FuNGI

R4XE85

Protein Details

Accession

R4XE85

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
61-80	ASKITFKPKAVQRRRKDGAS	Hydrophilic
451-478	AAAAAPEVPKKKKKKPKPMTFPPPEGCI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-75	PKAVQRRR
459-468	PKKKKKKPKP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKRAESPGEAPIPLPRLTRRPSGNTSTNGVENPIDPDAPREGRLASLKARPTASTRGSASKITFKPKAVQRRRKDGASESLLNLGGNEDDSDMSGPHLRRAERGRGVGRGSGRGSRVEALLQASGPFAQGPAMASVSNSRGRGGSSFTGGRSTATSGPVRTMTSTKKETGKSVKDNEEEANFDDAGQPMQNLLRMRDDTSDFWAPVTTERIERTQTEKKIALPGAAEKLVKVKKEAEDLGFIDVKTEPTESTLTSRVPSPEAAQTEDIQMSEIEAQPSAPGGDIDEDDIALPGMEAPVATKAIEGKPKVEEKGKPVFKVMTVEEAEEQDRLSTDLESLRMTLDRDPTIDEGQEQLIFIQLPEVLPFWAPGQDDTKNDGFAKEEEVKHEIVEIDQIAEDRKSQKDDPSADPEPSDIALPSSETAKAREVVSAKPDSNSTAEARTTVPGTAAAAAPEVPKKKKKKPKPMTFPPPEGCIGQLHVHRSGKITCEWGGIMMDVGTGSECGFLQEVVVVDPKTDKTAWSLGRVASRMMMTPNLDDLLGVRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.34
3	0.32
4	0.3
5	0.35
6	0.4
7	0.48
8	0.5
9	0.54
10	0.59
11	0.64
12	0.66
13	0.61
14	0.61
15	0.56
16	0.51
17	0.43
18	0.38
19	0.31
20	0.24
21	0.24
22	0.21
23	0.19
24	0.16
25	0.19
26	0.23
27	0.25
28	0.25
29	0.23
30	0.22
31	0.26
32	0.3
33	0.31
34	0.29
35	0.34
36	0.37
37	0.4
38	0.41
39	0.38
40	0.39
41	0.43
42	0.42
43	0.4
44	0.39
45	0.41
46	0.42
47	0.44
48	0.42
49	0.43
50	0.44
51	0.47
52	0.48
53	0.45
54	0.52
55	0.56
56	0.65
57	0.66
58	0.72
59	0.73
60	0.79
61	0.82
62	0.79
63	0.75
64	0.71
65	0.69
66	0.65
67	0.59
68	0.5
69	0.46
70	0.41
71	0.35
72	0.28
73	0.2
74	0.12
75	0.09
76	0.09
77	0.07
78	0.06
79	0.07
80	0.08
81	0.07
82	0.09
83	0.14
84	0.14
85	0.18
86	0.23
87	0.23
88	0.29
89	0.35
90	0.43
91	0.44
92	0.5
93	0.49
94	0.49
95	0.5
96	0.48
97	0.44
98	0.39
99	0.36
100	0.33
101	0.31
102	0.28
103	0.28
104	0.25
105	0.23
106	0.19
107	0.19
108	0.16
109	0.15
110	0.14
111	0.12
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.07
116	0.06
117	0.05
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.08
122	0.07
123	0.08
124	0.1
125	0.13
126	0.17
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.16
131	0.17
132	0.2
133	0.17
134	0.18
135	0.19
136	0.18
137	0.2
138	0.19
139	0.19
140	0.15
141	0.17
142	0.15
143	0.18
144	0.19
145	0.17
146	0.19
147	0.2
148	0.2
149	0.18
150	0.2
151	0.22
152	0.26
153	0.3
154	0.32
155	0.37
156	0.38
157	0.43
158	0.48
159	0.51
160	0.52
161	0.55
162	0.58
163	0.53
164	0.54
165	0.49
166	0.42
167	0.35
168	0.3
169	0.25
170	0.18
171	0.16
172	0.15
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.15
183	0.16
184	0.17
185	0.19
186	0.21
187	0.19
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.2
192	0.19
193	0.16
194	0.15
195	0.17
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.16
200	0.17
201	0.19
202	0.25
203	0.3
204	0.31
205	0.34
206	0.33
207	0.33
208	0.37
209	0.35
210	0.29
211	0.22
212	0.22
213	0.2
214	0.2
215	0.18
216	0.12
217	0.19
218	0.2
219	0.2
220	0.19
221	0.21
222	0.21
223	0.25
224	0.27
225	0.21
226	0.22
227	0.22
228	0.22
229	0.2
230	0.18
231	0.15
232	0.13
233	0.12
234	0.1
235	0.1
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.14
245	0.13
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.15
250	0.15
251	0.17
252	0.16
253	0.16
254	0.16
255	0.15
256	0.13
257	0.1
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.03
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.07
291	0.09
292	0.14
293	0.15
294	0.15
295	0.19
296	0.22
297	0.24
298	0.27
299	0.28
300	0.29
301	0.38
302	0.4
303	0.37
304	0.36
305	0.35
306	0.3
307	0.31
308	0.26
309	0.21
310	0.18
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.17
315	0.14
316	0.13
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.11
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.15
335	0.17
336	0.17
337	0.16
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.09
358	0.1
359	0.13
360	0.16
361	0.17
362	0.21
363	0.22
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.19
368	0.17
369	0.21
370	0.22
371	0.22
372	0.23
373	0.25
374	0.25
375	0.23
376	0.23
377	0.18
378	0.12
379	0.13
380	0.1
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.11
387	0.13
388	0.15
389	0.2
390	0.22
391	0.27
392	0.33
393	0.38
394	0.41
395	0.46
396	0.46
397	0.42
398	0.4
399	0.34
400	0.28
401	0.23
402	0.19
403	0.1
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.09
409	0.11
410	0.12
411	0.14
412	0.15
413	0.17
414	0.17
415	0.21
416	0.21
417	0.21
418	0.26
419	0.29
420	0.27
421	0.27
422	0.27
423	0.25
424	0.25
425	0.25
426	0.21
427	0.19
428	0.19
429	0.19
430	0.2
431	0.19
432	0.18
433	0.15
434	0.14
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.16
444	0.21
445	0.27
446	0.36
447	0.45
448	0.55
449	0.66
450	0.75
451	0.81
452	0.87
453	0.91
454	0.93
455	0.95
456	0.95
457	0.93
458	0.91
459	0.83
460	0.75
461	0.66
462	0.56
463	0.46
464	0.36
465	0.3
466	0.27
467	0.27
468	0.26
469	0.31
470	0.33
471	0.33
472	0.35
473	0.34
474	0.32
475	0.31
476	0.31
477	0.25
478	0.26
479	0.25
480	0.22
481	0.2
482	0.17
483	0.14
484	0.1
485	0.09
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.09
499	0.1
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.15
504	0.16
505	0.19
506	0.18
507	0.18
508	0.19
509	0.28
510	0.3
511	0.32
512	0.35
513	0.34
514	0.4
515	0.4
516	0.36
517	0.31
518	0.29
519	0.26
520	0.25
521	0.26
522	0.22
523	0.22
524	0.23
525	0.21
526	0.2
527	0.17

R4XE85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer