Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XCX8

Protein Details
Accession R4XCX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-33EDYDAEAPRKRRKQTKEDRMLGIFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR024933  TFP11  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MTLSDSSSDEDYDAEAPRKRRKQTKEDRMLGIFGSESDEQESRGIYGRTLHTKGVAFQRAGAVTSDNDEDPDEGLPPSFEARPFEFASSNIVQGASRPTSHSTDHNETGQMPKFESPMVHGPQSDAANYTSRTQPTATKPSKAGPPLKLGNSKAAQMMARMGYKAGEGLGTSGKGIVNPIEAHLRPGQKAGLGSVNEQPAPEQSTRDDRYSKVSKPRHAATSSTSRSRKVKYKTAQEIINDAGGDLKIPKSLQSIIDMTGGQPKRLTSASNIEVTQVNSSANQTFRISQIARKEVEQYAADWQRLQNRKAYLSAELSRSRKELIEAVEKRKVQQDLLSEAWRISSPSSTTHDQITDLNRLVHGLQDLRKDFGSLTSTIMLDEVVVSLLAPVLKQCIFGWEVLSEPSRFVPELKALFESSTTRTESRPEAPTDSKRKSSPFDSLMVNIWFPRIRSTLIAEDISSDAVLNLLEAWAPLTPSFLRDQIINQLVMPRLTERIQKWNPRTDTVSNTLLWLFQWLPYLADHFSEVSSIVKRKFNLVLSQWKPEDGLIRDLHDWTEIIGPSEIQDLLAKQVLPKLADALRHRLVINPSDQKLEALTNVLIWRHNFAPMIMADLLKDELFPKWIQMLYDWLRNNPNLEEVSEWYEWWQNEIPDDLRDLEPVRDAFSHALRMMEITLDRGTEYLERPAVGPRKPLDHKRFLAGKTNIAFTKQYTSAQEEPDITFKDVLDDWCEKHNCLLVPLRRAHESGNALYRITASTTGTGGAIIYLRGDIVMLQDKEQQKFLATSLSGLAKVLNVNSSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.32
4 0.42
5 0.51
6 0.59
7 0.66
8 0.72
9 0.78
10 0.84
11 0.88
12 0.89
13 0.88
14 0.85
15 0.78
16 0.69
17 0.58
18 0.47
19 0.36
20 0.25
21 0.22
22 0.16
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.14
30 0.18
31 0.18
32 0.15
33 0.21
34 0.26
35 0.33
36 0.35
37 0.34
38 0.34
39 0.35
40 0.39
41 0.43
42 0.43
43 0.35
44 0.34
45 0.38
46 0.35
47 0.34
48 0.3
49 0.22
50 0.16
51 0.19
52 0.2
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.18
68 0.21
69 0.25
70 0.27
71 0.28
72 0.26
73 0.25
74 0.3
75 0.27
76 0.24
77 0.2
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.22
82 0.18
83 0.17
84 0.19
85 0.23
86 0.26
87 0.29
88 0.33
89 0.36
90 0.4
91 0.43
92 0.42
93 0.39
94 0.37
95 0.42
96 0.41
97 0.34
98 0.28
99 0.26
100 0.26
101 0.25
102 0.25
103 0.23
104 0.26
105 0.28
106 0.29
107 0.27
108 0.27
109 0.31
110 0.31
111 0.27
112 0.2
113 0.18
114 0.19
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.24
120 0.24
121 0.29
122 0.34
123 0.43
124 0.44
125 0.44
126 0.45
127 0.48
128 0.54
129 0.55
130 0.54
131 0.47
132 0.51
133 0.53
134 0.57
135 0.58
136 0.52
137 0.52
138 0.47
139 0.44
140 0.38
141 0.34
142 0.28
143 0.22
144 0.24
145 0.19
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.16
168 0.16
169 0.2
170 0.24
171 0.26
172 0.24
173 0.26
174 0.25
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.18
180 0.2
181 0.22
182 0.24
183 0.22
184 0.22
185 0.2
186 0.16
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.17
191 0.25
192 0.29
193 0.32
194 0.33
195 0.3
196 0.37
197 0.42
198 0.45
199 0.47
200 0.51
201 0.54
202 0.59
203 0.63
204 0.61
205 0.57
206 0.53
207 0.48
208 0.51
209 0.49
210 0.51
211 0.48
212 0.46
213 0.49
214 0.53
215 0.56
216 0.53
217 0.58
218 0.58
219 0.66
220 0.7
221 0.7
222 0.68
223 0.61
224 0.56
225 0.47
226 0.4
227 0.29
228 0.2
229 0.16
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.21
247 0.21
248 0.18
249 0.17
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.14
255 0.21
256 0.23
257 0.25
258 0.25
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.21
263 0.14
264 0.12
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.19
274 0.18
275 0.2
276 0.25
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.31
281 0.26
282 0.29
283 0.25
284 0.2
285 0.23
286 0.25
287 0.24
288 0.21
289 0.22
290 0.28
291 0.33
292 0.33
293 0.3
294 0.3
295 0.32
296 0.33
297 0.33
298 0.27
299 0.27
300 0.29
301 0.28
302 0.31
303 0.31
304 0.3
305 0.29
306 0.27
307 0.23
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.27
312 0.3
313 0.34
314 0.39
315 0.38
316 0.38
317 0.4
318 0.37
319 0.27
320 0.26
321 0.25
