Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AVC9

Protein Details
Accession R9AVC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1241-1267ENSSKTPSTSNKTKTKNQKKKNKKGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1252-1267KTKTKNQKKKNKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 10.166, cyto 6, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG wic:J056_002139  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MVSASIPSSPVSTRQSLDSGAESLTLSRASTRGDVPLSWSLDRYRSSPTISTHSTGFNALSTVMNHPNKRPKALRASRYPLPAIPSVDFRLPSSSAVDTYLHDIQGEYDEFIDNVEKSSASTSAQPETELPTLEEVPRLFFKQDFDLGDPSTFDAVTKSIGDSVGLDNLDSPEDIGINEILHARLEHHANAVDKILVHELTERAPSLFSALDNLHHLGDYAKDAMDKFVDLKESLEEISNNKLQIKFDTINGIVKGQEVEDLLTVICDIENINHALLALQQMTELGHYFDALELVENISKTVVENIRSKDVDNVLKIESDTDFTSLSVFANVASDLHKHTNAILEYISKDLTELLFIDYIKSLKSSDHNHSDLSKDVEQSICVLDRADMLRSSLQSYENKLLRHVLQFFFELLPADIQSKPLDLEVNFNGSLYASQFAKELRQMQQIEYCRYLNKCREHLHIINSSIVGQKEVLEGISQNETITTKLSSLSGQIMELLYSELASLIRLRKDIEAELPLSEYLQFDHVVWKLISETEIDGSSSNSALFLLPAAASNQLQEFLELFHANYTTQSAKLVEMEVWSQAEVTPLVQKVINTIVRSAVEDIPELLQTTPIITEGDENHENQINVEGLKFYTVEALNKVLVLLIDYLRIMLQVPNSATEIMTRMIEVLKQFNSRTCQVVLGAGAMKSAGLKNITAKHLALASQSLSVMISLIPYIREAVRRQLKSNQATLLIEFDRLRRDYQEHQYEIHAKLVSILGDRLTAHSKSLAATKFEKTKEEDIKKPNSYAEGLVKETATLHRVLNKYLPEATVKFVFKQVFDAINKRIGDYYQRLTVKTELGKEKLLTDAHFLCNRLNALQGTDELGSSLISVAESRQVSKTPTESPRPSIATENDTAERRSLSFDVQSRNTTELHRMTIGAVNQDIIPQIDEGTEQKRVTENQQADADKSLPEVPQEMLQSGSQEVKSSGDEDKANQNQETVDVQQWEGVDGLENKDLGLQENKVNCQSIIEEEVRHQEYQPDQPEKNHSEVMIQAQGDAQRENEQAVIDDGEKRQSTEKPTDNADKPPSSQHINQTEEEAGNKEHIEDKDLISGEKECDTYAIKPGETEESAAFTPSSAVKSEAEKFANEKLEDTAVDSETTEGKSDKHIDQEEHHRTEADGEKVDKNQDASHVNNEILPVAYLDEDHKSDSDVNAKKSDQVTEVGAKSDKQEKSEREGVEKTDTSESAQLQPKETAVENSSKTPSTSNKTKTKNQKKKNKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.3
4 0.31
5 0.27
6 0.23
7 0.2
8 0.19
9 0.16
10 0.15
11 0.14
12 0.12
13 0.1
14 0.11
15 0.12
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.27
23 0.33
24 0.34
25 0.32
26 0.32
27 0.3
28 0.33
29 0.35
30 0.31
31 0.32
32 0.31
33 0.35
34 0.38
35 0.39
36 0.42
37 0.44
38 0.44
39 0.38
40 0.38
41 0.34
42 0.31
43 0.27
44 0.2
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.18
50 0.26
51 0.32
52 0.35
53 0.42
54 0.52
55 0.55
56 0.63
57 0.64
58 0.64
59 0.68
60 0.75
61 0.76
62 0.76
63 0.79
64 0.76
65 0.75
66 0.69
67 0.6
68 0.55
69 0.5
70 0.44
71 0.38
72 0.36
73 0.34
74 0.35
75 0.33
76 0.29
77 0.29
78 0.26
79 0.26
80 0.24
81 0.22
82 0.19
83 0.21
84 0.2
85 0.17
86 0.22
87 0.22
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.14
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.17
109 0.19
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.22
114 0.26
115 0.26
116 0.22
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.21
121 0.23
122 0.18
