Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X874

Protein Details
Accession R4X874    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80PITEVKRSIRFRRKGLQGNIHydrophilic
176-203DPSRWDLPLLKRKKRTQVKINGNREPTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGAVDSASFADKLEDHIKTSDLNHIQDELLEPGSQFDRSVLCALQEPWTFDWQLDDVLRTPITEVKRSIRFRRKGLQGNIVGYDEIVENVHKLRPDNSSSFKRAPAPKDAFVRGKGSFFPWVPGGLQNMEESVKTLAELDTNTVLEKDSRSYFRRAPGLPSVQLQDTGKTLNISPDPSRWDLPLLKRKKRTQVKINGNREPTTNDVEDSALNDVDSFLPTDFGLLKSMPSVKPTSTKPHDRKWAHLVDVNRDMTNFRDLVPDLAFEHPFELDTFQKEAVYHLEQAESVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKYRDFKQTFGSVGILTGDIQLNPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDQERGVVWEEVIIMLPEHVTIIMLSATVPNTFEFANWVGRTKQKDIYVISTLKRPVPLEHFLYANKKLFKIVDANKQWSGLGYKEASQALVRNKEAKPIVPATGRGRGANRGSGQRGGSVAAQGRGQAQPFVRGGMMKTMERHDKNVWIHLVNHLKEKKLLPCVIFVFSKKRCEENAGVLSNIDLTNSVEKSQIHVTIEKALARLKLEDRTLPQIVRTRELLSRGIAVHHGGLLPIVKEIVEILFSRTLVKALFATETFAMGVNMPAKSVVFSGIRKHDGTSFRDLTPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIILCGEEAPDTHTLSTMLLGQPFKLLSQFRLTYNMILNLLRVETLKIEEMIKRSFSENASQTLLPEQQKLVTTTESKLSKLKEQHCELDETIRDCHSRCVQYIEVGKKVIQESVGITGRKFYGAGRVVVVQPEGMSRTLAIILGESAISTKQERSFAVLLNKHQDSTKRSSDLLPFLPCFRQFMKADLAIDGKFVLEILPATAIEWVTDTTLKIDATAVRQRVKSEWDSVASLVKEHFSDLDGAAFREIEWDKIKSLELRDTITTQSRLRSEAQSTGAEHMADFLRVYTACHEEHLLSHQILSLKAALSTQNLELIPDYEQRIAVLQELGFIDAHHAVVLKGRVACEINSAHELILTELILDNTLAEYTCEEIVALMSAFVFEERTDNEPNLSPRLVAGRGMIVEMARRVNTVQERHQVLTAGSGDEFEESPRFGLMEVCYEWARGMSFGNITELTDVLEGTIVRCIVRLDEVLRECQSAAKTVGDMAMHAKMEQCREMIKRDVVFTASLHLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.32
8 0.3
9 0.31
10 0.3
11 0.3
12 0.29
13 0.28
14 0.28
15 0.21
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.18
27 0.16
28 0.15
29 0.19
30 0.2
31 0.26
32 0.27
33 0.28
34 0.28
35 0.32
36 0.31
37 0.27
38 0.29
39 0.22
40 0.24
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.21
45 0.21
46 0.18
47 0.19
48 0.21
49 0.24
50 0.27
51 0.3
52 0.35
53 0.44
54 0.52
55 0.61
56 0.66
57 0.69
58 0.72
59 0.77
60 0.8
61 0.8
62 0.8
63 0.79
64 0.74
65 0.7
66 0.64
67 0.56
68 0.45
69 0.35
70 0.28
71 0.19
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.19
81 0.25
82 0.31
83 0.37
84 0.43
85 0.49
86 0.54
87 0.56
88 0.56
89 0.59
90 0.6
91 0.58
92 0.6
93 0.59
94 0.58
95 0.61
96 0.64
97 0.61
98 0.56
99 0.56
100 0.47
101 0.43
102 0.38
103 0.35
104 0.34
105 0.29
106 0.29
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.25
111 0.25
112 0.2
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.19
136 0.25
137 0.29
138 0.35
139 0.39
140 0.44
141 0.51
142 0.48
143 0.49
144 0.51
145 0.54
146 0.49
147 0.47
148 0.44
149 0.37
150 0.39
151 0.33
152 0.26
153 0.21
154 0.21
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.19
159 0.2
160 0.23
161 0.24
162 0.26
163 0.31
164 0.33
165 0.33
