Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDM1

Protein Details
Accession R4XDM1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-54SAFRVPFFRYRHSRRRRVRIYIMFLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 20, mito 2, E.R. 2, cyto 1, golg 1, vacu 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011330  Glyco_hydro/deAcase_b/a-brl  
IPR002509  NODB_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016810  F:hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01522  Polysacc_deac_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51677  NODB  
CDD cd10958  CE4_NodB_like_2  
Amino Acid Sequences MVLIAKWVYVVVTTQDEDERASENISMISAFRVPFFRYRHSRRRRVRIYIMFLLILIGLALLVPAYLIYKPPHLLITALQYKWPEVLFYVPTQEKIIALTIDDSPSQFTPEILSILTENNATATFFVIGKQAQSEDSRSTLKKIVSQGSELGNHAMFDEPSRALTAKEFSEQVAEVDVFIEETYAAAGKTRDWKFFRPGSGFFSKVMITSLQSLGYSLVLGNIYPHDPQIPYAWVNARHILSMARPGGIIICHDRRSWTLPMLRRVLPELKRRGYKVMSVSELVTYGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.16
21 0.23
22 0.27
23 0.35
24 0.43
25 0.52
26 0.62
27 0.7
28 0.78
29 0.81
30 0.88
31 0.88
32 0.88
33 0.89
34 0.87
35 0.84
36 0.79
37 0.7
38 0.58
39 0.49
40 0.39
41 0.28
42 0.19
43 0.1
44 0.05
45 0.03
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.03
53 0.04
54 0.06
55 0.08
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.13
63 0.2
64 0.24
65 0.23
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.24
70 0.22
71 0.15
72 0.09
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.1
123 0.13
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.21
130 0.23
131 0.25
132 0.24
133 0.24
134 0.24
135 0.22
136 0.23
137 0.19
138 0.16
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.07
176 0.16
177 0.19
178 0.26
179 0.29
180 0.34
181 0.39
182 0.43
183 0.47
184 0.42
185 0.42
186 0.41
187 0.42
188 0.4
189 0.33
190 0.31
191 0.26
192 0.21
193 0.21
194 0.14
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.19
220 0.23
221 0.24
222 0.26
223 0.3
224 0.27
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.19
229 0.23
230 0.21
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.22
239 0.24
240 0.25
241 0.27
242 0.29
243 0.34
244 0.35
245 0.35
246 0.38
247 0.43
248 0.5
249 0.53
250 0.53
251 0.5
252 0.51
253 0.52
254 0.52
255 0.55
256 0.56
257 0.6
258 0.64
259 0.65
260 0.67
261 0.62
262 0.61
263 0.59
264 0.56
265 0.52
266 0.46
267 0.44
268 0.37