FuNGI

R9ARS4

Protein Details

Accession

R9ARS4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1070-1089	LPIVQPYRKAKKKQIATLLQ	Hydrophilic
1201-1225	NPKLNSVLPTKKKGRKSAKESEEME	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1211-1217	KKKGRKS

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito_nucl 13, mito 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	wic:J056_000290 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLSRSAPGRSLRRLRGVSALQHTPKLLKIQSKLQSTQPHHSTDLIYNYNKRTLLPTPRPNDDINDQHSSIYPTSDNQELFAILEACLSSPFLLDRAQGVFQNLRDKQIRNYADNNYSTLDVTIYNKFIERYFQEADNSRNDKFIGEAFKLWNALCGDKEGVKWELETWTLMLKGMARHLESTYSSKPLLDAVKDLPGKPSLRDVIVKYDHFTSLSESFAAVAVLTRAAATAGNVPLIEELAEIHSELERSLNGHSEDNMEPDNQDTPTPTQEEQDIMGVKSPSTSETPYNLYSLRQSLKPLGHTSKTLAADPAARQRLLEESAYETAKARFEHEMNELEKAGVATALSGQPLQKLMWEWWKKLSVLIGEKLDRNMHLETHKTKEDKFINEISPFLSLLSSEKMALITVLEILRLSGTGGIAEGMKTTRALLSVGKAVENEHHAEILKSKHGVSLKGVEADAKQVKRKLRYFDHKKAEKELDLKSPEFTGLIDEAMGTSTPDEHFAYPHDIASERALARVHEERMNRAWTPNWSQMIRIKVGSFLVDSLMECATITRIADRDGEEIKETQPAFSQSYQYVRGRKLGVIKVNTVVADRLDKDPLGSTIHPRHLPMLVKPKPWLRYDNGGYLFHKNFAMRFKDSNEQQSYIAKASNEGTMEPVLAGLDVLGQTPWNVNQKVFAVVKQAWNSGEGVAKIPPATTHTPDPIKPSNYESDPKQRSNYLISMKAVVNERRNNHSIRCDTNYKLEIAKAFLNETFYFPHTLDFRGRAYPIPPHLNHIGDDLSRGLLKFAETRPLGEKGMRWLKIHLANVYGYDKASFNERENFADEHLADIYDSADRPLDGRGWWLKADDPWQCLAACYEIQAALESSNPLAYESSLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDPMGAKQVNLEQADRPSDVYTAVADLVIADIRRDAQTDDNAFAKLLEGKITRKVVKQTVMTTVYGVTFIGARDQIDKQLQDRGDIPRELIYSTASYLAKKVLRSIGDLFSGANAIQKWLSMSARYVSKSIPPERLVKALEPAEGRSASGKSTASRTSKEQMTSVIWTTPLGLPIVQPYRKAKKKQIATLLQSVYLADPNLPTEVNPIKQASAFPPNFIHSLDATHMILTALQCCQIGITYASVHDSYWTHASTVDHMSEIIRDTFVKLHCEEILKRLRDEVVERYKGYRIPMSSLGAKIDKENPKLNSVLPTKKKGRKSAKESEEMESENEMENESESDNENDHSASISKEDLEAIELIKSKQNTDIDQLSQDEQLSDFIKSKYIKLEDALPDLPSKGPFDVRGVVNSPYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.63
3	0.61
4	0.59
5	0.56
6	0.58
7	0.51
8	0.51
9	0.5
10	0.44
11	0.42
12	0.41
13	0.4
14	0.39
15	0.4
16	0.48
17	0.54
18	0.59
19	0.59
20	0.6
21	0.64
22	0.63
23	0.68
24	0.64
25	0.6
26	0.55
27	0.54
28	0.49
29	0.45
30	0.45
31	0.42
32	0.42
33	0.44
34	0.46
35	0.49
36	0.45
37	0.41
38	0.39
39	0.41
40	0.47
41	0.51
42	0.57
43	0.59
44	0.64
45	0.67
46	0.63
47	0.61
48	0.57
49	0.54
50	0.51
51	0.5
52	0.45
53	0.42
54	0.42
55	0.4
56	0.33
57	0.28
58	0.24
59	0.19
60	0.22
61	0.26
62	0.25
63	0.21
64	0.22
65	0.19
66	0.18
67	0.18
68	0.16
69	0.1
70	0.11
71	0.1
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.07
76	0.07
77	0.08
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.12
82	0.15
83	0.16
84	0.17
85	0.21
86	0.23
87	0.25
88	0.34
89	0.33
90	0.37
91	0.4
92	0.41
93	0.44
94	0.5
95	0.52
96	0.48
97	0.53
98	0.53
99	0.55
100	0.54
101	0.5
