Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4SD89

Protein Details
Accession F4SD89    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-131SPYGGSRAGRVKRKRAKKADAGEEAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-123RAGRVKRKRAKK
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 12, nucl 7.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR005710  Ribosomal_S4/S9_euk/arc  
IPR018079  Ribosomal_S4_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_41264  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00632  RIBOSOMAL_S4  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences RELLKLEDKDPKRLFEGNALIRRLVRIGVLDEARMRLDYVLALKIEDFMERRLQTQVFKSGLAKSIHHARVLIRQRHIRVGKQIVNVPSFVVRLDSQKHIDFALTSPYGGSRAGRVKRKRAKKADAGEEAGEEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.48
4 0.47
5 0.5
6 0.48
7 0.45
8 0.41
9 0.4
10 0.33
11 0.24
12 0.16
13 0.11
14 0.12
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.22
43 0.26
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.24
49 0.24
50 0.21
51 0.18
52 0.26
53 0.26
54 0.25
55 0.25
56 0.2
57 0.27
58 0.35
59 0.37
60 0.34
61 0.37
62 0.38
63 0.46
64 0.48
65 0.42
66 0.4
67 0.43
68 0.43
69 0.41
70 0.44
71 0.39
72 0.37
73 0.34
74 0.28
75 0.21
76 0.17
77 0.14
78 0.12
79 0.1
80 0.12
81 0.15
82 0.18
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.21
87 0.2
88 0.18
89 0.15
90 0.18
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.21
100 0.29
101 0.38
102 0.46
103 0.56
104 0.65
105 0.76
106 0.81
107 0.83
108 0.85
109 0.85
110 0.88
111 0.87
112 0.83
113 0.76
114 0.66
115 0.57
116 0.48