Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X845

Protein Details
Accession R4X845    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MLRTIKPKNARTKRVLDERAAHydrophilic
241-263MKMALKRPTKQVPKTKKNIGTDSHydrophilic
280-299SMQTRKFKGLKRSRDNEEDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTIKPKNARTKRVLDERAAKLVENTKQAIFIKGQTANAITQQAMQDLMTLKKPDAQSFSKNNNNILPFEDPASIEFFSEKNDASLFVIGSHSKKRPNNLVLARTFDSQILDMVEVGVENPKFLSDFKNVKCNVGMRPLMLFSGPLFESHPSFRHIKSYFMDFFRGREIQTIDAVSLQHVMVFSHTDSSDSSILPPVHLRVYLIRAHKSGQKLPRVELEEMGPRLDFRVRRLQEADEGAMKMALKRPTKQVPKTKKNIGTDSMGDKIAQIHLGKQDLDSMQTRKFKGLKRSRDNEEDEEPVYEIEEDIVSGSEDEAPKRIKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.77
4 0.76
5 0.71
6 0.7
7 0.61
8 0.52
9 0.45
10 0.47
11 0.44
12 0.39
13 0.37
14 0.3
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.29
19 0.27
20 0.29
21 0.29
22 0.29
23 0.26
24 0.26
25 0.24
26 0.25
27 0.23
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.3
44 0.33
45 0.37
46 0.44
47 0.52
48 0.55
49 0.55
50 0.54
51 0.53
52 0.5
53 0.43
54 0.38
55 0.33
56 0.26
57 0.25
58 0.23
59 0.18
60 0.17
61 0.19
62 0.16
63 0.13
64 0.13
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.19
80 0.21
81 0.28
82 0.31
83 0.36
84 0.44
85 0.46
86 0.53
87 0.54
88 0.57
89 0.51
90 0.54
91 0.5
92 0.42
93 0.38
94 0.29
95 0.23
96 0.17
97 0.15
98 0.11
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.12
113 0.15
114 0.23
115 0.24
116 0.33
117 0.33
118 0.34
119 0.35
120 0.33
121 0.29
122 0.28
123 0.27
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.15
129 0.13
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.16
141 0.15
142 0.22
143 0.22
144 0.24
145 0.24
146 0.28
147 0.28
148 0.27
149 0.31
150 0.24
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.13
190 0.18
191 0.2
192 0.22
193 0.22
194 0.24
195 0.27
196 0.3
197 0.34
198 0.36
199 0.4
200 0.4
201 0.41
202 0.46
203 0.46
204 0.42
205 0.36
206 0.32
207 0.29
208 0.28
209 0.27
210 0.2
211 0.15
212 0.16
213 0.2
214 0.18
215 0.17
216 0.28
217 0.28
218 0.33
219 0.35
220 0.36
221 0.36
222 0.37
223 0.34
224 0.26
225 0.25
226 0.2
227 0.19
228 0.17
229 0.14
230 0.17
231 0.22
232 0.23
233 0.26
234 0.34
235 0.43
236 0.53
237 0.61
238 0.66
239 0.7
240 0.77
241 0.83
242 0.85
243 0.83
244 0.8
245 0.77
246 0.7
247 0.63
248 0.57
249 0.52
250 0.44
251 0.37
252 0.29
253 0.24
254 0.21
255 0.17
256 0.17
257 0.14
258 0.15
259 0.18
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.23
264 0.19
265 0.23
266 0.24
267 0.24
268 0.29
269 0.35
270 0.36
271 0.39
272 0.45
273 0.49
274 0.55
275 0.62
276 0.66
277 0.7
278 0.77
279 0.78
280 0.8
281 0.8
282 0.74
283 0.69
284 0.61
285 0.52
286 0.45
287 0.38
288 0.29
289 0.23
290 0.17
291 0.13
292 0.1
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.11
301 0.13
302 0.14
303 0.19