Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XFQ1

Protein Details
Accession R4XFQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46FPATKATSKKAPKNPLIEKRTRNFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-37AAKSPFPATKATSKKAPKNP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MASIRPLEKKLSNDPPKAAKSPFPATKATSKKAPKNPLIEKRTRNFGIGQDVQPKKNLSRFVKWPKYVQLQRQKKILNQRLKVPPALAQFQYTLDKNTATQLFKLLNANRPETKAEKKERLTKVAEATKNGSAPEQTPKPQTVKFGLNHVVSLIENKKAQLVVIAHDVDPIELVVYLPALCKKMGVPYCIVKGKARLGTVVHMKTASVLAITDVAGSSKNDLSTLVSAINANFTQKFDEHRRKWGGGIMGFKSTKETERKQRLADAAVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.67
4 0.66
5 0.6
6 0.55
7 0.53
8 0.57
9 0.57
10 0.53
11 0.51
12 0.5
13 0.56
14 0.58
15 0.55
16 0.55
17 0.58
18 0.64
19 0.7
20 0.75
21 0.73
22 0.75
23 0.81
24 0.82
25 0.82
26 0.81
27 0.8
28 0.75
29 0.77
30 0.68
31 0.6
32 0.52
33 0.47
34 0.47
35 0.43
36 0.42
37 0.43
38 0.45
39 0.44
40 0.45
41 0.44
42 0.39
43 0.4
44 0.45
45 0.41
46 0.45
47 0.54
48 0.61
49 0.68
50 0.68
51 0.67
52 0.65
53 0.69
54 0.69
55 0.69
56 0.69
57 0.69
58 0.7
59 0.73
60 0.69
61 0.64
62 0.68
63 0.67
64 0.66
65 0.59
66 0.64
67 0.65
68 0.65
69 0.61
70 0.5
71 0.46
72 0.4
73 0.4
74 0.32
75 0.24
76 0.22
77 0.23
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.17
85 0.2
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.24
92 0.22
93 0.25
94 0.27
95 0.3
96 0.29
97 0.3
98 0.32
99 0.31
100 0.35
101 0.37
102 0.41
103 0.46
104 0.49
105 0.57
106 0.57
107 0.58
108 0.54
109 0.48
110 0.48
111 0.47
112 0.44
113 0.36
114 0.35
115 0.31
116 0.29
117 0.26
118 0.2
119 0.13
120 0.13
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.26
129 0.24
130 0.27
131 0.26
132 0.28
133 0.31
134 0.28
135 0.26
136 0.23
137 0.2
138 0.15
139 0.17
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.15
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.16
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.24
175 0.3
176 0.33
177 0.34
178 0.28
179 0.29
180 0.33
181 0.34
182 0.31
183 0.27
184 0.25
185 0.29
186 0.35
187 0.32
188 0.27
189 0.23
190 0.22
191 0.21
192 0.2
193 0.15
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.14
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.24
224 0.31
225 0.42
226 0.44
227 0.52
228 0.58
229 0.56
230 0.57
231 0.55
232 0.52
233 0.45
234 0.48
235 0.41
236 0.41
237 0.4
238 0.38
239 0.37
240 0.33
241 0.35
242 0.37
243 0.44
244 0.48
245 0.59
246 0.65
247 0.64
248 0.69
249 0.66
250 0.64