Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AEM6

Protein Details
Accession R9AEM6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30LNLKKKLPKPVASENHHPKRKRBasic
259-283AKKGGKKGSSGKKSNNGGKKKNTVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-30KKLPKPVASENHHPKRKR
259-279AKKGGKKGSSGKKSNNGGKKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 10.666, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG wic:J056_000437  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MSQASSNWLNLKKKLPKPVASENHHPKRKRSGSISSSSNTEKKTRMSNYDNDAHDTQDIQTTHTTLAKPTPSILPTQVSGIKAEIGKYLAMDCEMVGVGRDGEESVLARVSIVNYHGAVIYDTFVRPVEKVTDFRTWVSGVTFKDVEKAPTFSHVQKHVSDLLHNRILVGHAIANDLKALLLTHPPLSIRDTAKYEQLHSIAKTKRPKLKALAKLVLGIDIQENEHSSVIDAQATMEVYKRYQSLWEATLARQAKIFQAKKGGKKGSSGKKSNNGGKKKNTVDVNSSSTPTPASAGDWWNQSAMTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.7
3 0.7
4 0.73
5 0.79
6 0.79
7 0.76
8 0.8
9 0.8
10 0.82
11 0.82
12 0.78
13 0.74
14 0.75
15 0.76
16 0.74
17 0.71
18 0.71
19 0.69
20 0.73
21 0.72
22 0.62
23 0.58
24 0.54
25 0.51
26 0.44
27 0.41
28 0.38
29 0.36
30 0.44
31 0.45
32 0.48
33 0.5
34 0.53
35 0.56
36 0.6
37 0.57
38 0.54
39 0.48
40 0.41
41 0.36
42 0.3
43 0.24
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.21
51 0.2
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.24
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.21
62 0.19
63 0.22
64 0.23
65 0.19
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.18
119 0.22
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.13
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.15
135 0.17
136 0.14
137 0.16
138 0.19
139 0.18
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.23
147 0.24
148 0.23
149 0.24
150 0.24
151 0.23
152 0.21
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.12
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.16
176 0.16
177 0.18
178 0.21
179 0.22
180 0.27
181 0.27
182 0.27
183 0.25
184 0.26
185 0.25
186 0.22
187 0.29
188 0.28
189 0.34
190 0.41
191 0.46
192 0.52
193 0.53
194 0.58
195 0.59
196 0.65
197 0.67
198 0.67
199 0.64
200 0.56
201 0.55
202 0.49
203 0.41
204 0.31
205 0.22
206 0.14
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.17
231 0.19
232 0.19
233 0.24
234 0.24
235 0.24
236 0.31
237 0.3
238 0.27
239 0.25
240 0.24
241 0.25
242 0.34
243 0.36
244 0.31
245 0.4
246 0.47
247 0.54
248 0.62
249 0.63
250 0.55
251 0.61
252 0.67
253 0.68
254 0.71
255 0.7
256 0.69
257 0.72
258 0.79
259 0.8
260 0.8
261 0.79
262 0.78
263 0.79
264 0.8
265 0.76
266 0.75
267 0.72
268 0.67
269 0.64
270 0.61
271 0.59
272 0.52
273 0.49
274 0.42
275 0.35
276 0.31
277 0.25
278 0.21
279 0.14
280 0.15
281 0.17
282 0.2
283 0.23
284 0.25
285 0.25
286 0.24
287 0.24