Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XAT2

Protein Details
Accession R4XAT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-59EDLLRQRKSTNLSRKRQPFDRLRQILPHydrophilic
499-520HDVVSIKYKQRQEKRISYWLEHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cysk 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd18727  PIN_Swt1-like  
Amino Acid Sequences MALPNPPPAAIEDTGDVIMLDIDDPPTVLAITEDLLRQRKSTNLSRKRQPFDRLRQILPSDVAGLFIVDTNFAISHLSIIKGLVDSYKSSKALVLIPWVVVQELDGLKTASSDYGQANLATLARNAVRYIYDCLRSSLVGLRGQKMNECLAAGEFGDDAILDCARYWHEKQDLKSVLLSNDRNLCTKIMIHGMTSISHEPGLSAASILESTRNSWHESLENIPSFTTDKMAEECSMSEDFAETMEIDESPEFVEIHNHMTSSPETQTRSSPAQSTMQTEVVVAPLFNPKSTGPDPFAALAARAGISRFETISQAANTSGGLSDQSHGNSRLSKSPVQRHSPKFSRSRTQSPDTLDLRRYSRSSVDQGHSQVPRRSSIEESLSSRNNAQEILRDLETTMVSALPSLIRKQMKRELHDTDSVDFLLQDGMDTIEAITKTIVKNWFVCFGHMFPEHKKDAGAYIQTLSSNLRQYLHSFKQSQSQADRLARGWIEVWRRLSDHDVVSIKYKQRQEKRISYWLEHLKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.16
4 0.1
5 0.09
6 0.07
7 0.06
8 0.05
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.08
20 0.1
21 0.16
22 0.21
23 0.23
24 0.24
25 0.25
26 0.3
27 0.36
28 0.44
29 0.5
30 0.55
31 0.64
32 0.73
33 0.8
34 0.83
35 0.84
36 0.83
37 0.83
38 0.83
39 0.85
40 0.81
41 0.74
42 0.73
43 0.67
44 0.61
45 0.51
46 0.41
47 0.33
48 0.26
49 0.24
50 0.17
51 0.14
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.06
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.13
73 0.17
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.24
80 0.23
81 0.23
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.18
86 0.16
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.18
117 0.2
118 0.23
119 0.23
120 0.25
121 0.25
122 0.24
123 0.23
124 0.23
125 0.23
126 0.23
127 0.25
128 0.26
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.27
133 0.24
134 0.2
135 0.18
136 0.15
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.07
152 0.12
153 0.13
154 0.18
155 0.26
156 0.31
157 0.33
158 0.42
159 0.43
160 0.4
161 0.41
162 0.37
163 0.32
164 0.34
165 0.33
166 0.26
167 0.3
168 0.3
169 0.29
170 0.28
171 0.26
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.17
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.07
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.2
207 0.2
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.14
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.07
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.18
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.21
260 0.21
261 0.23
262 0.22
263 0.2
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.12
268 0.11
269 0.07
270 0.06
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.11
275 0.1
276 0.16
277 0.17
278 0.19
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.18
283 0.19
284 0.13
285 0.12
286 0.09
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.18
317 0.23
318 0.26
319 0.3
320 0.35
321 0.43
322 0.49
323 0.54
324 0.61
325 0.62
326 0.68
327 0.69
328 0.7
329 0.69
330 0.68
331 0.69
332 0.67
333 0.7
334 0.67
335 0.65
336 0.62
337 0.58
338 0.6
339 0.54
340 0.51
341 0.45
342 0.41
343 0.38
344 0.37
345 0.34
346 0.28
347 0.28
348 0.29
349 0.31
350 0.34
351 0.35
352 0.36
353 0.37
354 0.41
355 0.41
356 0.42
357 0.41
358 0.36
359 0.37
360 0.35
361 0.35
362 0.31
363 0.32
364 0.31
365 0.31
366 0.33
367 0.34
368 0.34
369 0.33
370 0.31
371 0.28
372 0.24
373 0.22
374 0.18
375 0.18
376 0.19
377 0.22
378 0.21
379 0.2
380 0.19
381 0.2
382 0.19
383 0.15
384 0.11
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.1
392 0.17
393 0.23
394 0.25
395 0.32
396 0.41
397 0.46
398 0.5
399 0.56
400 0.56
401 0.54
402 0.59
403 0.54
404 0.46
405 0.4
406 0.35
407 0.28
408 0.2
409 0.16
410 0.11
411 0.08
412 0.07
413 0.05
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.11
423 0.12
424 0.17
425 0.21
426 0.21
427 0.24
428 0.26
429 0.34
430 0.31
431 0.33
432 0.31
433 0.28
434 0.31
435 0.32
436 0.33
437 0.3
438 0.37
439 0.36
440 0.34
441 0.34
442 0.28
443 0.28
444 0.31
445 0.29
446 0.23
447 0.22
448 0.23
449 0.23
450 0.23
451 0.22
452 0.2
453 0.22
454 0.22
455 0.22
456 0.22
457 0.26
458 0.34
459 0.39
460 0.42
461 0.41
462 0.41
463 0.49
464 0.51
465 0.55
466 0.51
467 0.49
468 0.5
469 0.51
470 0.52
471 0.44
472 0.46
473 0.39
474 0.34
475 0.31
476 0.29
477 0.31
478 0.34
479 0.37
480 0.35
481 0.36
482 0.37
483 0.4
484 0.39
485 0.34
486 0.35
487 0.34
488 0.32
489 0.37
490 0.41
491 0.42
492 0.45
493 0.51
494 0.54
495 0.61
496 0.7
497 0.74
498 0.78
499 0.8
500 0.82
501 0.81
502 0.75
503 0.75