Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XII3

Protein Details
Accession R4XII3    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSKPNFQRRLPKSTKNLRACLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
IPR009287  Spt4  
IPR022800  Spt4/RpoE2_Znf  
IPR038510  Spt4_sf  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF06093  Spt4  
CDD cd07973  Spt4  
Amino Acid Sequences MSKPNFQRRLPKSTKNLRACLMCAILLTSDQFANEGCPNCESILRTSERPEEVTSPNHEGRIAMMSPSDSWVAKWQRSSNFVAGLYATRVVGRLADEIVEDLEAQGIQYIPRDGSYVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.79
4 0.73
5 0.67
6 0.59
7 0.53
8 0.43
9 0.33
10 0.24
11 0.2
12 0.15
13 0.13
14 0.12
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.09
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.15
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.17
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.24
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.21
40 0.23
41 0.24
42 0.25
43 0.25
44 0.23
45 0.22
46 0.18
47 0.16
48 0.16
49 0.13
50 0.08
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.07
57 0.07
58 0.15
59 0.19
60 0.2
61 0.24
62 0.27
63 0.3
64 0.34
65 0.37
66 0.32
67 0.31
68 0.29
69 0.26
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.12
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.1