123 0.2
124 0.22
125 0.23
126 0.22
127 0.22
128 0.24
129 0.25
130 0.3
131 0.29
132 0.29
133 0.3
134 0.3
135 0.29
136 0.26
137 0.23
138 0.19
139 0.16
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.13
172 0.16
173 0.16
174 0.17
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.21
179 0.18
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.13
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.17
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.19
226 0.21
227 0.2
228 0.23
229 0.24
230 0.23
231 0.25
232 0.3
233 0.26
234 0.25
235 0.29
236 0.27
237 0.29
238 0.29
239 0.27
240 0.2
241 0.19
242 0.18
243 0.13
244 0.13
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.13
289 0.15
290 0.18
291 0.24
292 0.27
293 0.33
294 0.33
295 0.34
296 0.32
297 0.35
298 0.35
299 0.31
300 0.3
301 0.25
302 0.25
303 0.24
304 0.21
305 0.16
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.11
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.19
328 0.18
329 0.18
330 0.16
331 0.14
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.15
352 0.2
353 0.27
354 0.33
355 0.34
356 0.35
357 0.36
358 0.36
359 0.32
360 0.32
361 0.27
362 0.21
363 0.21
364 0.2
365 0.19
366 0.18
367 0.17
368 0.12
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.17
382 0.18
383 0.22
384 0.28
385 0.29
386 0.29
387 0.28
388 0.3
389 0.29
390 0.31
391 0.3
392 0.24
393 0.22
394 0.23
395 0.23
396 0.2
397 0.18
398 0.14
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.12
410 0.1
411 0.14
412 0.13
413 0.17
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.12
418 0.12
419 0.09
420 0.1
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.13
427 0.17
428 0.19
429 0.26
430 0.27
431 0.27
432 0.34
433 0.36
434 0.37
435 0.35
436 0.32
437 0.28
438 0.3
439 0.35
440 0.36
441 0.38
442 0.41
443 0.42
444 0.47
445 0.51
446 0.52
447 0.5
448 0.47
449 0.42
450 0.37
451 0.33
452 0.29
453 0.24
454 0.2
455 0.15
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.06
492 0.08
493 0.1
494 0.1
495 0.12
496 0.12
497 0.14
498 0.15
499 0.15
500 0.15
501 0.14
502 0.14
503 0.13
504 0.12
505 0.11
506 0.1
507 0.08
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.1
513 0.1
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.09
580 0.13
581 0.15
582 0.14
583 0.14
584 0.14
585 0.14
586 0.15
587 0.16
588 0.12
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.07
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.06
604 0.06
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.14
611 0.13
612 0.13
613 0.09
614 0.08
615 0.08
616 0.07
617 0.05
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.04
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.09
658 0.1
659 0.12
660 0.13
661 0.15
662 0.19
663 0.19
664 0.21
665 0.19