322 0.24
323 0.26
324 0.26
325 0.22
326 0.2
327 0.2
328 0.17
329 0.14
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.11
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.16
353 0.17
354 0.18
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.02
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.14
405 0.12
406 0.14
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.17
411 0.19
412 0.21
413 0.23
414 0.22
415 0.25
416 0.29
417 0.36
418 0.42
419 0.43
420 0.42
421 0.41
422 0.42
423 0.41
424 0.39
425 0.37
426 0.32
427 0.31
428 0.28
429 0.27
430 0.27
431 0.24
432 0.21
433 0.15
434 0.13
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.13
441 0.16
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.13
449 0.1
450 0.07
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.12
471 0.16
472 0.18
473 0.17
474 0.15
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.11
480 0.11
481 0.13
482 0.18
483 0.18
484 0.28
485 0.34
486 0.43
487 0.47
488 0.54
489 0.54
490 0.52
491 0.55
492 0.48
493 0.46
494 0.43
495 0.4
496 0.31
497 0.29
498 0.26
499 0.21
500 0.17
501 0.14
502 0.1
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.12
509 0.1
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.11
518 0.14
519 0.17
520 0.2
521 0.2
522 0.23
523 0.27
524 0.28
525 0.31
526 0.32
527 0.4
528 0.39
529 0.45
530 0.42
531 0.38
532 0.35
533 0.3
534 0.31
535 0.23
536 0.26
537 0.2
538 0.23
539 0.23
540 0.23
541 0.23
542 0.17
543 0.15
544 0.1
545 0.13
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.12
552 0.11
553 0.07
554 0.08
555 0.07
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.12
561 0.14
562 0.14
563 0.14
564 0.16
565 0.16
566 0.22
567 0.24
568 0.29
569 0.29
570 0.3
571 0.3
572 0.31
573 0.32
574 0.3
575 0.34
576 0.33
577 0.32
578 0.33
579 0.33
580 0.29
581 0.27
582 0.24
583 0.18
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.12
588 0.13
589 0.14
590 0.13
591 0.16
592 0.15
593 0.17
594 0.15
595 0.14
596 0.16
597 0.14
598 0.18
599 0.15
600 0.14
601 0.12
602 0.13
603 0.14
604 0.1
605 0.11
606 0.07
607 0.07
608 0.1
609 0.1
610 0.11
611 0.13
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.21
616 0.22
617 0.29
618 0.29
619 0.29
620 0.32
621 0.33
622 0.35
623 0.27
624 0.28
625 0.22
626 0.21
627 0.2
628 0.19
629 0.23
630 0.21
631 0.2
632 0.18
633 0.22
634 0.21
635 0.23
636 0.23
637 0.18
638 0.19
639 0.22
640 0.22
641 0.18
642 0.2
643 0.19
644 0.16
645 0.18
646 0.18
647 0.16
648 0.19
649 0.18
650 0.19
651 0.16
652 0.18
653 0.19
654 0.19
655 0.22
656 0.19
657 0.19
658 0.16
659 0.17
660 0.15
661 0.14
662 0.12
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.11
669 0.12
670 0.14
671 0.16
672 0.17
673 0.17
674 0.18
675 0.26
676 0.31
677 0.3
678 0.34
679 0.32
680 0.41
681 0.48
682 0.58
683 0.59
684 0.63
685 0.63
686 0.65
687 0.7
688 0.64
689 0.66
690 0.58
691 0.56
692 0.49
693 0.51
694 0.44
695 0.39
696 0.37
697 0.29
698 0.33
699 0.28
700 0.29
701 0.27
702 0.34
703 0.35
704 0.37
705 0.38
706 0.33
707 0.33
708 0.34
709 0.34
710 0.29
711 0.26
712 0.23
713 0.23
714 0.23
715 0.22
716 0.23
717 0.23
718 0.23
719 0.3
720 0.32
721 0.3
722 0.31
723 0.34
724 0.29
725 0.31
726 0.39
727 0.36
728 0.42
729 0.47
730 0.48
731 0.46
732 0.46
733 0.44
734 0.42
735 0.41
736 0.39
737 0.41
738 0.38
739 0.35
740 0.34
741 0.33
742 0.26
743 0.23
744 0.2
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.15
749 0.14
750 0.13
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.07
755 0.07
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.05
761 0.09
762 0.17
763 0.18
764 0.19
765 0.27
766 0.33
767 0.35
768 0.37
769 0.34
770 0.28
771 0.29
772 0.28
773 0.28
774 0.22
775 0.21
776 0.23
777 0.24
778 0.21
779 0.2
780 0.2
781 0.14
782 0.16
783 0.16