FuNGI

R4XDQ3

Protein Details

Accession

R4XDQ3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
263-284	IIYKHKGRRSHRLPIPRRRGAY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
267-281	HKGRRSHRLPIPRRR

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, nucl 3.5, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MSTHGSSAFYSLSLVQPSSPVCNPIVGQFAGNKQQEVIVATSNALTVYKIDSETGKFVKLYYHEVFGIIRSLAQFRLTGSTKDYILLGTESGKITVLEYQSDPKNFVKVHQETFGKSGVRRVVPGEFMAVDPKGRTVMIAAVEKNKLVYVLNRDAAANLTISSPLEASSPSSLLFHVVGLDVGYDNPVFASLEVNYADADQDASGQAYRSVQKTLTYYELDLGLNHVVREWTELVDRKSNMLIPVPGGYDGPSGVLVCCPDSIIYKHKGRRSHRLPIPRRRGAYEDPSHARTIVASVTHRLRGGFFLLVQTSDGDLFKITIEHADGELLSMMIKYFDTVPVATGLTIFKSGYLYTSTELGDQNLYQFEKLGEDDNETEFQSVEYDMIDDDPQPVYFHPRPLVNLTLVDQIKTLNPLTHASVLNLTNEDAPQIYAACGRGPRSTLKTIRHGLEVTEQVASELPGKPIAVWTTKLTADDRFDSYIILSFTDGTLVLSIGETVEEVTDTGFLASATTLAVQQLGEDALIQVHPKGIRHIRADKRVNEWQAPQHRTIVQATTNARQVVVALSSGELVYFEMDSDGQLNEYQDKKEMSGNVTALSVGSVPVGRQRNPYLAVACDDSTVRIISLDPDSTLDSLSVQALTAPASSLSMMSMDDGMTSTLYLHIGLYNGTYIRTVLESTTGQLVDTRTRFLGPSPIKLFSITAQEQTAVLALCTRPWLGYIHNFSMQLNPLLGYDALEHAHSFSSDQCPEGVVAIQGASLVIFTVDRLDDKLKADSHQLDYTPRKFTKHPTSQYLYIVEADHHVMTSNARSQAVKGKQNGDAQELDPLNFGRPWAKAGSWGSCIRAFDPVAQQTVAKIELEDDEAAFCVTVVPFSSREDELYLAVGTAKGATVSPKSCKQAYILLYKLVDGGRSLEFVHRTETSEIPLSMLAFQGRLLVAVGGNARLYDIGRKRCLRKSETQVTENAIVGMHTQGDRVVLADNVESVYYAVYKQAENRLICFANDTISRATTASTMVDYETVAGGDRFGNIWIVRCPADASELSDTDTTGNTLVHEKPYLQGTAHRLDTVAHYFLGDTPTSIQKCTFVAGGRSVLMITGLMGSISLLIPFVAKEDVEFFQQLETHMRSEDAPLGGRDHLMYRGYYAPPKSVIDGDLCERFVLLSLDKQRLIAGELDREVAEVKAKLENMRIRNAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.14
3	0.17
4	0.18
5	0.23
6	0.22
7	0.22
8	0.21
9	0.23
10	0.23
11	0.24
12	0.27
13	0.22
14	0.22
15	0.23
16	0.27
17	0.33
18	0.34
19	0.31
20	0.27
21	0.28
22	0.28
23	0.27
24	0.23
25	0.17
26	0.16
27	0.17
28	0.16
29	0.15
30	0.14
31	0.11
32	0.1
33	0.08
34	0.1
35	0.12
36	0.12
37	0.14
38	0.16
39	0.19
40	0.25
41	0.26
42	0.25
43	0.23
44	0.23
45	0.27
46	0.27
47	0.32
48	0.28
49	0.3
50	0.28
51	0.29
52	0.29
53	0.24
54	0.24
55	0.16
56	0.15
57	0.13
58	0.15
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.14
63	0.21
64	0.22
65	0.22
66	0.25
67	0.27
68	0.26
69	0.26
70	0.25
71	0.18
72	0.17
73	0.16
74	0.13
75	0.12
76	0.14
77	0.14
78	0.14
79	0.14
80	0.12
81	0.12
82	0.16
83	0.15
84	0.16
85	0.17
86	0.23
87	0.28
88	0.3
89	0.33
90	0.29
91	0.35
92	0.32
93	0.35
94	0.39
95	0.39
96	0.42
97	0.45
98	0.47
99	0.43
100	0.45
101	0.45
102	0.38
103	0.33
104	0.36
105	0.35
106	0.34
107	0.34
108	0.34
109	0.33
110	0.31
111	0.31
112	0.27
113	0.2
114	0.19
115	0.21
116	0.18
117	0.16
118	0.14
119	0.15
120	0.14
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.13
125	0.16
126	0.2
127	0.21
128	0.25
129	0.26
130	0.26
131	0.25
132	0.22
133	0.18
134	0.16
135	0.19
136	0.22
137	0.28
138	0.29
139	0.3
140	0.29
141	0.29
142	0.29
143	0.25
144	0.17
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.13
161	0.13
162	0.1
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.08
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.08
178	0.07
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.09
194	0.11
195	0.15
196	0.16
197	0.18
198	0.18
199	0.2
200	0.22
201	0.25
202	0.26
203	0.24
204	0.23
205	0.22
206	0.23
207	0.2
208	0.18
209	0.17
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.12
214	0.1
215	0.1
216	0.14
217	0.13
218	0.12
219	0.16
220	0.21
221	0.24
222	0.3
223	0.31
224	0.29
225	0.3
226	0.3
227	0.27
228	0.25
229	0.23
230	0.18
231	0.19
232	0.18
233	0.16
234	0.14
235	0.13
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.1
249	0.13
250	0.18
251	0.25
252	0.32
253	0.39
254	0.44
255	0.52
256	0.56
257	0.65
258	0.66
259	0.7
260	0.7
261	0.75
262	0.8
263	0.82
264	0.86
265	0.82
266	0.77
267	0.7
268	0.68
269	0.64
270	0.63
271	0.58
272	0.56
273	0.52
274	0.52
275	0.49
276	0.43
277	0.36
278	0.27
279	0.22
280	0.16
281	0.14
282	0.12
283	0.16
284	0.19
285	0.21
286	0.21
287	0.2
288	0.19
289	0.18
290	0.19
291	0.16
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.13
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.11
357	0.13
358	0.11
359	0.13
360	0.14
361	0.15
362	0.16
363	0.15
364	0.15
365	0.12
366	0.11
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.16
382	0.17
383	0.2
384	0.22
385	0.23
386	0.25
387	0.27
388	0.29
389	0.22
390	0.21
391	0.2
392	0.24
393	0.23
394	0.21
395	0.17
396	0.16
397	0.15
398	0.17
399	0.15
400	0.09
401	0.11
402	0.12
403	0.14
404	0.18
405	0.17
406	0.16
407	0.19
408	0.18
409	0.17
410	0.16
411	0.15
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.11
425	0.12
426	0.14
427	0.18
428	0.21
429	0.28
430	0.33
431	0.36
432	0.42
433	0.45
434	0.45
435	0.43
436	0.38
437	0.32
438	0.3
439	0.27
440	0.21
441	0.16
442	0.15
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.1
453	0.12
454	0.11
455	0.12
456	0.13
457	0.15
458	0.15
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.18
463	0.19
464	0.19
465	0.17
466	0.17
467	0.16
468	0.15
469	0.14
470	0.12
471	0.1
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.12
519	0.16
520	0.21
521	0.26
522	0.36
523	0.41
524	0.49
525	0.56
526	0.53
527	0.55
528	0.57
529	0.55
530	0.48
531	0.44
532	0.42
533	0.44
534	0.44
535	0.39
536	0.35
537	0.33
538	0.32
539	0.31
540	0.26
541	0.18
542	0.2
543	0.21
544	0.2
545	0.22
546	0.2
547	0.19
548	0.16
549	0.15
550	0.11
551	0.09
552	0.07
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.04
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.05
570	0.06
571	0.09
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.14
578	0.15
579	0.14
580	0.15
581	0.15
582	0.14
583	0.14
584	0.12
585	0.1
586	0.08
587	0.06
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.1
593	0.12
594	0.13
595	0.16
596	0.18
597	0.2
598	0.22
599	0.24
600	0.19
601	0.17
602	0.17
603	0.15
604	0.14
605	0.12
606	0.1
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.1
669	0.09
670	0.08
671	0.1
672	0.11
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.13
677	0.13
678	0.14
679	0.13
680	0.21
681	0.18
682	0.24
683	0.26
684	0.27
685	0.26
686	0.27
687	0.27
688	0.19
689	0.24
690	0.18
691	0.17
692	0.15
693	0.15
694	0.15
695	0.14
696	0.14
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.08
707	0.09
708	0.16
709	0.2
710	0.22
711	0.23
712	0.24
713	0.23
714	0.24
715	0.23
716	0.17
717	0.13
718	0.11
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.07
730	0.06
731	0.06
732	0.07
733	0.12
