Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XJD8

Protein Details
Accession R4XJD8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23TDQIERREKERLKRLNRLAASSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MTDQIERREKERLKRLNRLAASSSANDATEKDTPDRTVARNPITKVRVKEEPKNSATPASSRSEVKPAEVVRPLVRQAKAEESLDMWTSRTISSILQVTLDPTYERLYYLSQLHEELCTETDSEGTPPFTLDNLDRTILARLSDDMTSSPFDYLLECYNRAEAVSRASRREVSSVLEKQQLLGEVRRLCVNYAGLSVTMPELLETMHTPPDIIARLLQQDQETYGLPESFVRDLVTKFTDEDTLADFFEPILIGISRSLQKFSLIDDFYRHFAALRSLLQYPGIVGVLCDSSHFIPDCSAAEIEVKSLLGPFFKISPISAKVAELTFGAIADGNQSQVASGISSLRTSTPVLQNQLFDICNALIRQSLESRQAVLKYFAHVLKLNKKRHAMQVDAATVSSDGFMVNITAVLNRFSEPFVSDISKISRIDVDYLRREPLVDLEGETRLMADESTTQEYYSHHAPGDNNFISHIFFLNVAYHHYGLGATMSAHQKVLEKIRDMQKYKDRMQAEQPFTGPQAMMMTMQFQRIEKAVSQAKSISYCFEAILCDETIQARSFAFLSLVASWLIRLVDARHEYPSTMISLPLGSLNNAEAYKNLPEYFVEDIAEYFLYVSRMMPGLLSRSPVTDLVVFSLVFLRSSEYIKNPYLKAKLVEILFNGVRPLRRGETQGALSPVLNSHSLALQHLFPALMGFYIEVESTGLSSQFYDKFNIRYHISQIFKSIWENPAHREKLSLEAKDDIEFFVRFVALLLNDQTYLLDEALAKLSEIHGLQIELGEIEDKTTEQYQEKSGHLQQAERQATSYLQLGTETLSMLNLFTASIPAAFCTAEIADRLAAMLDYNIDALVGPKCTGLKVHNPENYHFDPKALLSGIVGIFLNMSKHDDFITAVVRDGRSYKKENFDRTSAILRKFSLRSSQDIDQLVDFVSSVEKRKVEYQQDEDDLGDIPDEFLDPLIGELMKDPVMLPTSKTIIDRGTIKRHLLNDATDPFNRSPLELKDVIPATELKQQIDEFIQSKKRVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.84
3 0.84
4 0.8
5 0.76
6 0.69
7 0.64
8 0.58
9 0.5
10 0.44
11 0.35
12 0.32
13 0.27
14 0.24
15 0.23
16 0.23
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.28
21 0.32
22 0.36
23 0.36
24 0.4
25 0.44
26 0.49
27 0.53
28 0.54
29 0.59
30 0.6
31 0.63
32 0.59
33 0.58
34 0.59
35 0.6
36 0.67
37 0.67
38 0.7
39 0.69
40 0.68
41 0.64
42 0.6
43 0.55
44 0.49
45 0.44
46 0.4
47 0.38
48 0.37
49 0.38
50 0.4
51 0.38
52 0.37
53 0.39
54 0.35
55 0.39
56 0.39
57 0.4
58 0.35
59 0.39
60 0.41
61 0.42
62 0.42
63 0.38
64 0.37
65 0.41
66 0.41
67 0.38
68 0.34
69 0.28
70 0.29
71 0.28
72 0.24
73 0.18
74 0.15
75 0.16
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.12
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.18
96 0.2
97 0.22
98 0.21
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.2
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.17
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.13
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.14
150 0.18
151 0.26
152 0.29
153 0.31
154 0.34
155 0.37
156 0.37
157 0.39
158 0.33
159 0.29
160 0.34
161 0.36
162 0.37
163 0.39
164 0.37
165 0.35
166 0.35
167 0.34
168 0.28
169 0.26
170 0.29
171 0.25
172 0.27
173 0.29
174 0.28
175 0.24
176 0.25
177 0.23
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.17
203 0.18
204 0.2
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.15
210 0.13
211 0.14
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.17
223 0.15
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.13
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.16
248 0.15
249 0.18
250 0.22
251 0.2
252 0.2
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.21
258 0.14
259 0.14
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.17
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.13
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.12
312 0.1
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.04
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.09
334 0.1
335 0.14
336 0.19
337 0.22
338 0.26
339 0.27
340 0.26
341 0.26
342 0.27
343 0.23
344 0.16
345 0.14
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.21
362 0.19
363 0.17
364 0.2
365 0.19
366 0.19
367 0.21
368 0.25
369 0.32
370 0.4
371 0.44
372 0.47
373 0.5
374 0.52
375 0.56
376 0.57
377 0.5
378 0.45
379 0.44
380 0.39
381 0.35
382 0.32
383 0.23
384 0.18
385 0.15
386 0.11
387 0.06
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.14
410 0.17
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.15
415 0.18
416 0.2
417 0.23
418 0.23
419 0.25
420 0.25
421 0.23
422 0.23
423 0.2
424 0.18
425 0.14
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.05
438 0.08
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.15
445 0.15
446 0.14
447 0.11
448 0.13
449 0.14
450 0.15
451 0.22
452 0.19
453 0.17
454 0.17
455 0.17
456 0.15
457 0.15
458 0.13
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.04
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.11
480 0.13
481 0.18
482 0.18
483 0.18
484 0.23
485 0.31
486 0.38
487 0.38
488 0.42
