Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XFX9

Protein Details
Accession R4XFX9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-383VAKAPKDKKAGKKGNAEKPKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-382AKAPKDKKAGKKGNAEKPK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 14.333, nucl 6, mito_nucl 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MTPQEKYDLITRNLQEVIGADDIKKILEERELIMYWGTAPTGKPHIAYFVPLTKIADFLKAGCKVKILMADLHAYLDNQKAPWELLKYRTAYYTAIVKTTLTSLSVPIEQLEFVQGTDYQLSEKYTLDVYRLSALVSQHDFKKAGAEVVKQTDNPPLSGLLYPGLQALDEEYLGVDCQFGGSDQRKIFTFAQEHLPQLGYKKRSHLMNAMVPGLMGTKMSSSDPDSKIDLLDDAKVVEKKIKKAFCEEGNVTTNGLLSFVKNILFPFQSLSGSTSIEFARKAEFGGDVKYTDYESLEKAFAARELHPGDLKKGVTSAINGLLDPIRSAWAENPELREITERAYPDPTKAAKATTGSNASGKDVAKAPKDKKAGKKGNAEKPKDISRIELRVGLIEDVKVHPDAESLYIEQISFGSNLPSRTVVSGLTKYIPIEEMKGRKVICICNLKPSKLRGVTSEAMVLCAATGKEEGSTSEAKVEFVDPPSVAEAGDLVTVEGFVGEHDEKNTKVWADVQADLKTDGDCIATYRGLPLKIGGEALRSKTLRDAPLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.31
3 0.24
4 0.24
5 0.19
6 0.18
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.13
13 0.12
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.1
26 0.1
27 0.14
28 0.19
29 0.2
30 0.21
31 0.21
32 0.25
33 0.24
34 0.27
35 0.26
36 0.26
37 0.28
38 0.28
39 0.29
40 0.25
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.19
45 0.18
46 0.25
47 0.3
48 0.32
49 0.29
50 0.3
51 0.27
52 0.3
53 0.32
54 0.27
55 0.23
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.2
70 0.23
71 0.24
72 0.27
73 0.33
74 0.34
75 0.34
76 0.35
77 0.33
78 0.28
79 0.27
80 0.29
81 0.24
82 0.23
83 0.22
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.16
123 0.18
124 0.2
125 0.2
126 0.24
127 0.24
128 0.21
129 0.25
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.23
134 0.24
135 0.28
136 0.3
137 0.26
138 0.27
139 0.29
140 0.27
141 0.24
142 0.21
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.09
168 0.12
169 0.18
170 0.18
171 0.2
172 0.2
173 0.25
174 0.26
175 0.26
176 0.26
177 0.22
178 0.3
179 0.3
180 0.3
181 0.26
182 0.26
183 0.21
184 0.22
185 0.27
186 0.23
187 0.23
188 0.27
189 0.3
190 0.32
191 0.35
192 0.36
193 0.35
194 0.35
195 0.35
196 0.31
197 0.27
198 0.24
199 0.21
200 0.16
201 0.11
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.1
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.21
213 0.21
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.15
225 0.17
226 0.23
227 0.3
228 0.33
229 0.32
230 0.37
231 0.42
232 0.39
233 0.43
234 0.38
235 0.35
236 0.34
237 0.33
238 0.27
239 0.22
240 0.2
241 0.13
242 0.12
243 0.08
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.19
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.12
317 0.15
318 0.16
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.15
328 0.15
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.24
333 0.23
334 0.23
335 0.23
336 0.22
337 0.19
338 0.2
339 0.21
340 0.2
341 0.21
342 0.2
343 0.21
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.19
348 0.17
349 0.19
350 0.22
351 0.25
352 0.33
353 0.35
354 0.39
355 0.46
356 0.52
357 0.57
358 0.64
359 0.68
360 0.68
361 0.76
362 0.77
363 0.81
364 0.83
365 0.79
366 0.72
367 0.68
368 0.67
369 0.61
370 0.52
371 0.47
372 0.44
373 0.43
374 0.4
375 0.37
376 0.3
377 0.27
378 0.27
379 0.22
380 0.17
381 0.13
382 0.13
383 0.1
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.1
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.16
411 0.17
412 0.18
413 0.18
414 0.18
415 0.17
416 0.17
417 0.17
418 0.14
419 0.16
420 0.21
421 0.24
422 0.26
423 0.3
424 0.29
425 0.3
426 0.34
427 0.34
428 0.36
429 0.41
430 0.4
431 0.46
432 0.51
433 0.52
434 0.53
435 0.53
436 0.55
437 0.5
438 0.51
439 0.44
440 0.47
441 0.44
442 0.4
443 0.41
444 0.31
445 0.26
446 0.24
447 0.2
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.07
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.14
459 0.13
460 0.18
461 0.18
462 0.18
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.19
467 0.21
468 0.16
469 0.17
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.12
474 0.1
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.03
485 0.08
486 0.1
487 0.11
488 0.14
489 0.17
490 0.18
491 0.2
492 0.23
493 0.19
494 0.19
495 0.22
496 0.26
497 0.28
498 0.31
499 0.35
500 0.33
501 0.35
502 0.34
503 0.31
504 0.24
505 0.2
506 0.17
507 0.13
508 0.11
509 0.11
510 0.13
511 0.13
512 0.14
513 0.18
514 0.22
515 0.21
516 0.22
517 0.22
518 0.21
519 0.21
520 0.23
521 0.19
522 0.2
523 0.24
524 0.27
525 0.33
526 0.31
527 0.31
528 0.36
529 0.42