666 0.18
667 0.16
668 0.16
669 0.13
670 0.1
671 0.1
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.09
682 0.13
683 0.15
684 0.16
685 0.15
686 0.15
687 0.15
688 0.15
689 0.12
690 0.09
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.03
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.05
705 0.06
706 0.09
707 0.1
708 0.19
709 0.28
710 0.29
711 0.32
712 0.38
713 0.46
714 0.46
715 0.48
716 0.4
717 0.34
718 0.32
719 0.29
720 0.25
721 0.17
722 0.16
723 0.13
724 0.13
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.16
729 0.19
730 0.24
731 0.33
732 0.39
733 0.36
734 0.36
735 0.38
736 0.41
737 0.38
738 0.34
739 0.26
740 0.18
741 0.18
742 0.18
743 0.15
744 0.11
745 0.11
746 0.07
747 0.08
748 0.08
749 0.09
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.11
754 0.12
755 0.12
756 0.17
757 0.17
758 0.17
759 0.19
760 0.23
761 0.28
762 0.29
763 0.31
764 0.3
765 0.36
766 0.42
767 0.46
768 0.5
769 0.5
770 0.57
771 0.56
772 0.53
773 0.46
774 0.39
775 0.34
776 0.29
777 0.27
778 0.22
779 0.21
780 0.2
781 0.19
782 0.17
783 0.16
784 0.15
785 0.12
786 0.11
787 0.1
788 0.16
789 0.17
790 0.18
791 0.21
792 0.21
793 0.22
794 0.21
795 0.22
796 0.18
797 0.19
798 0.2
799 0.21
800 0.2
801 0.19
802 0.23
803 0.23
804 0.2
805 0.22
806 0.22
807 0.22
808 0.23
809 0.26
810 0.24
811 0.29
812 0.29
813 0.26
814 0.24
815 0.2
816 0.24
817 0.24
818 0.25
819 0.26
820 0.27
821 0.27
822 0.29
823 0.3
824 0.29
825 0.28
826 0.31
827 0.28
828 0.29
829 0.3
830 0.28
831 0.27
832 0.26
833 0.25
834 0.19
835 0.19
836 0.2
837 0.21
838 0.23
839 0.23
840 0.2
841 0.21
842 0.21
843 0.17
844 0.17
845 0.14
846 0.13
847 0.13
848 0.12
849 0.12
850 0.11
851 0.11
852 0.08
853 0.08
854 0.07
855 0.06
856 0.06
857 0.04
858 0.04
859 0.04
860 0.04
861 0.09
862 0.09
863 0.11
864 0.12
865 0.14
866 0.16
867 0.18
868 0.21
869 0.23
870 0.3
871 0.37
872 0.38
873 0.41
874 0.45
875 0.45
876 0.43
877 0.4
878 0.37
879 0.33
880 0.32
881 0.3
882 0.28
883 0.27
884 0.26
885 0.22
886 0.21
887 0.17
888 0.18
889 0.16
890 0.15
891 0.19
892 0.22
893 0.27
894 0.29
895 0.31
896 0.29
897 0.3
898 0.29
899 0.26
900 0.28
901 0.24
902 0.23
903 0.22
904 0.2
905 0.2
906 0.22
907 0.21
908 0.17
909 0.15
910 0.13
911 0.12
912 0.12
913 0.11
914 0.08
915 0.08
916 0.07
917 0.07
918 0.06
919 0.07
920 0.09
921 0.11
922 0.15
923 0.15
924 0.16
925 0.18
926 0.2
927 0.24
928 0.31
929 0.3
930 0.3
931 0.36
932 0.36
933 0.34
934 0.34
935 0.3
936 0.22
937 0.21
938 0.18
939 0.13
940 0.13
941 0.13
942 0.12
943 0.15
944 0.15
945 0.14
946 0.14
947 0.14
948 0.14
949 0.14
950 0.16
951 0.12
952 0.13
953 0.13
954 0.13
955 0.13
956 0.14
957 0.15
958 0.16
959 0.16
960 0.18
961 0.26
962 0.29
963 0.32
964 0.3
965 0.29
966 0.25
967 0.27
968 0.27
969 0.2
970 0.18
971 0.16
972 0.16
973 0.17
974 0.17
975 0.15
976 0.13
977 0.1
978 0.1
979 0.1
980 0.13
981 0.12
982 0.12
983 0.11
984 0.13
985 0.13
986 0.13
987 0.15
988 0.15
989 0.19
990 0.22
991 0.25
992 0.25
993 0.26
994 0.23
995 0.21
996 0.21
997 0.18
998 0.19
999 0.19
1000 0.18
1001 0.18
1002 0.25
1003 0.26
1004 0.25
1005 0.23
1006 0.23
1007 0.25
1008 0.33
1009 0.39
1010 0.4
1011 0.39
1012 0.42
1013 0.5
1014 0.5
1015 0.5
1016 0.43
1017 0.35
1018 0.3
1019 0.3
1020 0.31
1021 0.26
1022 0.22
1023 0.18
1024 0.18
1025 0.2
1026 0.2
1027 0.19
1028 0.16
1029 0.16
1030 0.17
1031 0.17
1032 0.16
1033 0.14
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.14
1037 0.11
1038 0.14
1039 0.14
1040 0.19
1041 0.19
1042 0.19
1043 0.22
1044 0.25
1045 0.31
1046 0.37
1047 0.42
1048 0.4
1049 0.47
1050 0.54
1051 0.53
1052 0.56
1053 0.57
1054 0.5
1055 0.45
1056 0.48
1057 0.46
1058 0.44
1059 0.45
1060 0.47
1061 0.48
1062 0.5
1063 0.49
1064 0.46
1065 0.44
1066 0.38
1067 0.35
1068 0.28
1069 0.21
1070 0.18
1071 0.18
1072 0.16
1073 0.19
1074 0.19
1075 0.22
1076 0.21
1077 0.22
1078 0.26
1079 0.26
1080 0.25
1081 0.21
1082 0.22
1083 0.2
1084 0.2
1085 0.19
1086 0.13
1087 0.14
1088 0.17
1089 0.17
1090 0.22
1091 0.23
1092 0.21
1093 0.21
1094 0.23
1095 0.26
1096 0.24
1097 0.25
1098 0.18
1099 0.18
1100 0.18
1101 0.19
1102 0.17
1103 0.12
1104 0.13
1105 0.12
1106 0.14
1107 0.12
1108 0.14
1109 0.14
1110 0.19
1111 0.23
1112 0.28
1113 0.28
1114 0.28
1115 0.29
1116 0.33
1117 0.38
1118 0.34
1119 0.31
1120 0.27
1121 0.27
1122 0.26
1123 0.26
1124 0.23
1125 0.17
1126 0.17
1127 0.16
1128 0.15
1129 0.15
1130 0.16
1131 0.15
1132 0.13
1133 0.13
1134 0.18
1135 0.23
1136 0.24
1137 0.3
1138 0.34
1139 0.35
1140 0.41
1141 0.51
1142 0.54
1143 0.53
1144 0.51
1145 0.44
1146 0.4
1147 0.44
1148 0.43
1149 0.37
1150 0.32
1151 0.32
1152 0.34
1153 0.37
1154 0.4
1155 0.35
1156 0.31
1157 0.28
1158 0.3
1159 0.31
1160 0.3
1161 0.33
1162 0.33
1163 0.31
1164 0.29
1165 0.28
1166 0.23
1167 0.19
1168 0.16
1169 0.11
1170 0.09
1171 0.09
1172 0.09
1173 0.1
1174 0.13
1175 0.13
1176 0.15
1177 0.15
1178 0.16
1179 0.18
1180 0.2
1181 0.27
1182 0.3
1183 0.33
1184 0.36
1185 0.37
1186 0.4
1187 0.41
1188 0.42
1189 0.34
1190 0.31
1191 0.31
1192 0.33
1193 0.33
1194 0.31
1195 0.3
1196 0.28
1197 0.3
1198 0.36
1199 0.34
1200 0.33
1201 0.41
1202 0.42
1203 0.49
1204 0.56
1205 0.54
1206 0.52
1207 0.53
1208 0.51
1209 0.5
1210 0.47
1211 0.42
1212 0.38
1213 0.36
1214 0.33
1215 0.34
1216 0.32
1217 0.33
1218 0.39
1219 0.38
1220 0.36
1221 0.37
1222 0.35
1223 0.34
1224 0.33
1225 0.3
1226 0.26
1227 0.31
1228 0.3
1229 0.34
1230 0.36
1231 0.34
1232 0.34
1233 0.34
1234 0.39
1235 0.4
1236 0.48
1237 0.52
1238 0.58
1239 0.65
1240 0.74
1241 0.8
1242 0.84
1243 0.86
1244 0.87
1245 0.89
1246 0.91
1247 0.95