Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XHC6

Protein Details
Accession R4XHC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-63IVRGSRSEPKQKKIKVQSSKRKFDFDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-49KK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, pero 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MAGYESWSTQDLISRIKDLESRCETDGKDHGHVSSNIVRGSRSEPKQKKIKVQSSKRKFDFDKYQQKYVAFKFAYLGWHYNGLVTQDMPTELPTVEEEIFKALIKTHLISHPDECRFSRCGRTDKGVSAMGQVMALNVRSAFLKDRPSGEADATTKELAWLEQLNGCLPPSIRILAYDDQIAPTFDARFSCRKRHYKYLLAPRVPGAAALNRDAMNVACSYLVGDHDFRNFCKLDASKQISNFHRTILRCEISDLIPPQSDTLADSSLGLYVLDLEGTAFLWHQVRCITAILLLVGQGLEEPEVVRELLDISKTPTKPIYEMADDWPLTLYDCDFGDQVNWKHSVQSQRIFERTFATLHEARIKDAISSFMVDAAAISVNQEATKPGTNLGDGRIKVQANYVPLMQRKRMADVVTLNAAFAEKKERKMVEKRRLEVDPDVHMATT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.26
4 0.3
5 0.28
6 0.35
7 0.37
8 0.39
9 0.38
10 0.42
11 0.4
12 0.41
13 0.46
14 0.41
15 0.39
16 0.36
17 0.36
18 0.37
19 0.37
20 0.37
21 0.37
22 0.35
23 0.33
24 0.32
25 0.31
26 0.27
27 0.34
28 0.38
29 0.38
30 0.46
31 0.52
32 0.6
33 0.7
34 0.74
35 0.78
36 0.79
37 0.83
38 0.82
39 0.86
40 0.88
41 0.89
42 0.92
43 0.86
44 0.84
45 0.77
46 0.75
47 0.75
48 0.75
49 0.75
50 0.71
51 0.73
52 0.68
53 0.67
54 0.65
55 0.56
56 0.55
57 0.44
58 0.39
59 0.33
60 0.32
61 0.33
62 0.3
63 0.3
64 0.21
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.15
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.2
95 0.23
96 0.24
97 0.27
98 0.33
99 0.34
100 0.36
101 0.34
102 0.33
103 0.33
104 0.34
105 0.39
106 0.37
107 0.41
108 0.42
109 0.48
110 0.47
111 0.46
112 0.47
113 0.4
114 0.34
115 0.29
116 0.26
117 0.19
118 0.16
119 0.14
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.1
129 0.13
130 0.18
131 0.2
132 0.22
133 0.24
134 0.27
135 0.27
136 0.25
137 0.25
138 0.21
139 0.21
140 0.2
141 0.18
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.19
176 0.22
177 0.31
178 0.39
179 0.48
180 0.53
181 0.62
182 0.66
183 0.67
184 0.72
185 0.74
186 0.74
187 0.66
188 0.61
189 0.52
190 0.47
191 0.37
192 0.29
193 0.19
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.26
223 0.32
224 0.31
225 0.34
226 0.4
227 0.38
228 0.43
229 0.39
230 0.32
231 0.32
232 0.29
233 0.31
234 0.31
235 0.29
236 0.24
237 0.25
238 0.25
239 0.21
240 0.23
241 0.2
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.08
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.19
300 0.19
301 0.21
302 0.23
303 0.24
304 0.24
305 0.28
306 0.28
307 0.24
308 0.26
309 0.27
310 0.3
311 0.28
312 0.27
313 0.24
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.12
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.22
328 0.21
329 0.23
330 0.28
331 0.34
332 0.35
333 0.41
334 0.44
335 0.47
336 0.51
337 0.5
338 0.47
339 0.41
340 0.36
341 0.29
342 0.24
343 0.25
344 0.23
345 0.25
346 0.32
347 0.29
348 0.28
349 0.3
350 0.29
351 0.23
352 0.21
353 0.21
354 0.14
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.11
371 0.15
372 0.15
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.21
377 0.24
378 0.28
379 0.24
380 0.26
381 0.29
382 0.28
383 0.27
384 0.3
385 0.29
386 0.25
387 0.26
388 0.27
389 0.28
390 0.33
391 0.39
392 0.38
393 0.41
394 0.4
395 0.43
396 0.45
397 0.41
398 0.4
399 0.38
400 0.39
401 0.38
402 0.36
403 0.3
404 0.26
405 0.25
406 0.19
407 0.16
408 0.23
409 0.21
410 0.26
411 0.34
412 0.38
413 0.46
414 0.57
415 0.67
416 0.67
417 0.73
418 0.73
419 0.73
420 0.72
421 0.69
422 0.66
423 0.59
424 0.54
425 0.48