102	0.42
103	0.37
104	0.32
105	0.27
106	0.2
107	0.15
108	0.16
109	0.17
110	0.17
111	0.17
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.23
116	0.23
117	0.26
118	0.28
119	0.29
120	0.34
121	0.37
122	0.4
123	0.43
124	0.44
125	0.38
126	0.36
127	0.34
128	0.29
129	0.27
130	0.28
131	0.24
132	0.23
133	0.25
134	0.25
135	0.27
136	0.28
137	0.26
138	0.27
139	0.22
140	0.22
141	0.2
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.22
146	0.21
147	0.22
148	0.2
149	0.2
150	0.19
151	0.18
152	0.17
153	0.17
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.17
162	0.2
163	0.19
164	0.21
165	0.21
166	0.23
167	0.24
168	0.28
169	0.27
170	0.27
171	0.26
172	0.24
173	0.24
174	0.25
175	0.26
176	0.21
177	0.22
178	0.2
179	0.28
180	0.3
181	0.3
182	0.28
183	0.3
184	0.3
185	0.28
186	0.33
187	0.28
188	0.29
189	0.33
190	0.32
191	0.35
192	0.4
193	0.39
194	0.35
195	0.34
196	0.32
197	0.28
198	0.27
199	0.23
200	0.19
201	0.19
202	0.16
203	0.14
204	0.13
205	0.13
206	0.12
207	0.07
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.09
238	0.13
239	0.14
240	0.15
241	0.16
242	0.19
243	0.19
244	0.21
245	0.21
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.17
250	0.14
251	0.13
252	0.14
253	0.15
254	0.18
255	0.21
256	0.2
257	0.2
258	0.2
259	0.21
260	0.19
261	0.2
262	0.18
263	0.15
264	0.18
265	0.17
266	0.15
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.14
271	0.17
272	0.16
273	0.19
274	0.23
275	0.23
276	0.25
277	0.23
278	0.22
279	0.22
280	0.24
281	0.25
282	0.22
283	0.24
284	0.28
285	0.3
286	0.33
287	0.38
288	0.38
289	0.37
290	0.37
291	0.37
292	0.38
293	0.37
294	0.33
295	0.27
296	0.22
297	0.24
298	0.25
299	0.31
300	0.27
301	0.26
302	0.25
303	0.25
304	0.27
305	0.26
306	0.24
307	0.16
308	0.16
309	0.19
310	0.2
311	0.19
312	0.17
313	0.17
314	0.19
315	0.18
316	0.17
317	0.19
318	0.19
319	0.22
320	0.24
321	0.28
322	0.25
323	0.27
324	0.24
325	0.2
326	0.2
327	0.16
328	0.13
329	0.08
330	0.06
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.11
342	0.14
343	0.23
344	0.27
345	0.28
346	0.32
347	0.35
348	0.33
349	0.33
350	0.33
351	0.28
352	0.28
353	0.3
354	0.29
355	0.28
356	0.29
357	0.3
358	0.28
359	0.23
360	0.22
361	0.19
362	0.18
363	0.19
364	0.23
365	0.25
366	0.29
367	0.34
368	0.33
369	0.33
370	0.39
371	0.42
372	0.4
373	0.41
374	0.4
375	0.39
376	0.38
377	0.37
378	0.29
379	0.24
380	0.2
381	0.16
382	0.11
383	0.07
384	0.08
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.13
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.15
426	0.15
427	0.12
428	0.13
429	0.12
430	0.13
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.14
435	0.14
436	0.17
437	0.19
438	0.2
439	0.19
440	0.22
441	0.21
442	0.21
443	0.21
444	0.18
445	0.17
446	0.21
447	0.24
