Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AA28

Protein Details
Accession R9AA28    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-185VAKGLLAKRRKKQPSTENAEAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-174KRRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG wic:J056_002634  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MYNIFFNKNENVRVEDGSLKLTDIIGSSSEDFKCSSDINQSVAKLCGEFNFIDISVSPRMLGGKGGFGAQLRSAGGKMRSNRNNNTDACRDLSGRRISTLKEAQKVAEYMESSEEREKKQKQEEKDKLEAMEKKYNQQPQKRRLDDDKYLEQNKDMNDNVRSSVAKGLLAKRRKKQPSTENAEAGSSRNPFPSKLAEESSQSVPASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.28
4 0.26
5 0.23
6 0.19
7 0.17
8 0.15
9 0.13
10 0.1
11 0.1
12 0.08
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.19
24 0.21
25 0.23
26 0.25
27 0.25
28 0.25
29 0.26
30 0.24
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.13
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.13
63 0.17
64 0.21
65 0.3
66 0.38
67 0.44
68 0.49
69 0.51
70 0.54
71 0.51
72 0.52
73 0.45
74 0.39
75 0.34
76 0.3
77 0.26
78 0.22
79 0.26
80 0.25
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.26
86 0.32
87 0.29
88 0.28
89 0.28
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.21
94 0.16
95 0.12
96 0.09
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.16
101 0.18
102 0.18
103 0.25
104 0.28
105 0.32
106 0.41
107 0.46
108 0.5
109 0.59
110 0.66
111 0.66
112 0.67
113 0.63
114 0.54
115 0.54
116 0.51
117 0.45
118 0.46
119 0.39
120 0.39
121 0.44
122 0.5
123 0.52
124 0.56
125 0.6
126 0.62
127 0.72
128 0.7
129 0.71
130 0.71
131 0.71
132 0.69
133 0.66
134 0.64
135 0.61
136 0.6
137 0.55
138 0.48
139 0.43
140 0.36
141 0.34
142 0.28
143 0.25
144 0.24
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.23
149 0.2
150 0.22
151 0.19
152 0.18
153 0.21
154 0.27
155 0.34
156 0.42
157 0.49
158 0.54
159 0.63
160 0.71
161 0.74
162 0.77
163 0.78
164 0.8
165 0.82
166 0.81
167 0.73
168 0.65
169 0.6
170 0.5
171 0.41
172 0.35
173 0.28
174 0.22
175 0.25
176 0.25
177 0.24
178 0.27
179 0.32
180 0.33
181 0.35
182 0.38
183 0.35
184 0.38
185 0.41
186 0.41
187 0.37