Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XME1

Protein Details
Accession R4XME1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
504-529VTMVMRGAYNRKRKERKDEEPDAEHWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3.5, cyto_mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008906  HATC_C_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0090304  P:nucleic acid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF05699  Dimer_Tnp_hAT  
Amino Acid Sequences MGIVVHFVDNNFKLRRETLSFELLPNAHTADNLTDNVWAVLKSYNILDKIYAITGDSASNNMRMAKNLESNWNRKYFTAPQRRWNAGMQFINCTAHVIHNSVIQFLLRMSACPADDYRQFDRTEEEGTRLAGGQQRRHPKIQSLEGFAKTLEKLRMVAIASSNSTVRKEQFQEHVKRQLGKALLLKVDVQTRWHSTAAMLQRALLLKDPISAWIVSRNELDELTMDGREWAEAELIYSILRPFCTCAQQLVTTATINIHLTYGIYNYLFEHLEAFKERLEDEFSVQSCYKEQLLVGLDAAWNLLNKYYRLSDPKCTYSAAILLNPSIKGKYFTGEEWKLPADNVLWQKKYEQQLVDTFKTFYHNRDKYDNTQPASSTNNSMSHLSTPVRLGHANEIPTTGRKSNGTKLFFAVAPDVEQDSLDCQPEKEVLDYLKEPRIAPQSRETVHILKYWKSKEAVWPDLCLLARDVLAVPATGADVERLFSQGRNVVTYHCHNLHSQTILVTMVMRGAYNRKRKERKDEEPDAEHWYDVQKILQEDNPHTFPDLFLPENIAHLRVVLDRIEKDPELIPLSQDEEQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.37
4 0.41
5 0.39
6 0.45
7 0.44
8 0.41
9 0.44
10 0.38
11 0.33
12 0.28
13 0.25
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.12
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.18
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.16
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.19
49 0.18
50 0.19
51 0.23
52 0.25
53 0.3
54 0.32
55 0.4
56 0.44
57 0.49
58 0.53
59 0.55
60 0.51
61 0.46
62 0.5
63 0.5
64 0.54
65 0.59
66 0.58
67 0.62
68 0.69
69 0.73
70 0.69
71 0.66
72 0.59
73 0.57
74 0.56
75 0.48
76 0.44
77 0.41
78 0.4
79 0.33
80 0.3
81 0.22
82 0.19
83 0.19
84 0.17
85 0.16
86 0.19
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.14
91 0.13
92 0.11
93 0.14
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.18
101 0.18
102 0.22
103 0.28
104 0.3
105 0.32
106 0.32
107 0.31
108 0.34
109 0.31
110 0.32
111 0.26
112 0.25
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.22
120 0.26
121 0.32
122 0.42
123 0.47
124 0.51
125 0.51
126 0.54
127 0.57
128 0.59
129 0.56
130 0.52
131 0.53
132 0.5
133 0.47
134 0.4
135 0.35
136 0.26
137 0.26
138 0.21
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.19
143 0.17
144 0.18
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.21
155 0.23
156 0.27
157 0.34
158 0.42
159 0.49
160 0.53
161 0.6
162 0.58
163 0.58
164 0.54
165 0.51
166 0.43
167 0.39
168 0.37
169 0.31
170 0.28
171 0.26
172 0.26
173 0.22
174 0.25
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.22
179 0.24
180 0.23
181 0.22
182 0.18
183 0.24
184 0.26
185 0.26
186 0.22
187 0.19
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.17
192 0.13
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.13
275 0.14
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.13
296 0.2
297 0.22
298 0.28
299 0.31
300 0.34
301 0.33
302 0.32
303 0.3
304 0.24
305 0.25
306 0.18
307 0.15
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.09
314 0.08
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.2
321 0.22
322 0.22
323 0.21
324 0.22
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.1
329 0.14
330 0.21
331 0.24
332 0.25
333 0.25
334 0.27
335 0.32
336 0.36
337 0.35
338 0.29
339 0.27
340 0.33
341 0.38
342 0.39
343 0.34
344 0.3
345 0.26
346 0.29
347 0.27
348 0.25
349 0.3
350 0.32
351 0.34
352 0.39
353 0.43
354 0.44
355 0.54
356 0.55
357 0.46
358 0.44
359 0.41
360 0.37
361 0.37
362 0.32
363 0.24
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.19
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.2
385 0.23
386 0.19
387 0.18
388 0.2
389 0.24
390 0.31
391 0.38
392 0.39
393 0.36
394 0.37
395 0.37
396 0.34
397 0.31
398 0.24
399 0.16
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.15
416 0.14
417 0.17
418 0.19
419 0.22
420 0.24
421 0.25
422 0.24
423 0.27
424 0.35
425 0.35
426 0.36
427 0.39
428 0.42
429 0.41
430 0.45
431 0.44
432 0.38
433 0.37
434 0.38
435 0.34
436 0.32
437 0.39
438 0.38
439 0.39
440 0.37
441 0.37
442 0.42
443 0.47
444 0.51
445 0.44
446 0.44
447 0.4
448 0.42
449 0.39
450 0.31
451 0.24
452 0.16
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.18
476 0.19
477 0.24
478 0.28
479 0.32
480 0.3
481 0.31
482 0.3
483 0.34
484 0.35
485 0.32
486 0.28
487 0.21
488 0.2
489 0.18
490 0.17
491 0.13
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.08
496 0.09
497 0.18
498 0.26
499 0.36
500 0.45
501 0.55
502 0.65
503 0.73
504 0.83
505 0.85
506 0.87
507 0.87
508 0.88
509 0.85
510 0.8
511 0.74
512 0.7
513 0.61
514 0.5
515 0.4
516 0.32
517 0.26
518 0.22
519 0.21
520 0.17
521 0.18
522 0.22
523 0.24
524 0.28
525 0.3
526 0.36
527 0.36
528 0.33
529 0.34
530 0.31
531 0.28
532 0.28
533 0.28
534 0.23
535 0.21
536 0.24
537 0.22
538 0.25
539 0.26
540 0.22
541 0.17
542 0.16
543 0.17
544 0.15
545 0.17
546 0.16
547 0.2
548 0.21
549 0.24
550 0.29
551 0.27
552 0.28
553 0.28
554 0.29
555 0.28
556 0.26
557 0.25
558 0.21
559 0.26
560 0.26