448	0.22
449	0.24
450	0.28
451	0.33
452	0.4
453	0.45
454	0.47
455	0.51
456	0.61
457	0.66
458	0.72
459	0.77
460	0.76
461	0.73
462	0.72
463	0.66
464	0.59
465	0.54
466	0.47
467	0.44
468	0.41
469	0.39
470	0.33
471	0.29
472	0.25
473	0.2
474	0.17
475	0.11
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.04
484	0.03
485	0.04
486	0.05
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.11
492	0.15
493	0.15
494	0.15
495	0.13
496	0.13
497	0.13
498	0.14
499	0.16
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.12
504	0.15
505	0.18
506	0.19
507	0.2
508	0.2
509	0.22
510	0.26
511	0.29
512	0.26
513	0.24
514	0.23
515	0.23
516	0.29
517	0.31
518	0.31
519	0.28
520	0.3
521	0.32
522	0.34
523	0.31
524	0.26
525	0.2
526	0.18
527	0.18
528	0.16
529	0.12
530	0.09
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.09
546	0.1
547	0.12
548	0.13
549	0.13
550	0.14
551	0.14
552	0.13
553	0.16
554	0.15
555	0.13
556	0.13
557	0.15
558	0.16
559	0.16
560	0.18
561	0.15
562	0.18
563	0.22
564	0.24
565	0.26
566	0.25
567	0.28
568	0.27
569	0.28
570	0.31
571	0.31
572	0.33
573	0.31
574	0.3
575	0.28
576	0.27
577	0.25
578	0.19
579	0.15
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.11
588	0.11
589	0.12
590	0.11
591	0.15
592	0.19
593	0.23
594	0.24
595	0.23
596	0.23
597	0.24
598	0.24
599	0.24
600	0.3
601	0.3
602	0.31
603	0.34
604	0.38
605	0.39
606	0.4
607	0.39
608	0.32
609	0.36
610	0.37
611	0.4
612	0.38
613	0.36
614	0.35
615	0.35
616	0.32
617	0.25
618	0.23
619	0.17
620	0.16
621	0.19
622	0.22
623	0.2
624	0.21
625	0.23
626	0.28
627	0.3
628	0.36
629	0.33
630	0.3
631	0.29
632	0.29
633	0.27
634	0.22
635	0.21
636	0.13
637	0.12
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.08
644	0.08
645	0.07
646	0.06
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.02
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.04
658	0.06
659	0.11
660	0.12
661	0.12
662	0.13
663	0.14
664	0.18
665	0.18
666	0.17
667	0.16
668	0.17
669	0.2
670	0.2
671	0.2
672	0.16
673	0.16
674	0.16
675	0.13
676	0.13
677	0.1
678	0.1
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.07
684	0.1
685	0.12
686	0.14
687	0.15
688	0.19
689	0.22
690	0.23
691	0.28
692	0.29
693	0.28
694	0.27
695	0.28
696	0.28
697	0.29
698	0.31
699	0.28
700	0.34
701	0.37
702	0.38
703	0.37
704	0.34
705	0.33
706	0.34
707	0.35
708	0.29
709	0.26
710	0.25
711	0.26
712	0.24
713	0.25
714	0.26
715	0.25
716	0.28
717	0.3
718	0.32
719	0.35
720	0.37
721	0.37
722	0.36
723	0.38
724	0.36
725	0.35
726	0.37
727	0.36
728	0.34
729	0.38
730	0.36
731	0.3
732	0.27
733	0.24
734	0.2
735	0.18
736	0.18
737	0.13
738	0.13
739	0.12
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.14
744	0.14
745	0.15
746	0.14
747	0.15
748	0.13
749	0.15
750	0.15
