Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XIP1

Protein Details
Accession R4XIP1    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-71NLTAHSQKLPRNTHRHHRKPEANLNHLLHydrophilic
459-484LGNFKIEIEKRRKKRHDKAVSEESARBasic
592-617NEATGTPGKKAKPKKKKLVLMTSGGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-488KRRKKRHDKAVSEESARRRAQ
599-608GKKAKPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039739  Mag2/Rnf10  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16536  RING-HC_RNF10  
Amino Acid Sequences MSKSLGNVGEIAVFIPNAQQKSNLGNNNGKSNVSTRTNNALPQNLTAHSQKLPRNTHRHHRKPEANLNHLLNFSYARQSAPAHAMPARRAAKSNPTYGRGSGYHPLDKAHFVNANYRFVVHPSGDYRPNLIESDIPIPWENVLQVLASVQSQCNACPICLEDVPVAPRMAKCGHIFCLPCALRYLDSEDMKTGKTTGKWRKCPICFDGVYASELRPVKWFSGDDMLPVKGQDITLQLIMREAGSMFALPRDSLQIPADSVPWHDQAEALEYARLIKGDEQYMTSESEREVNDLVTMRDEDATAYGETNQWTATAIEHIDDRATTHHLLGAAPNRKHTAKSTAKVVRPPIEYLDAHVPTNDGQHPPQGSRQTAYLQRESADLDAADDAYYFYQPRTGSHYYLASLDIRILKRAFGSFSSFPSALVARAEHLTTLTIDEDLRRKNKYLSHLPLGVLADDVLGNFKIEIEKRRKKRHDKAVSEESARRRAQAAEERRERAGLGELQWHDEDTSYFARNDVSNTYEIFGEDEHRLGTSPGSLPSETMPLGSFERRSIWGTALPPASGDQPPPEEDDEWKDQLEKFYQESAIAASANEATGTPGKKAKPKKKKLVLMTSGGGRGSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.12
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.22
8 0.29
9 0.38
10 0.39
11 0.41
12 0.47
13 0.49
14 0.55
15 0.54
16 0.47
17 0.41
18 0.38
19 0.39
20 0.38
21 0.38
22 0.35
23 0.42
24 0.44
25 0.47
26 0.48
27 0.47
28 0.42
29 0.42
30 0.41
31 0.34
32 0.35
33 0.32
34 0.31
35 0.29
36 0.34
37 0.35
38 0.41
39 0.5
40 0.56
41 0.64
42 0.69
43 0.76
44 0.8
45 0.86
46 0.87
47 0.88
48 0.87
49 0.87
50 0.9
51 0.88
52 0.83
53 0.8
54 0.73
55 0.65
56 0.57
57 0.47
58 0.38
59 0.3
60 0.25
61 0.23
62 0.2
63 0.17
64 0.19
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.27
71 0.29
72 0.29
73 0.37
74 0.37
75 0.33
76 0.35
77 0.35
78 0.42
79 0.44
80 0.52
81 0.48
82 0.48
83 0.5
84 0.48
85 0.49
86 0.4
87 0.39
88 0.37
89 0.36
90 0.36
91 0.34
92 0.35
93 0.32
94 0.35
95 0.31
96 0.29
97 0.28
98 0.25
99 0.33
100 0.35
101 0.37
102 0.33
103 0.33
104 0.28
105 0.26
106 0.28
107 0.21
108 0.2
109 0.2
110 0.25
111 0.28
112 0.29
113 0.29
114 0.27
115 0.28
116 0.25
117 0.22
118 0.19
119 0.17
120 0.2
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.07
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.14
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.17
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.2
160 0.23
161 0.26
162 0.27
163 0.24
164 0.33
165 0.29
166 0.27
167 0.26
168 0.25
169 0.21
170 0.21
171 0.26
172 0.22
173 0.23
174 0.23
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.17
180 0.14
181 0.18
182 0.27
183 0.36
184 0.45
185 0.53
186 0.61
187 0.68
188 0.69
189 0.72
190 0.65
191 0.63
192 0.53
193 0.47
194 0.42
195 0.34
196 0.32
197 0.26
198 0.22
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.15
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.06
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.18
317 0.22
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.26
322 0.27
323 0.28
324 0.3
325 0.31
326 0.33
327 0.4
328 0.45
329 0.47
330 0.5
331 0.51
332 0.46
333 0.41
334 0.4
335 0.33
336 0.3
337 0.27
338 0.25
339 0.27
340 0.23
341 0.21
342 0.2
343 0.18
344 0.14
345 0.17
346 0.17
347 0.12
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.22
353 0.24
354 0.23
355 0.22
356 0.23
357 0.24
358 0.29
359 0.32
360 0.29
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.24
365 0.2
366 0.14
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.18
382 0.2
383 0.21
384 0.23
385 0.24
386 0.21
387 0.22
388 0.22
389 0.15
390 0.12
391 0.13
392 0.16
393 0.15
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.17
400 0.14
401 0.19
402 0.17
403 0.2
404 0.24
405 0.22
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.14
410 0.14
411 0.12
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.1
424 0.15
425 0.2
426 0.23
427 0.24
428 0.26
429 0.3
430 0.35
431 0.41
432 0.46
433 0.47
434 0.49
435 0.49
436 0.47
437 0.46
438 0.42
439 0.33
440 0.23
441 0.16
442 0.11
443 0.08
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.09
451 0.12
452 0.21
453 0.3
454 0.4
455 0.5
456 0.61
457 0.72
458 0.79
459 0.87
460 0.89
461 0.9
462 0.89
463 0.88
464 0.87
465 0.82
466 0.76
467 0.72
468 0.66
469 0.63
470 0.55
471 0.47
472 0.39
473 0.35
474 0.38
475 0.41
476 0.45
477 0.47
478 0.54
479 0.56
480 0.55
481 0.53
482 0.46
483 0.37
484 0.33
485 0.25
486 0.2
487 0.25
488 0.24
489 0.27
490 0.27
491 0.26
492 0.21
493 0.18
494 0.17
495 0.14
496 0.16
497 0.15
498 0.15
499 0.15
500 0.17
501 0.17
502 0.19
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.16
509 0.16
510 0.14
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.14
523 0.17
524 0.17
525 0.17
526 0.18
527 0.21
528 0.18
529 0.17
530 0.14
531 0.14
532 0.17
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.21
537 0.22
538 0.25
539 0.24
540 0.23
541 0.25
542 0.25
543 0.3
544 0.28
545 0.25
546 0.23
547 0.23
548 0.24
549 0.21
550 0.21
551 0.19
552 0.21
553 0.22
554 0.26
555 0.27
556 0.25
557 0.26
558 0.32
559 0.34
560 0.33
561 0.32
562 0.31
563 0.3
564 0.33
565 0.35
566 0.31
567 0.28
568 0.29
569 0.3
570 0.27
571 0.26
572 0.23
573 0.19
574 0.16
575 0.13
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.09
580 0.08
581 0.1
582 0.15
583 0.16
584 0.18
585 0.24
586 0.29
587 0.38
588 0.49
589 0.57
590 0.64
591 0.73
592 0.81
593 0.86
594 0.91
595 0.92
596 0.92
597 0.88
598 0.83
599 0.77
600 0.7
601 0.61