Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X6P4

Protein Details
Accession R4X6P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-361KDESANGKSKRKKKEVKRRKKRRTNGHRGSDDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-354GKSKRKKKEVKRRKKRRTNG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013197  RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH  
IPR008806  RNA_pol_III_Rpc82_C  
IPR039748  RPC3  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08221  HTH_9  
PF05645  RNA_pol_Rpc82  
Amino Acid Sequences MASAASRSAAELCRVLLDSFFGPTVAKVAGVLLLYGRLEAVSVSRRGEVSPKLTRQSLAVLIQHNFVRFSTVQEAGHERTFYECDWQQVLYLLQTGRIIWWASKEATPQAAALVKYVSIYGKAKVSDMTNAFTSAGSELRESTKEFHHTLAKLLQTKILQVAQIHESTPVEDFKQSIRDEELRTLNGANMPESKKLVEVEGRLERKLKDLQDKNNAEDAGLKRKAEALDNSRARKRARTTEVEEDAVDPDIMVKVNYQKHAVFQRNEELVKLCQRRLGPTPAAVYGHILKMLEPKIFNCRQNTQDFKISTLSISRALPEDFDLESVWTKDESANGKSKRKKKEVKRRKKRRTNGHRGSDDDSDEDSEEESDDEMDDDASSGADSFLEHDIDDLASDDDDFDENAPAQSGQRIKLVQQFLDLFANDSIGFLRRLSTRSMGEWTVDYPHLANTLRQLEIEALIHQKLGDLAPRLLRIVQAKVKVDEKQLSTTALLKSKDIRHILTALHEMGVLDLQEVPKRLDRQPSMTFFLWHHNQERAVSTLAQDLCKAMARVHQRLKHELQSRRRLLDKSQRTDVRNKESEYLSKQELAELRKIRSVEEKLLAQSSRLASSYSILVEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.09
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.19
32 0.2
33 0.21
34 0.27
35 0.29
36 0.32
37 0.39
38 0.43
39 0.46
40 0.48
41 0.47
42 0.43
43 0.42
44 0.39
45 0.34
46 0.32
47 0.32
48 0.31
49 0.34
50 0.34
51 0.31
52 0.27
53 0.22
54 0.23
55 0.19
56 0.23
57 0.24
58 0.26
59 0.25
60 0.27
61 0.32
62 0.3
63 0.33
64 0.28
65 0.24
66 0.24
67 0.25
68 0.22
69 0.25
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.24
74 0.21
75 0.21
76 0.22
77 0.15
78 0.18
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.14
88 0.16
89 0.18
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.19
97 0.21
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.14
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.23
114 0.23
115 0.24
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.18
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.2
131 0.24
132 0.25
133 0.27
134 0.3
135 0.3
136 0.31
137 0.33
138 0.34
139 0.34
140 0.33
141 0.34
142 0.28
143 0.28
144 0.28
145 0.25
146 0.21
147 0.17
148 0.2
149 0.18
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.19
162 0.18
163 0.18
164 0.22
165 0.25
166 0.26
167 0.31
168 0.32
169 0.26
170 0.27
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.19
175 0.15
176 0.17
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.17
185 0.16
186 0.21
187 0.27
188 0.29
189 0.28
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.34
194 0.33
195 0.36
196 0.41
197 0.48
198 0.55
199 0.58
200 0.56
201 0.55
202 0.5
203 0.39
204 0.38
205 0.33
206 0.31
207 0.31
208 0.28
209 0.24
210 0.27
211 0.28
212 0.25
213 0.29
214 0.26
215 0.34
216 0.39
217 0.44
218 0.44
219 0.48
220 0.46
221 0.47
222 0.47
223 0.47
224 0.49
225 0.51
226 0.54
227 0.57
228 0.58
229 0.53
230 0.47
231 0.38
232 0.31
233 0.24
234 0.18
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.18
245 0.18
246 0.22
247 0.3
248 0.36
249 0.32
250 0.31
251 0.35
252 0.36
253 0.36
254 0.32
255 0.26
256 0.22
257 0.28
258 0.28
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.27
263 0.3
264 0.33
265 0.27
266 0.27
267 0.28
268 0.25
269 0.25
270 0.22
271 0.19
272 0.14
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.2
283 0.25
284 0.28
285 0.28
286 0.3
287 0.33
288 0.39
289 0.43
290 0.39
291 0.41
292 0.38
293 0.35
294 0.33
295 0.29
296 0.23
297 0.19
298 0.17
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.12
319 0.15
320 0.23
321 0.27
322 0.35
323 0.43
324 0.51
325 0.57
326 0.64
327 0.7
328 0.73
329 0.8
330 0.84
331 0.88
332 0.91
333 0.93
334 0.95
335 0.96
336 0.95
337 0.94
338 0.94
339 0.94
340 0.93
341 0.91
342 0.83
343 0.76
344 0.7
345 0.61
346 0.5
347 0.4
348 0.3
349 0.21
350 0.18
351 0.14
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.15
398 0.16
399 0.18
400 0.24
401 0.26
402 0.23
403 0.24
404 0.23
405 0.22
406 0.23
407 0.21
408 0.16
409 0.13
410 0.14
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.07
417 0.1
418 0.11
419 0.13
420 0.16
421 0.19
422 0.19
423 0.2
424 0.24
425 0.22
426 0.21
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.16
431 0.15
432 0.12
433 0.12
434 0.14
435 0.14
436 0.13
437 0.16
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.18
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.18
460 0.21
461 0.2
462 0.23
463 0.26
464 0.29
465 0.32
466 0.34
467 0.37
468 0.37
469 0.4
470 0.39
471 0.36
472 0.35
473 0.33
474 0.32
475 0.3
476 0.3
477 0.29
478 0.29
479 0.27
480 0.25
481 0.3
482 0.34
483 0.4
484 0.39
485 0.37
486 0.34
487 0.36
488 0.35
489 0.32
490 0.3
491 0.23
492 0.2
493 0.18
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.09
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.11
502 0.12
503 0.14
504 0.2
505 0.24
506 0.28
507 0.36
508 0.39
509 0.44
510 0.51
511 0.53
512 0.54
513 0.51
514 0.48
515 0.4
516 0.44
517 0.42
518 0.39
519 0.38
520 0.35
521 0.36
522 0.36
523 0.37
524 0.32
525 0.28
526 0.24
527 0.22
528 0.25
529 0.25
530 0.23
531 0.21
532 0.19
533 0.18
534 0.2
535 0.2
536 0.14
537 0.19
538 0.27
539 0.36
540 0.44
541 0.49
542 0.51
543 0.59
544 0.63
545 0.65
546 0.66
547 0.67
548 0.68
549 0.73
550 0.75
551 0.72
552 0.72
553 0.66
554 0.67
555 0.69
556 0.69
557 0.65
558 0.69
559 0.71
560 0.7
561 0.76
562 0.75
563 0.74
564 0.71
565 0.66
566 0.62
567 0.59
568 0.61
569 0.58
570 0.54
571 0.47
572 0.44
573 0.41
574 0.41
575 0.41
576 0.38
577 0.42
578 0.41
579 0.41
580 0.41
581 0.41
582 0.39
583 0.43
584 0.44
585 0.42
586 0.42
587 0.43
588 0.41
589 0.46
590 0.44
591 0.36
592 0.36
593 0.31
594 0.28
595 0.25
596 0.24
597 0.19
598 0.2
599 0.22