751	0.16
752	0.16
753	0.16
754	0.17
755	0.16
756	0.17
757	0.19
758	0.22
759	0.27
760	0.26
761	0.28
762	0.3
763	0.3
764	0.28
765	0.26
766	0.22
767	0.15
768	0.16
769	0.12
770	0.09
771	0.09
772	0.08
773	0.07
774	0.06
775	0.07
776	0.1
777	0.1
778	0.17
779	0.16
780	0.18
781	0.21
782	0.23
783	0.23
784	0.21
785	0.21
786	0.22
787	0.3
788	0.31
789	0.28
790	0.27
791	0.32
792	0.36
793	0.37
794	0.3
795	0.24
796	0.22
797	0.23
798	0.23
799	0.18
800	0.13
801	0.12
802	0.11
803	0.09
804	0.14
805	0.14
806	0.15
807	0.21
808	0.22
809	0.23
810	0.26
811	0.26
812	0.22
813	0.23
814	0.2
815	0.15
816	0.14
817	0.12
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.07
828	0.08
829	0.07
830	0.12
831	0.14
832	0.15
833	0.16
834	0.16
835	0.16
836	0.17
837	0.23
838	0.22
839	0.21
840	0.21
841	0.21
842	0.21
843	0.2
844	0.19
845	0.15
846	0.11
847	0.1
848	0.09
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.08
853	0.06
854	0.07
855	0.06
856	0.06
857	0.06
858	0.06
859	0.06
860	0.06
861	0.07
862	0.08
863	0.08
864	0.1
865	0.1
866	0.11
867	0.11
868	0.12
869	0.11
870	0.11
871	0.11
872	0.14
873	0.15
874	0.15
875	0.14
876	0.14
877	0.14
878	0.12
879	0.12
880	0.08
881	0.07
882	0.06
883	0.06
884	0.05
885	0.06
886	0.05
887	0.05
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.07
892	0.09
893	0.13
894	0.15
895	0.16
896	0.16
897	0.19
898	0.21
899	0.21
900	0.2
901	0.15
902	0.15
903	0.14
904	0.12
905	0.1
906	0.08
907	0.08
908	0.06
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.04
915	0.05
916	0.06
917	0.07
918	0.08
919	0.09
920	0.11
921	0.17
922	0.19
923	0.2
924	0.2
925	0.2
926	0.19
927	0.17
928	0.15
929	0.12
930	0.11
931	0.13
932	0.14
933	0.16
934	0.22
935	0.27
936	0.29
937	0.31
938	0.37
939	0.38
940	0.42
941	0.44
942	0.4
943	0.42
944	0.41
945	0.37
946	0.32
947	0.27
948	0.21
949	0.18
950	0.15
951	0.08
952	0.06
953	0.06
954	0.08
955	0.08
956	0.08
957	0.11
958	0.12
959	0.16
960	0.19
961	0.2
962	0.19
963	0.25
964	0.25
965	0.24
966	0.27
967	0.28
968	0.3
969	0.29
970	0.29
971	0.25
972	0.26
973	0.24
974	0.21
975	0.16
976	0.12
977	0.12
978	0.16
979	0.14
980	0.13
981	0.14
982	0.19
983	0.2
984	0.2
985	0.22
986	0.23
987	0.24
988	0.27
989	0.29
990	0.27
991	0.25
992	0.25
993	0.21
994	0.16
995	0.16
996	0.12
997	0.11
998	0.09
999	0.09
1000	0.09
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.16
1008	0.21
1009	0.22
1010	0.22
1011	0.2
1012	0.25
1013	0.32
1014	0.35
1015	0.37
1016	0.36
1017	0.41
1018	0.42
1019	0.45
1020	0.41
1021	0.35
1022	0.36
1023	0.31
1024	0.31
1025	0.27
1026	0.26
1027	0.25
1028	0.23
1029	0.22
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.15
1033	0.17
1034	0.16
1035	0.14
1036	0.19
1037	0.26
1038	0.27
1039	0.3
1040	0.34
1041	0.37
