Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDR0

Protein Details
Accession R4XDR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-394TVPWLLPPRKRKLKIPRPGFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-401PRKRKLKIPRPGFTAERKKSA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MDHDISYEVEDEAQFWQEVDDIIQPTSTTPSAIQNVVNNFISFVSQFGADYLTTDADVEICCEKLLDSDFHMDNAELVREAMIAYQPEQDKIAKCYVNLYLLLLDGRKNTRTFKLMKRAHMVPVIANWAKQHQVDSIRFTRLALTTLYEMCRMQKLSEADMHCFDEEFIWFLLRSVEISRDDDDPYSYNCIKVIVSLNEQFMVAGLPQAQQPFPRTSSNTSLSVASIETTGPHQAQNSIVKVLSDHGSRFKAFGENLIRMLNRERDTALQLLILKQLFLLFTNAATYEYFYTNDLHVLIDVFIRELYNLPTEDEALRHTYLRVLHPLLIHTQLRHAPFYKATEMVNLLTSLNQECSHFGPVGTTTVRLLARCLTVPWLLPPRKRKLKIPRPGFTAERKKSAKNLGMSLDQSETASIASFHSVNSIAKVRPPTTPRIKPPVKDKGNASARLEQSHLAPVTEGVTTASNGGQGKSAMVDSVELSAQATEKHDDLMREIGKLEISA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.18
14 0.16
15 0.13
16 0.13
17 0.19
18 0.23
19 0.25
20 0.26
21 0.27
22 0.3
23 0.33
24 0.33
25 0.26
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.16
30 0.14
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.14
53 0.13
54 0.15
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.19
76 0.22
77 0.22
78 0.25
79 0.31
80 0.27
81 0.26
82 0.29
83 0.29
84 0.28
85 0.26
86 0.23
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.19
95 0.21
96 0.25
97 0.28
98 0.34
99 0.39
100 0.45
101 0.52
102 0.55
103 0.6
104 0.62
105 0.6
106 0.58
107 0.55
108 0.47
109 0.37
110 0.32
111 0.33
112 0.27
113 0.25
114 0.21
115 0.2
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.18
120 0.25
121 0.27
122 0.33
123 0.34
124 0.34
125 0.34
126 0.33
127 0.31
128 0.24
129 0.23
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.16
134 0.17
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.18
139 0.17
140 0.15
141 0.19
142 0.2
143 0.21
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.27
148 0.28
149 0.23
150 0.21
151 0.18
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.15
180 0.17
181 0.14
182 0.17
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.19
187 0.16
188 0.12
189 0.1
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.13
199 0.15
200 0.17
201 0.2
202 0.21
203 0.25
204 0.3
205 0.32
206 0.3
207 0.29
208 0.26
209 0.23
210 0.21
211 0.16
212 0.11
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.11
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.13
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.2
248 0.2
249 0.17
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.19
254 0.19
255 0.17
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.13
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.17
309 0.2
310 0.18
311 0.19
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.22
316 0.2
317 0.17
318 0.19
319 0.21
320 0.22
321 0.24
322 0.24
323 0.21
324 0.23
325 0.27
326 0.25
327 0.23
328 0.21
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.17
333 0.14
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.13
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.15
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.19
364 0.27
365 0.31
366 0.37
367 0.45
368 0.53
369 0.62
370 0.66
371 0.71
372 0.72
373 0.77
374 0.81
375 0.83
376 0.79
377 0.75
378 0.76
379 0.72
380 0.71
381 0.71
382 0.65
383 0.64
384 0.61
385 0.58
386 0.59
387 0.63
388 0.59
389 0.53
390 0.52
391 0.47
392 0.47
393 0.45
394 0.4
395 0.32
396 0.26
397 0.21
398 0.17
399 0.13
400 0.09
401 0.09
402 0.07
403 0.06
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.11
409 0.11
410 0.15
411 0.18
412 0.17
413 0.21
414 0.28
415 0.27
416 0.33
417 0.37
418 0.43
419 0.5
420 0.58
421 0.62
422 0.67
423 0.72
424 0.71
425 0.76
426 0.78
427 0.74
428 0.71
429 0.66
430 0.66
431 0.68
432 0.68
433 0.63
434 0.6
435 0.56
436 0.53
437 0.5
438 0.41
439 0.34
440 0.35
441 0.3
442 0.22
443 0.2
444 0.18
445 0.18
446 0.16
447 0.15
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.11
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.13
473 0.14
474 0.14
475 0.17
476 0.2
477 0.2
478 0.22
479 0.29
480 0.27
481 0.26
482 0.26
483 0.24