166 0.29
167 0.32
168 0.34
169 0.42
170 0.48
171 0.53
172 0.59
173 0.67
174 0.74
175 0.79
176 0.84
177 0.84
178 0.85
179 0.85
180 0.87
181 0.89
182 0.9
183 0.88
184 0.82
185 0.73
186 0.64
187 0.57
188 0.5
189 0.45
190 0.36
191 0.29
192 0.24
193 0.24
194 0.22
195 0.19
196 0.17
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.17
215 0.16
216 0.19
217 0.21
218 0.21
219 0.27
220 0.31
221 0.38
222 0.42
223 0.52
224 0.56
225 0.63
226 0.71
227 0.69
228 0.71
229 0.7
230 0.68
231 0.61
232 0.58
233 0.52
234 0.48
235 0.52
236 0.48
237 0.39
238 0.33
239 0.3
240 0.28
241 0.28
242 0.21
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.18
251 0.18
252 0.14
253 0.15
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.14
304 0.18
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.23
309 0.23
310 0.26
311 0.34
312 0.36
313 0.43
314 0.46
315 0.52
316 0.57
317 0.59
318 0.65
319 0.58
320 0.51
321 0.48
322 0.47
323 0.4
324 0.35
325 0.33
326 0.22
327 0.2
328 0.18
329 0.12
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.07
369 0.06
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.12
377 0.12
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.07
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.14
412 0.14
413 0.16
414 0.17
415 0.22
416 0.26
417 0.27
418 0.31
419 0.29
420 0.32
421 0.33
422 0.35
423 0.35
424 0.34
425 0.32
426 0.31
427 0.3
428 0.28
429 0.28
430 0.25
431 0.22
432 0.25
433 0.28
434 0.27
435 0.27
436 0.27
437 0.26
438 0.3
439 0.31
440 0.3
441 0.28
442 0.24
443 0.25
444 0.24
445 0.24
446 0.28
447 0.29
448 0.35
449 0.37
450 0.41
451 0.4
452 0.4
453 0.38
454 0.3
455 0.26
456 0.17
457 0.15
458 0.12
459 0.13
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.13
464 0.17
465 0.19
466 0.23
467 0.22
468 0.26
469 0.26
470 0.31
471 0.31
472 0.28
473 0.27
474 0.25
475 0.27
476 0.23
477 0.27
478 0.24
479 0.3
480 0.29
481 0.27
482 0.26
483 0.28
484 0.28
485 0.28
486 0.27
487 0.25
488 0.26
489 0.27
490 0.26
491 0.22
492 0.21
493 0.18
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.15
513 0.12
514 0.14
515 0.17
516 0.24
517 0.25
518 0.28
519 0.26
520 0.3
521 0.31
522 0.33
523 0.32
524 0.25
525 0.25
526 0.28
527 0.33
528 0.27
529 0.34
530 0.31
531 0.29
532 0.31
533 0.33
534 0.31
535 0.31
536 0.33
537 0.26
538 0.28
539 0.28
540 0.28
541 0.26
542 0.23
543 0.25
544 0.25
545 0.31
546 0.29
547 0.3
548 0.29
549 0.33
550 0.33
551 0.33
552 0.35
553 0.3
554 0.28
555 0.26
556 0.24
557 0.2
558 0.18
559 0.11
560 0.05
561 0.05
562 0.07
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.12
568 0.13
569 0.14
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.16
574 0.17
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.14
581 0.13
582 0.15
583 0.15
584 0.16
585 0.17
586 0.21
587 0.22
588 0.2
589 0.21
590 0.24
591 0.24
592 0.24
593 0.23
594 0.21
595 0.21
596 0.23
597 0.21
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.14
602 0.12
603 0.11
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.03
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.07
626 0.08
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.07
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.08
647 0.08
648 0.09
649 0.13
650 0.17
651 0.2
652 0.2
653 0.2
654 0.24
655 0.26
656 0.29
657 0.32
658 0.31
659 0.29
660 0.3
661 0.3
662 0.26
663 0.25
664 0.22
665 0.15
666 0.13
667 0.13
668 0.11
669 0.13
670 0.12
671 0.1
672 0.1
673 0.12
674 0.12
675 0.13
676 0.13
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.11
684 0.1
685 0.08
686 0.08
687 0.06
688 0.06
689 0.04
690 0.03
691 0.03
692 0.04
693 0.06
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.07
703 0.1
704 0.1
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.11
711 0.11
712 0.16
713 0.18
714 0.18
715 0.23
716 0.23
717 0.22
718 0.23
719 0.22
720 0.18
721 0.16
722 0.15
723 0.11
724 0.1
725 0.09
726 0.07
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.09
733 0.11
734 0.14
735 0.15
736 0.16
737 0.16
738 0.16
739 0.18
740 0.18
741 0.22
742 0.21
743 0.22
744 0.23
745 0.22
746 0.21
747 0.21
748 0.25
749 0.2
750 0.19
751 0.17
752 0.16
753 0.18
754 0.19
755 0.18
756 0.16
757 0.17
758 0.17
759 0.23
760 0.22
761 0.22
762 0.24
763 0.24
764 0.28
765 0.35
766 0.41
767 0.43
768 0.45
769 0.49
770 0.47
771 0.49
772 0.43
773 0.39
774 0.35
775 0.28
776 0.26
777 0.22
778 0.22
779 0.19
780 0.23
781 0.24
782 0.24
783 0.23
784 0.27
785 0.26
786 0.3
787 0.37
788 0.35
789 0.31
790 0.3
791 0.29
792 0.27
793 0.27
794 0.22
795 0.16
796 0.13
797 0.12
798 0.16
799 0.2
800 0.18
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.17
805 0.17
806 0.11
807 0.15
808 0.18
809 0.18
810 0.18
811 0.19
812 0.19
813 0.2
814 0.2
815 0.11
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.08
820 0.07
821 0.07
822 0.07
823 0.08
824 0.08
825 0.07
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.04
831 0.04
832 0.04
833 0.06
834 0.07
835 0.09
836 0.12
837 0.14
838 0.15
839 0.2
840 0.21
841 0.24
842 0.3
843 0.31
844 0.31
845 0.36
846 0.36
847 0.32
848 0.32
849 0.33
850 0.32
851 0.35
852 0.39
853 0.34
854 0.35
855 0.38
856 0.41
857 0.41
858 0.38
859 0.35
860 0.3
861 0.3
862 0.32
863 0.28
864 0.27
865 0.24
866 0.27
867 0.24
868 0.27
869 0.29
870 0.28
871 0.28
872 0.27
873 0.27
874 0.2
875 0.19
876 0.16
877 0.11
878 0.08
879 0.08
880 0.06
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.05
885 0.05
886 0.05
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.07
893 0.08
894 0.08
895 0.08
896 0.1
897 0.1
898 0.09
899 0.11
900 0.11
901 0.16
902 0.22
903 0.25
904 0.28
905 0.29
906 0.31
907 0.32
908 0.36
909 0.34
910 0.33
911 0.31
912 0.29
913 0.29
914 0.28
915 0.3
916 0.24
917 0.22
918 0.17
919 0.15
920 0.13
921 0.12
922 0.12
923 0.09
924 0.1
925 0.1
926 0.13
927 0.12
928 0.12
929 0.12
930 0.12
931 0.1
932 0.14
933 0.14
934 0.15
935 0.17
936 0.18
937 0.19
938 0.2
939 0.22
940 0.2
941 0.23
942 0.26
943 0.24
944 0.26
945 0.27
946 0.28
947 0.29
948 0.31
949 0.31
950 0.27
951 0.3
952 0.28
953 0.29
954 0.31
955 0.32
956 0.3
957 0.31
958 0.32
959 0.3
960 0.3
961 0.3
962 0.27
963 0.23
964 0.19
965 0.17
966 0.14
967 0.12
968 0.11
969 0.08
970 0.09
971 0.09
972 0.11
973 0.11
974 0.14
975 0.14
976 0.15
977 0.16
978 0.15
979 0.16
980 0.2
981 0.2
982 0.17
983 0.17
984 0.18
985 0.19
986 0.18
987 0.18
988 0.15
989 0.12
990 0.12
991 0.13
992 0.12
993 0.12
994 0.14
995 0.13
996 0.16
997 0.15
998 0.15
999 0.15
1000 0.15
1001 0.16
1002 0.16
1003 0.18
1004 0.15
1005 0.16
1006 0.15
1007 0.16
1008 0.15
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.1
1012 0.12
1013 0.12
1014 0.13
1015 0.11
1016 0.11
1017 0.12
1018 0.1
1019 0.11
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.12
1024 0.13
1025 0.14
1026 0.15
1027 0.15
1028 0.18
1029 0.19
1030 0.19
1031 0.2
1032 0.2
1033 0.21
1034 0.21
1035 0.22
1036 0.18
1037 0.18
1038 0.18
1039 0.14
1040 0.13
1041 0.1
1042 0.08
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.07
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.08
1054 0.08
1055 0.08
1056 0.07
1057 0.07
1058 0.07
1059 0.08
1060 0.07
1061 0.05
1062 0.05
1063 0.05
1064 0.05
1065 0.05
1066 0.06
1067 0.05
1068 0.07
1069 0.1
1070 0.14
1071 0.17
1072 0.18
1073 0.2
1074 0.25
1075 0.27
1076 0.29
1077 0.28
1078 0.23
1079 0.22
1080 0.26
1081 0.24
1082 0.21
1083 0.19
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.17
1087 0.16
1088 0.12
1089 0.13
1090 0.14
1091 0.16
1092 0.14
1093 0.14
1094 0.14
1095 0.21
1096 0.28
1097 0.32
1098 0.37
1099 0.43
1100 0.47
1101 0.48
1102 0.49
1103 0.43
1104 0.36
1105 0.35
1106 0.28
1107 0.22
1108 0.17
1109 0.16
1110 0.14
1111 0.15
1112 0.15
1113 0.12
1114 0.12
1115 0.11
1116 0.12
1117 0.12
1118 0.11
1119 0.1
1120 0.13
1121 0.12
1122 0.16
1123 0.16
1124 0.19
1125 0.19
1126 0.19
1127 0.19
1128 0.16
1129 0.16
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.12
1133 0.13
1134 0.13
1135 0.16
1136 0.16
1137 0.15
1138 0.15
1139 0.14
1140 0.13
1141 0.11
1142 0.11
1143 0.07
1144 0.09
1145 0.08
1146 0.08
1147 0.11
1148 0.1
1149 0.1
1150 0.1
1151 0.11
1152 0.11
1153 0.14
1154 0.16
1155 0.15
1156 0.23
1157 0.26
1158 0.3
1159 0.31
1160 0.3
1161 0.28
1162 0.29
1163 0.29
1164 0.25
1165 0.24
1166 0.21
1167 0.2
1168 0.2
1169 0.22
1170 0.17
1171 0.17
1172 0.16
1173 0.18
1174 0.17
1175 0.17
1176 0.2
1177 0.22
1178 0.26
1179 0.27
1180 0.26
1181 0.28
1182 0.32
1183 0.37
1184 0.4
1185 0.43
1186 0.42
1187 0.42
1188 0.43
1189 0.38
1190 0.36
1191 0.3