Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDI2

Protein Details
Accession R4XDI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-243DDGSRFKQLERERKKKLRMKREAEMALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-237RERKKKLRMKR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MTDTTTPAASLVYLVNSCRPEPANPSGMQNLQSVFGLDSLAASVARTDAQGNKIAANKLNKTYKKQVLDLALPGDTDIPKNRFLMDALLSGAAHRAVEDGYRQFTRAEVEDGFALRPGELNGYIKYRPPSPTPKRGGKVDSTGGTPTAASFFLPDRTAVSEPRSRTYSEPRTGRGSGTHNSSVHATRASTPSPIQTRSTAAHVPPPPPSVDGDESSDDGSRFKQLERERKKKLRMKREAEMALGGDYKRRRYDVDGYEFLDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.19
4 0.19
5 0.22
6 0.23
7 0.24
8 0.29
9 0.34
10 0.35
11 0.34
12 0.38
13 0.39
14 0.38
15 0.37
16 0.33
17 0.27
18 0.22
19 0.21
20 0.18
21 0.14
22 0.12
23 0.1
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.07
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.08
35 0.11
36 0.14
37 0.19
38 0.2
39 0.22
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.34
44 0.35
45 0.37
46 0.46
47 0.48
48 0.51
49 0.59
50 0.62
51 0.6
52 0.58
53 0.56
54 0.51
55 0.49
56 0.43
57 0.35
58 0.27
59 0.22
60 0.2
61 0.16
62 0.12
63 0.12
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.15
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.07
86 0.08
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.32
117 0.36
118 0.46
119 0.5
120 0.56
121 0.57
122 0.57
123 0.56
124 0.48
125 0.45
126 0.38
127 0.32
128 0.26
129 0.23
130 0.2
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.17
147 0.2
148 0.22
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.26
153 0.35
154 0.39
155 0.42
156 0.44
157 0.44
158 0.47
159 0.46
160 0.44
161 0.38
162 0.34
163 0.29
164 0.32
165 0.34
166 0.28
167 0.29
168 0.3
169 0.28
170 0.24
171 0.22
172 0.18
173 0.16
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.23
179 0.26
180 0.28
181 0.27
182 0.26
183 0.28
184 0.28
185 0.32
186 0.29
187 0.25
188 0.31
189 0.31
190 0.32
191 0.32
192 0.32
193 0.29
194 0.26
195 0.27
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.24
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.22
211 0.3
212 0.41
213 0.51
214 0.6
215 0.67
216 0.75
217 0.84
218 0.85
219 0.87
220 0.87
221 0.87
222 0.86
223 0.83
224 0.83
225 0.76
226 0.69
227 0.61
228 0.5
229 0.41
230 0.35
231 0.27
232 0.24
233 0.25
234 0.28
235 0.31
236 0.32
237 0.34
238 0.37
239 0.47
240 0.5
241 0.55
242 0.54
243 0.52