Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDC0

Protein Details
Accession R4XDC0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-71VTLQSKFKEKPKFRQRAAKWSLVHydrophilic
271-310MLTADKQKHKKRPSEVPPLPATPKQKYRKLSPREEREKGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-303KHKKRPSEVPPLPATPKQKYRKLSPR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032563  DAMP1_SANT-like  
IPR008468  DMAP1  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR027109  Swc4/Dmap1  
Gene Ontology GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0043968  P:histone H2A acetylation  
GO:0043967  P:histone H4 acetylation  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05499  DMAP1  
PF16282  SANT_DAMP1_like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
Amino Acid Sequences MSAADIRDVLGMGDLGPATKKLKLSTDKRAEGMSRELYNLIGNSSPPVVTLQSKFKEKPKFRQRAAKWSLVTFKNGGRSDDLQLSHWTRGISSSDAAEQPYRFEAFNKHADVITYTKEEYSTYLEKSGWTKDDTDLLIELCTQFDLRFIVIHDRWSDYSKTPKTIEQLKDRYYGVARSLLASRGQSTEGLSYDYQKETTRKQYLEELFNRTPEQIEEEHRLLMESRRLEANEKTLAQQKADLIRLLETPIEQGSAEQYMSSAGYGSLAQSMLTADKQKHKKRPSEVPPLPATPKQKYRKLSPREEREKGVSWHDKLSGGVYLRSQKTVALKQTFATKVQAAMQELGMSNVLTMPTEKTVRKFDQLQQKIGILLEAKRVCDRVAETSDVKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.11
5 0.12
6 0.16
7 0.18
8 0.2
9 0.29
10 0.38
11 0.45
12 0.54
13 0.62
14 0.63
15 0.62
16 0.63
17 0.57
18 0.51
19 0.5
20 0.44
21 0.36
22 0.33
23 0.32
24 0.28
25 0.28
26 0.24
27 0.19
28 0.14
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.17
37 0.2
38 0.27
39 0.32
40 0.39
41 0.43
42 0.49
43 0.58
44 0.61
45 0.69
46 0.71
47 0.76
48 0.77
49 0.83
50 0.82
51 0.82
52 0.81
53 0.78
54 0.69
55 0.64
56 0.64
57 0.56
58 0.52
59 0.44
60 0.4
61 0.41
62 0.4
63 0.37
64 0.33
65 0.34
66 0.34
67 0.37
68 0.35
69 0.28
70 0.32
71 0.33
72 0.3
73 0.29
74 0.25
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.18
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.15
90 0.16
91 0.19
92 0.22
93 0.28
94 0.29
95 0.27
96 0.26
97 0.27
98 0.27
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.23
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.22
120 0.2
121 0.19
122 0.16
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.14
137 0.14
138 0.17
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.22
143 0.23
144 0.19
145 0.28
146 0.28
147 0.31
148 0.31
149 0.32
150 0.34
151 0.4
152 0.44
153 0.44
154 0.47
155 0.46
156 0.47
157 0.45
158 0.42
159 0.34
160 0.29
161 0.21
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.16
184 0.18
185 0.26
186 0.3
187 0.28
188 0.29
189 0.36
190 0.38
191 0.43
192 0.42
193 0.41
194 0.37
195 0.38
196 0.37
197 0.29
198 0.26
199 0.18
200 0.18
201 0.12
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.15
209 0.16
210 0.17
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.2
221 0.26
222 0.26
223 0.24
224 0.24
225 0.23
226 0.24
227 0.24
228 0.23
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.13
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.11
261 0.13
262 0.23
263 0.33
264 0.42
265 0.51
266 0.59
267 0.66
268 0.71
269 0.79
270 0.79
271 0.81
272 0.77
273 0.74
274 0.7
275 0.65
276 0.61
277 0.56
278 0.53
279 0.49
280 0.54
281 0.55
282 0.59
283 0.6
284 0.67
285 0.71
286 0.74
287 0.78
288 0.79
289 0.81
290 0.83
291 0.82
292 0.76
293 0.71
294 0.68
295 0.59
296 0.58
297 0.55
298 0.48
299 0.46
300 0.43
301 0.39
302 0.33
303 0.32
304 0.27
305 0.21
306 0.2
307 0.2
308 0.26
309 0.27
310 0.28
311 0.26
312 0.25
313 0.31
314 0.36
315 0.42
316 0.38
317 0.38
318 0.38
319 0.46
320 0.45
321 0.4
322 0.37
323 0.29
324 0.26
325 0.3
326 0.32
327 0.26
328 0.25
329 0.23
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.15
334 0.12
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.13
342 0.19
343 0.22
344 0.26
345 0.34
346 0.38
347 0.44
348 0.48
349 0.52
350 0.58
351 0.61
352 0.61
353 0.56
354 0.53
355 0.48
356 0.41
357 0.36
358 0.27
359 0.23
360 0.27
361 0.26
362 0.27
363 0.29
364 0.3
365 0.28
366 0.29
367 0.3
368 0.29
369 0.32
370 0.35
371 0.34