Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X6D2

Protein Details
Accession R4X6D2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-223VSPLPQKQAKKEKKEKKEKGPKETKAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-221KQAKKEKKEKKEKGPKETK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.166, nucl 11, cyto 10, mito_nucl 7.832, cyto_mito 7.332, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010987  Glutathione-S-Trfase_C-like  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR004046  GST_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0004812  F:aminoacyl-tRNA ligase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00043  GST_C  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50405  GST_CTER  
PS50886  TRBD  
CDD cd10289  GST_C_AaRS_like  
cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MASVQISKDDGILSLVSHVFSSTTARPVEEAISTLTLDDKSTIAGPNTISTSLASRDDRIGLSDIEKAEVQQWLTVSARQVDDERLLELNTYLAQQTFLVGNDWTVADIVSCARLQTEISAWDAKKQSEYCHITRWFNHIQHLPEVSSFTALKTVDLTQKFDKDVTVAIKKGAPKESVPKDATKADPAQPATTATSVSPLPQKQAKKEKKEKKEKGPKETKAPAEATLSPSLISLKVGHIQKAVLHPDADSLYVSTVDLGEAEPRTVVSGLVKYIPLEAMQGRKVVCVCNLKPAAMRGIKSSAMVLAASPRVGEGQVKDMVELVTPPDDAQPGDVLSFDGFPGEPEPQLNPKKKIFEQIQVGFSTDESLQVIYSDINDGSDKVGKLVNKAGKVCTVETLINASIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.15
9 0.15
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.22
15 0.23
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.17
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.23
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.18
49 0.18
50 0.2
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.21
70 0.19
71 0.19
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.17
108 0.17
109 0.22
110 0.24
111 0.23
112 0.27
113 0.27
114 0.27
115 0.32
116 0.38
117 0.34
118 0.4
119 0.44
120 0.43
121 0.44
122 0.48
123 0.46
124 0.41
125 0.45
126 0.4
127 0.39
128 0.38
129 0.37
130 0.31
131 0.24
132 0.23
133 0.18
134 0.16
135 0.13
136 0.1
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.18
143 0.19
144 0.23
145 0.22
146 0.24
147 0.25
148 0.23
149 0.21
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.19
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.22
158 0.25
159 0.25
160 0.22
161 0.21
162 0.3
163 0.33
164 0.38
165 0.37
166 0.35
167 0.35
168 0.36
169 0.35
170 0.3
171 0.28
172 0.25
173 0.27
174 0.27
175 0.24
176 0.22
177 0.22
178 0.19
179 0.16
180 0.13
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.12
187 0.15
188 0.2
189 0.22
190 0.28
191 0.39
192 0.47
193 0.53
194 0.64
195 0.71
196 0.76
197 0.85
198 0.86
199 0.87
200 0.89
201 0.87
202 0.87
203 0.88
204 0.81
205 0.78
206 0.76
207 0.67
208 0.6
209 0.54
210 0.44
211 0.37
212 0.34
213 0.28
214 0.23
215 0.21
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.1
220 0.1
221 0.07
222 0.07
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.2
230 0.22
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.1
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.21
274 0.26
275 0.25
276 0.32
277 0.33
278 0.32
279 0.33
280 0.33
281 0.36
282 0.31
283 0.31
284 0.24
285 0.27
286 0.26
287 0.25
288 0.23
289 0.16
290 0.13
291 0.13
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.09
302 0.13
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.15
334 0.23
335 0.33
336 0.39
337 0.44
338 0.48
339 0.55
340 0.57
341 0.63
342 0.6
343 0.59
344 0.61
345 0.61
346 0.58
347 0.52
348 0.5
349 0.41
350 0.35
351 0.29
352 0.19
353 0.14
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.2
371 0.2
372 0.23
373 0.32
374 0.35
375 0.37
376 0.39
377 0.4
378 0.42
379 0.44
380 0.42
381 0.37
382 0.34
383 0.28
384 0.27
385 0.29