FuNGI

R4XDS4

Protein Details

Accession

R4XDS4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-117	SLQNTSQSQPKNQKKKKKNKKKLKAQKSKAVDNIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-111	KNQKKKKKNKKKLKAQKSK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006994 TCF25/Rqc1
Pfam	View protein in Pfam PF04910 Tcf25

Amino Acid Sequences

MSRALRKVQRQQLDLQAQSNETQAADSEEDEEDDEVASKAAPNPFDLLNAGTERPAEEPESDDNHSEVSGDEGAELQQAIANSLQNTSQSQPKNQKKKKKNKKKLKAQKSKAVDNIEDKVNTDDAAFEAALSAHRREVANTIIPEAEEKPFNLTELLSVDVKMLDPNVEMRRLFGSKVISSERAERTSTSRRNMPRGMQQQLNRGRKSVLVPMEDNYPLTIKGGLEMEMEEDIDGIKTFRFVHSKMYQQTQYTFMQCVQSGDPQTLMNLLTRAPFHVDTLLQVSEILRHQGDNEQSGEMLTRALFAFDRAFHPLFNVASGLVRLPFEIPENRPFYLAIYRYIQSLGRRGCWATAFEFNKLLYALAPEEDPYAALLSIDFYAIKARNWTYVRKLVECPWDRVLDHDFYKPNLAYAKALAAFLSDTKHAELEENKAELGSAIKQFPYLVGPLFSELKATGPIQYDTIEPSNQFGRLVRDLYVYRAKDIYNTPEITKFLRDAAIPVESFTPTELPDDIPTNVCRHILLLDERTLLHYLPKEITASPGLSFDPLPPDDSLPSYLDAYMPTSGVLDGGRTMVPQFIQDLLRRILPNHEPNTELNDEQVAQLMQQIELEGGVEGGDVWDGAAGDGGQAGRPGAGGFDDPNGYGPNRGVDEPDREGNAGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.59
3	0.52
4	0.45
5	0.42
6	0.37
7	0.28
8	0.19
9	0.16
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.13
14	0.14
15	0.14
16	0.14
17	0.15
18	0.15
19	0.11
20	0.1
21	0.11
22	0.09
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.13
27	0.17
28	0.17
29	0.18
30	0.2
31	0.2
32	0.22
33	0.21
34	0.18
35	0.17
36	0.19
37	0.18
38	0.15
39	0.15
40	0.15
41	0.16
42	0.17
43	0.16
44	0.14
45	0.17
46	0.22
47	0.26
48	0.27
49	0.27
50	0.25
51	0.23
52	0.22
53	0.19
54	0.14
55	0.12
56	0.11
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.1
63	0.06
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.13
73	0.15
74	0.16
75	0.23
76	0.25
77	0.34
78	0.44
79	0.54
80	0.64
81	0.71
82	0.8
83	0.83
84	0.9
85	0.93
86	0.94
87	0.94
88	0.95
89	0.96
90	0.97
91	0.97
92	0.97
93	0.97
94	0.94
95	0.93
96	0.89
97	0.86
98	0.82
99	0.77
100	0.7
101	0.63
102	0.57
103	0.52
104	0.44
105	0.37
106	0.32
107	0.26
108	0.22
109	0.17
110	0.14
111	0.1
112	0.11
113	0.1
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.1
118	0.12
119	0.13
120	0.11
121	0.14
122	0.15
123	0.16
124	0.18
125	0.2
126	0.23
127	0.23
128	0.24
129	0.21
130	0.21
131	0.22
132	0.21
133	0.19
134	0.14
135	0.14
136	0.16
137	0.16
138	0.17
139	0.16
140	0.14
141	0.12
142	0.13
143	0.15
144	0.11
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.12
154	0.15
155	0.18
156	0.17
157	0.18
158	0.22
159	0.22
160	0.22
161	0.2
162	0.22
163	0.19
164	0.23
165	0.25
166	0.24
167	0.25
168	0.31
169	0.32
170	0.3
171	0.3
172	0.28
173	0.31
174	0.39
175	0.43
176	0.41
177	0.45
178	0.48
179	0.54
180	0.58
181	0.56
182	0.56
183	0.57
184	0.57
185	0.56
186	0.54
187	0.56
188	0.62
189	0.65
190	0.56
191	0.5
192	0.45
193	0.41
194	0.41
195	0.38
196	0.33
197	0.28
198	0.28
199	0.28
200	0.31
201	0.28
202	0.26
203	0.19
204	0.15
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.07
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.07
216	0.08
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.06
226	0.09
227	0.12
228	0.13
229	0.21
230	0.25
231	0.32
232	0.34
233	0.39
234	0.39
235	0.37
236	0.38
237	0.34
238	0.33
239	0.27
240	0.25
241	0.21
242	0.2
243	0.18
244	0.18
245	0.16
246	0.17
247	0.16
248	0.15
249	0.15
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.13
267	0.12
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.12
278	0.13
279	0.13
280	0.14
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.08
286	0.07
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.09
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.12
302	0.12
303	0.1
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.08
314	0.11
315	0.13
316	0.18
317	0.21
318	0.21
319	0.21
320	0.21
321	0.2
322	0.22
323	0.2
324	0.17
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.14
331	0.19
332	0.18
333	0.17
334	0.18
335	0.18
336	0.18
337	0.17
338	0.17
339	0.14
340	0.2
341	0.2
342	0.2
343	0.21
344	0.2
345	0.19
346	0.18
347	0.15
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.11
371	0.12
372	0.18
373	0.21
374	0.24
375	0.26
376	0.32
377	0.34
378	0.34
379	0.36
380	0.34
381	0.42
382	0.41
383	0.4
384	0.36
385	0.35
386	0.32
387	0.33
388	0.31
389	0.25
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.21
394	0.25
395	0.22
396	0.2
397	0.18
398	0.17
399	0.14
400	0.13
401	0.15
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.11
415	0.12
416	0.15
417	0.17
418	0.17
419	0.16
420	0.16
421	0.15
422	0.13
423	0.13
424	0.11
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.1
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.15
451	0.17
452	0.15
453	0.13
454	0.15
455	0.15
456	0.15
457	0.15
458	0.14
459	0.17
460	0.18
461	0.19
462	0.18
463	0.2
464	0.2
465	0.25
466	0.31
467	0.26
468	0.25
469	0.26
470	0.25
471	0.25
472	0.28
473	0.29
474	0.27
475	0.28
476	0.28
477	0.29
478	0.31
479	0.29
480	0.28
481	0.23
482	0.18
483	0.18
484	0.17
485	0.15
486	0.16
487	0.17
488	0.15
489	0.15
490	0.15
491	0.13
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.09
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.12
500	0.15
501	0.15
502	0.17
503	0.18
504	0.19
505	0.19
506	0.18
507	0.16
508	0.14
509	0.14
510	0.16
511	0.18
512	0.19
513	0.2
514	0.21
515	0.21
516	0.22
517	0.22
518	0.18
519	0.18
520	0.16
521	0.17
522	0.18
523	0.19
524	0.18
525	0.18
526	0.21
527	0.19
528	0.18
529	0.16
530	0.16
531	0.15
532	0.15
533	0.15
534	0.13
535	0.16
536	0.16
537	0.17
538	0.17
539	0.19
540	0.19
541	0.2
542	0.21
543	0.17
544	0.18
545	0.17
546	0.16
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.12
551	0.11
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.07
558	0.06
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.09
564	0.09
565	0.1
566	0.11
567	0.12
568	0.16
569	0.18
570	0.23
571	0.23
572	0.28
573	0.28
574	0.28
575	0.32
576	0.37
577	0.43
578	0.44
579	0.44
580	0.41
581	0.42
582	0.48
583	0.44
584	0.35
585	0.27
586	0.24
587	0.22
588	0.2
589	0.21
590	0.14
591	0.1
592	0.14
593	0.13
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.12
628	0.13
629	0.13
630	0.15
631	0.17
632	0.16
633	0.17
634	0.17
635	0.19
636	0.21
637	0.22
638	0.25
639	0.27
640	0.32
641	0.36
642	0.39
643	0.36
644	0.34

R4XDS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer