Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XA79

Protein Details
Accession R4XA79    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-292LCLFDKVQRTKNKWKCILKDGIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-231IKSDGDKPRSKKNKAP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MRALGISEEHYLLCDLYHRCLTHECIYRCKSTGKVSFALSDLNEASLYEAIVDEVVNQSRQDFQDDGITEATLQEFKTRWNEKIAATGATALPDATSAKQDNLKTESNAGTPPATFSQGGNALAAMRAAQQIQQLQARSNGGIQQHQADTAVAHLMQQAQGSDSSALQDGENGNSNGDLVNVKQEPDLPNSMNPQDLSLSSSSSTTTNGKKRSLSIKSDGDKPRSKKNKAPRADIDLDDEAINSDLDDSDDDALRGEGEDEQDGDVQTVLCLFDKVQRTKNKWKCILKDGIVNVNGRDFAFNKANGEFEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.19
4 0.24
5 0.24
6 0.26
7 0.3
8 0.36
9 0.38
10 0.46
11 0.44
12 0.48
13 0.52
14 0.53
15 0.52
16 0.5
17 0.46
18 0.46
19 0.51
20 0.47
21 0.47
22 0.45
23 0.44
24 0.41
25 0.39
26 0.29
27 0.24
28 0.19
29 0.16
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.15
47 0.16
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.22
52 0.23
53 0.24
54 0.2
55 0.19
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.12
64 0.22
65 0.25
66 0.26
67 0.31
68 0.34
69 0.32
70 0.38
71 0.37
72 0.29
73 0.25
74 0.25
75 0.19
76 0.17
77 0.16
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.17
87 0.18
88 0.21
89 0.25
90 0.26
91 0.24
92 0.26
93 0.26
94 0.22
95 0.22
96 0.19
97 0.15
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.08
118 0.09
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.04
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.13
172 0.14
173 0.18
174 0.2
175 0.17
176 0.19
177 0.21
178 0.22
179 0.2
180 0.18
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.2
194 0.26
195 0.3
196 0.33
197 0.33
198 0.38
199 0.45
200 0.47
201 0.46
202 0.46
203 0.5
204 0.5
205 0.58
206 0.59
207 0.58
208 0.59
209 0.57
210 0.61
211 0.63
212 0.66
213 0.65
214 0.7
215 0.73
216 0.72
217 0.77
218 0.73
219 0.71
220 0.7
221 0.63
222 0.57
223 0.48
224 0.42
225 0.33
226 0.27
227 0.18
228 0.14
229 0.13
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.14
261 0.23
262 0.28
263 0.36
264 0.45
265 0.53
266 0.64
267 0.73
268 0.77
269 0.78
270 0.83
271 0.81
272 0.81
273 0.82
274 0.75
275 0.73
276 0.67
277 0.65
278 0.59
279 0.53
280 0.45
281 0.38
282 0.35
283 0.27
284 0.26
285 0.19
286 0.22
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.27