08
183 0.07
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.07
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.18
199 0.19
200 0.22
201 0.21
202 0.24
203 0.23
204 0.26
205 0.3
206 0.29
207 0.29
208 0.28
209 0.3
210 0.3
211 0.36
212 0.42
213 0.44
214 0.5
215 0.57
216 0.66
217 0.68
218 0.69
219 0.72
220 0.73
221 0.74
222 0.76
223 0.77
224 0.76
225 0.81
226 0.83
227 0.77
228 0.74
229 0.72
230 0.69
231 0.64
232 0.56
233 0.51
234 0.49
235 0.48
236 0.43
237 0.39
238 0.35
239 0.31
240 0.32
241 0.3
242 0.26
243 0.28
244 0.31
245 0.31
246 0.31
247 0.34
248 0.35
249 0.32
250 0.33
251 0.31
252 0.27
253 0.25
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.3
258 0.36
259 0.35
260 0.36
261 0.41
262 0.42
263 0.41
264 0.39
265 0.35
266 0.3
267 0.29
268 0.28
269 0.24
270 0.2
271 0.21
272 0.24
273 0.22
274 0.2
275 0.19
276 0.23
277 0.29
278 0.31
279 0.36
280 0.37
281 0.4
282 0.4
283 0.42
284 0.4
285 0.36
286 0.36
287 0.3
288 0.26
289 0.27
290 0.31
291 0.33
292 0.31
293 0.31
294 0.33
295 0.38
296 0.43
297 0.4
298 0.39
299 0.45
300 0.53
301 0.61
302 0.66
303 0.7
304 0.74
305 0.83
306 0.86
307 0.87
308 0.87
309 0.88
310 0.89
311 0.88
312 0.88
313 0.88
314 0.91
315 0.88
316 0.88
317 0.88
318 0.82
319 0.83
320 0.77
321 0.71