1042	0.41
1043	0.41
1044	0.38
1045	0.34
1046	0.33
1047	0.33
1048	0.3
1049	0.24
1050	0.2
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.17
1054	0.15
1055	0.13
1056	0.11
1057	0.1
1058	0.17
1059	0.25
1060	0.24
1061	0.27
1062	0.34
1063	0.44
1064	0.53
1065	0.6
1066	0.64
1067	0.66
1068	0.74
1069	0.78
1070	0.8
1071	0.79
1072	0.76
1073	0.76
1074	0.68
1075	0.58
1076	0.49
1077	0.41
1078	0.31
1079	0.23
1080	0.18
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.1
1084	0.11
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.15
1088	0.19
1089	0.2
1090	0.22
1091	0.22
1092	0.22
1093	0.23
1094	0.25
1095	0.24
1096	0.3
1097	0.29
1098	0.28
1099	0.29
1100	0.31
1101	0.31
1102	0.3
1103	0.27
1104	0.17
1105	0.19
1106	0.18
1107	0.19
1108	0.16
1109	0.15
1110	0.15
1111	0.12
1112	0.13
1113	0.12
1114	0.12
1115	0.09
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.08
1121	0.1
1122	0.09
1123	0.1
1124	0.1
1125	0.1
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.12
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.14
1132	0.17
1133	0.17
1134	0.15
1135	0.18
1136	0.19
1137	0.2
1138	0.23
1139	0.21
1140	0.18
1141	0.17
1142	0.17
1143	0.16
1144	0.18
1145	0.15
1146	0.12
1147	0.12
1148	0.13
1149	0.18
1150	0.2
1151	0.23
1152	0.21
1153	0.23
1154	0.24
1155	0.29
1156	0.29
1157	0.33
1158	0.4
1159	0.39
1160	0.38
1161	0.39
1162	0.38
1163	0.36
1164	0.38
1165	0.39
1166	0.4
1167	0.42
1168	0.43
1169	0.43
1170	0.44
1171	0.44
1172	0.44
1173	0.4
1174	0.32
1175	0.33
1176	0.35
1177	0.37
1178	0.37
1179	0.36
1180	0.36
1181	0.33
1182	0.32
1183	0.3
1184	0.35
1185	0.38
1186	0.4
1187	0.46
1188	0.45
1189	0.46
1190	0.47
1191	0.46
1192	0.45
1193	0.45
1194	0.5
1195	0.5
1196	0.57
1197	0.63
1198	0.7
1199	0.76
1200	0.78
1201	0.82
1202	0.82
1203	0.84
1204	0.86
1205	0.84
1206	0.85
1207	0.8
1208	0.74
1209	0.67
1210	0.57
1211	0.5
1212	0.41
1213	0.33
1214	0.26
1215	0.22
1216	0.18
1217	0.14
1218	0.13
1219	0.13
1220	0.12
1221	0.11
1222	0.12
1223	0.13
1224	0.14
1225	0.14
1226	0.14
1227	0.14
1228	0.13
1229	0.14
1230	0.13
1231	0.12
1232	0.12
1233	0.13
1234	0.12
1235	0.13
1236	0.13
1237	0.12
1238	0.13
1239	0.12
1240	0.11
1241	0.13
1242	0.15
1243	0.16
1244	0.21
1245	0.21
1246	0.21
1247	0.27
1248	0.3
1249	0.3
1250	0.34
1251	0.38
1252	0.35
1253	0.37
1254	0.39
1255	0.33
1256	0.31
1257	0.29
1258	0.23
1259	0.18
1260	0.19
1261	0.17
1262	0.16
1263	0.18
1264	0.17
1265	0.23
1266	0.24
1267	0.26
1268	0.32
1269	0.34
1270	0.35
1271	0.33
1272	0.41
1273	0.39
1274	0.43
1275	0.41
1276	0.34
1277	0.32
1278	0.31
1279	0.31
1280	0.24
1281	0.23
1282	0.2
1283	0.22
1284	0.23
1285	0.26
1286	0.31
1287	0.31
1288	0.33
1289	0.33
1290	0.34
1291	0.33

R9ARS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer