Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDF0

Protein Details
Accession R4XDF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-132VESRQPEERKIRKPRTSKKHPDLVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-126RKIRKPRTSKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MPPRQAKIKSEDDVNPDIPWKSRFPVARIKKIMQADEDVGKVAQVVPVIISKAVELFMASLIQEASRHASETGHKRVVPGHLRMAIKSNTMFDFLEQHVEKIPDPVHVESRQPEERKIRKPRTSKKHPDLVTETSDIKSEELHRVSSSNVIQPTKRIKLEETSSNPASRMMSIANMISPSTGSANS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.35
4 0.34
5 0.31
6 0.29
7 0.26
8 0.24
9 0.29
10 0.32
11 0.34
12 0.43
13 0.49
14 0.56
15 0.6
16 0.59
17 0.6
18 0.6
19 0.58
20 0.5
21 0.44
22 0.37
23 0.33
24 0.3
25 0.24
26 0.19
27 0.16
28 0.14
29 0.11
30 0.09
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.16
58 0.23
59 0.29
60 0.29
61 0.28
62 0.28
63 0.3
64 0.36
65 0.35
66 0.31
67 0.28
68 0.31
69 0.31
70 0.31
71 0.33
72 0.26
73 0.23
74 0.21
75 0.19
76 0.13
77 0.15
78 0.14
79 0.1
80 0.12
81 0.11
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.18
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.25
98 0.29
99 0.28
100 0.32
101 0.38
102 0.45
103 0.53
104 0.62
105 0.66
106 0.68
107 0.78
108 0.83
109 0.84
110 0.87
111 0.88
112 0.86
113 0.85
114 0.78
115 0.74
116 0.7
117 0.63
118 0.56
119 0.47
120 0.4
121 0.32
122 0.31
123 0.24
124 0.18
125 0.16
126 0.15
127 0.19
128 0.19
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.24
134 0.23
135 0.22
136 0.25
137 0.26
138 0.26
139 0.32
140 0.39
141 0.41
142 0.42
143 0.39
144 0.37
145 0.42
146 0.47
147 0.5
148 0.49
149 0.5
150 0.5
151 0.49
152 0.46
153 0.4
154 0.36
155 0.27
156 0.22
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.11