489 0.44
490 0.48
491 0.5
492 0.52
493 0.45
494 0.4
495 0.47
496 0.5
497 0.46
498 0.41
499 0.37
500 0.31
501 0.3
502 0.28
503 0.19
504 0.1
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.09
518 0.13
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.18
523 0.18
524 0.19
525 0.19
526 0.15
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.09
540 0.09
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.1
559 0.13
560 0.14
561 0.15
562 0.15
563 0.15
564 0.16
565 0.16
566 0.13
567 0.11
568 0.1
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.08
574 0.06
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.09
586 0.09
587 0.12
588 0.13
589 0.12
590 0.11
591 0.09
592 0.09
593 0.1
594 0.09
595 0.07
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.09
607 0.09
608 0.11
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.13
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.11
621 0.1
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.09
626 0.11
627 0.13
628 0.13
629 0.17
630 0.2
631 0.24
632 0.23
633 0.28
634 0.29
635 0.29
636 0.28
637 0.25
638 0.27
639 0.24
640 0.24
641 0.19
642 0.2
643 0.18
644 0.17
645 0.16
646 0.13
647 0.13
648 0.13
649 0.17
650 0.15
651 0.17
652 0.2
653 0.23
654 0.25
655 0.26
656 0.27
657 0.25
658 0.23
659 0.21
660 0.18
661 0.16
662 0.13
663 0.12
664 0.09
665 0.08
666 0.09
667 0.09
668 0.1
669 0.11
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.06
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.08
692 0.11
693 0.12
694 0.15
695 0.16
696 0.2
697 0.24
698 0.27
699 0.28
700 0.26
701 0.29
702 0.34
703 0.35
704 0.31
705 0.31
706 0.28
707 0.27
708 0.27
709 0.26
710 0.23
711 0.26
712 0.27
713 0.29
714 0.37
715 0.38
716 0.36
717 0.35
718 0.31
719 0.35
720 0.39
721 0.36
722 0.28
723 0.3
724 0.31
725 0.3
726 0.29
727 0.2
728 0.17
729 0.15
730 0.13
731 0.1
732 0.09
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.07
737 0.08
738 0.09
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.08
744 0.09
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.07
753 0.08
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.08
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.05
763 0.05
764 0.06
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.07
770 0.09
771 0.12
772 0.13
773 0.16
774 0.2
775 0.23
776 0.25
777 0.28
778 0.3
779 0.34
780 0.33
781 0.33
782 0.33
783 0.39
784 0.41
785 0.35
786 0.32
787 0.27
788 0.27
789 0.26
790 0.24
791 0.14
792 0.12
793 0.11
794 0.11
795 0.11
796 0.11
797 0.1
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.05
804 0.05
805 0.04
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.09
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.07
823 0.06
824 0.06
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.05
832 0.06
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.09
837 0.1
838 0.11
839 0.14
840 0.16
841 0.25
842 0.31
843 0.4
844 0.43
845 0.46
846 0.48
847 0.54
848 0.54
849 0.5
850 0.43
851 0.35
852 0.32
853 0.29
854 0.3
855 0.23
856 0.18
857 0.12
858 0.15
859 0.14
860 0.13
861 0.13
862 0.09
863 0.09
864 0.09
865 0.1
866 0.07
867 0.12
868 0.11
869 0.12
870 0.13
871 0.13
872 0.13
873 0.14
874 0.19
875 0.15
876 0.16
877 0.19
878 0.18
879 0.19
880 0.22
881 0.27
882 0.28
883 0.34
884 0.39
885 0.46
886 0.54
887 0.62
888 0.64
889 0.62
890 0.6
891 0.57
892 0.61
893 0.57
894 0.53
895 0.48
896 0.44
897 0.46
898 0.43
899 0.43
900 0.42
901 0.38
902 0.4
903 0.42
904 0.44
905 0.44
906 0.44
907 0.42
908 0.33
909 0.31
910 0.25
911 0.19
912 0.16
913 0.1
914 0.12
915 0.13
916 0.16
917 0.2
918 0.21
919 0.23
920 0.3
921 0.39
922 0.44
923 0.5
924 0.53
925 0.55
926 0.57
927 0.56
928 0.49
929 0.41
930 0.32
931 0.24
932 0.18
933 0.11
934 0.08
935 0.07
936 0.07
937 0.07
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.06
942 0.07
943 0.07
944 0.07
945 0.08
946 0.1
947 0.09
948 0.1
949 0.1
950 0.11
951 0.14
952 0.14
953 0.15
954 0.18
955 0.2
956 0.22
957 0.23
958 0.23
959 0.22
960 0.26
961 0.31
962 0.34
963 0.4
964 0.43
965 0.46
966 0.49
967 0.5
968 0.52
969 0.48
970 0.44
971 0.43
972 0.43
973 0.44
974 0.41
975 0.43
976 0.38
977 0.39
978 0.36
979 0.3
980 0.3
981 0.3
982 0.35
983 0.32
984 0.33
985 0.35
986 0.36
987 0.35
988 0.31
989 0.28
990 0.24
991 0.29
992 0.3
993 0.24
994 0.26
995 0.26
996 0.27
997 0.28
998 0.3
999 0.24
1000 0.3
1001 0.37
1002 0.4