Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RGA5

Protein Details
Accession F4RGA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-87TPPVPSTTTEKPPRKRNKTKGKNKRNKRKRGDNGSGSENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-79KPPRKRNKTKGKNKRNKRKRG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.833, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
KEGG mlr:MELLADRAFT_84610  -  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MPIAGYPIHPTGLDLVANLERLADSQAHGLHTPSHTQNTGTQRIESDGTPPVPSTTTEKPPRKRNKTKGKNKRNKRKRGDNGSGSENEDDQPTFDPAQLKDSDKTALQLRYLAEKHATAGMSDELIESLLDFHEEIQTMIAIKALELGTTVSAIEGVFRYMFSGKYIGVCRPSRWNRFLQSVQARAIFKLARGVGSGQGMRELSRVWRSMTEAEKDVYKEATQETDTANLQAMDQDLAELEIGPRSRDQILQSRSNTLINPRSLKLYKDNAEKYLDEIMAKCIPITRSNHFEIVVVAVSNHISTHSFQFTRSTLGVKKVVEEIYAIDGVNNFATEVQAHLVGQRPSELGVMGKSENGRAYQSRVTASLSTFLRITADIQLYLEDITGLRHWPWSKCDLTLREAGYKLELLPGAQSVEATFKQNSRHLNRAKLLAIESDLKDHLIQLVKTNEVTPAQNTNANTTNQPSPIDRTNTNTTDGEITSNLDPIFLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.13
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.16
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.21
18 0.22
19 0.27
20 0.27
21 0.3
22 0.29
23 0.3
24 0.37
25 0.41
26 0.47
27 0.43
28 0.4
29 0.36
30 0.39
31 0.39
32 0.32
33 0.27
34 0.25
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.2
40 0.22
41 0.25
42 0.25
43 0.34
44 0.43
45 0.53
46 0.6
47 0.7
48 0.79
49 0.84
50 0.88
51 0.89
52 0.91
53 0.92
54 0.95
55 0.96
56 0.96
57 0.96
58 0.96
59 0.97
60 0.96
61 0.96
62 0.95
63 0.95
64 0.94
65 0.94
66 0.93
67 0.91
68 0.85
69 0.8
70 0.71
71 0.63
72 0.53
73 0.43
74 0.33
75 0.26
76 0.21
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.2
83 0.19
84 0.23
85 0.26
86 0.27
87 0.25
88 0.26
89 0.26
90 0.22
91 0.24
92 0.26
93 0.25
94 0.22
95 0.24
96 0.23
97 0.28
98 0.29
99 0.28
100 0.24
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.14
106 0.15
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.13
153 0.15
154 0.16
155 0.22
156 0.23
157 0.24
158 0.33
159 0.42
160 0.46
161 0.48
162 0.52
163 0.49
164 0.54
165 0.54
166 0.52
167 0.5
168 0.46
169 0.43
170 0.42
171 0.38
172 0.32
173 0.33
174 0.24
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.1
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.13
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.21
197 0.24
198 0.23
199 0.21
200 0.2
201 0.21
202 0.21
203 0.19
204 0.16
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.13
236 0.2
237 0.24
238 0.3
239 0.31
240 0.32
241 0.32
242 0.32
243 0.29
244 0.26
245 0.26
246 0.23
247 0.25
248 0.23
249 0.27
250 0.27
251 0.29
252 0.3
253 0.31
254 0.34
255 0.39
256 0.4
257 0.38
258 0.39
259 0.37
260 0.33
261 0.29
262 0.24
263 0.17
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.17
272 0.2
273 0.21
274 0.25
275 0.27
276 0.29
277 0.27
278 0.26
279 0.21
280 0.18
281 0.15
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.07
291 0.1
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.18
301 0.23
302 0.26
303 0.23
304 0.24
305 0.23
306 0.23
307 0.2
308 0.18
309 0.14
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.05
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.16
345 0.15
346 0.19
347 0.21
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.24
352 0.22
353 0.21
354 0.23
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.14
377 0.17
378 0.2
379 0.24
380 0.29
381 0.3
382 0.32
383 0.4
384 0.38
385 0.39
386 0.42
387 0.41
388 0.39
389 0.38
390 0.35
391 0.28
392 0.26
393 0.22
394 0.19
395 0.16
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.08
403 0.12
404 0.13
405 0.16
406 0.17
407 0.19
408 0.24
409 0.29
410 0.38
411 0.4
412 0.49
413 0.52
414 0.59
415 0.6
416 0.6
417 0.58
418 0.51
419 0.45
420 0.37
421 0.34
422 0.31
423 0.27
424 0.25
425 0.23
426 0.22
427 0.2
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.23
433 0.26
434 0.27
435 0.27
436 0.28
437 0.26
438 0.24
439 0.25
440 0.22
441 0.24
442 0.25
443 0.29
444 0.29
445 0.31
446 0.34
447 0.34
448 0.33
449 0.32
450 0.34
451 0.32
452 0.34
453 0.31
454 0.33
455 0.38
456 0.41
457 0.39
458 0.42
459 0.48
460 0.47
461 0.49
462 0.43
463 0.38
464 0.36
465 0.34
466 0.29
467 0.21
468 0.22
469 0.19
470 0.21
471 0.19