734	0.12
735	0.12
736	0.12
737	0.12
738	0.12
739	0.12
740	0.11
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.05
745	0.04
746	0.04
747	0.03
748	0.03
749	0.02
750	0.02
751	0.02
752	0.02
753	0.04
754	0.04
755	0.05
756	0.07
757	0.08
758	0.1
759	0.12
760	0.16
761	0.16
762	0.17
763	0.21
764	0.23
765	0.25
766	0.25
767	0.24
768	0.27
769	0.33
770	0.35
771	0.38
772	0.36
773	0.35
774	0.36
775	0.44
776	0.48
777	0.52
778	0.55
779	0.55
780	0.59
781	0.59
782	0.59
783	0.51
784	0.41
785	0.32
786	0.27
787	0.19
788	0.15
789	0.13
790	0.11
791	0.09
792	0.08
793	0.07
794	0.08
795	0.1
796	0.13
797	0.13
798	0.14
799	0.15
800	0.16
801	0.25
802	0.31
803	0.35
804	0.34
805	0.36
806	0.41
807	0.45
808	0.45
809	0.39
810	0.35
811	0.29
812	0.31
813	0.28
814	0.23
815	0.19
816	0.18
817	0.16
818	0.14
819	0.15
820	0.11
821	0.11
822	0.13
823	0.14
824	0.14
825	0.18
826	0.21
827	0.23
828	0.25
829	0.26
830	0.26
831	0.26
832	0.27
833	0.22
834	0.23
835	0.2
836	0.19
837	0.23
838	0.23
839	0.22
840	0.22
841	0.21
842	0.18
843	0.19
844	0.17
845	0.11
846	0.09
847	0.08
848	0.08
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.08
855	0.07
856	0.06
857	0.05
858	0.05
859	0.05
860	0.06
861	0.07
862	0.09
863	0.11
864	0.14
865	0.13
866	0.14
867	0.15
868	0.15
869	0.13
870	0.14
871	0.12
872	0.09
873	0.08
874	0.08
875	0.06
876	0.06
877	0.05
878	0.04
879	0.05
880	0.07
881	0.1
882	0.14
883	0.19
884	0.24
885	0.28
886	0.29
887	0.3
888	0.3
889	0.34
890	0.35
891	0.38
892	0.34
893	0.33
894	0.32
895	0.31
896	0.31
897	0.24
898	0.2
899	0.12
900	0.13
901	0.11
902	0.11
903	0.12
904	0.14
905	0.16
906	0.16
907	0.19
908	0.18
909	0.2
910	0.23
911	0.23
912	0.22
913	0.23
914	0.22
915	0.19
916	0.19
917	0.16
918	0.13
919	0.13
920	0.11
921	0.08
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.07
926	0.07
927	0.07
928	0.06
929	0.08
930	0.08
931	0.07
932	0.07
933	0.07
934	0.07
935	0.07
936	0.08
937	0.15
938	0.21
939	0.28
940	0.36
941	0.43
942	0.49
943	0.56
944	0.64
945	0.62
946	0.65
947	0.68
948	0.71
949	0.71
950	0.67
951	0.62
952	0.59
953	0.54
954	0.44
955	0.34
956	0.23
957	0.16
958	0.14
959	0.12
960	0.1
961	0.07
962	0.07
963	0.07
964	0.08
965	0.08
966	0.08
967	0.08
968	0.07
969	0.08
970	0.08
971	0.08
972	0.08
973	0.08
974	0.07
975	0.06
976	0.06
977	0.06
978	0.06
979	0.08
980	0.09
981	0.1
982	0.14
983	0.22
984	0.29
985	0.29
986	0.31
987	0.34
988	0.33
989	0.32
990	0.31
991	0.24
992	0.21
993	0.21
994	0.22
995	0.18
996	0.18
997	0.19
998	0.16
999	0.16
1000	0.13
1001	0.13
1002	0.11
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.08
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.08
1016	0.07
1017	0.08
1018	0.11
1019	0.11
1020	0.13
1021	0.14
1022	0.17
1023	0.17
1024	0.17
1025	0.17
1026	0.15
1027	0.18
1028	0.17
1029	0.19
1030	0.2
1031	0.2
1032	0.22
1033	0.21
1034	0.2
1035	0.17
1036	0.17
1037	0.13
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.09
1041	0.13
1042	0.14
1043	0.16
1044	0.17
1045	0.17
1046	0.19
1047	0.22
1048	0.22
1049	0.19
1050	0.23
1051	0.26
1052	0.3
1053	0.31
1054	0.29
1055	0.26
1056	0.25
1057	0.29
1058	0.27
1059	0.23
1060	0.18
1061	0.16
1062	0.17
1063	0.18
1064	0.2
1065	0.15
1066	0.12
1067	0.14
1068	0.22
1069	0.23
1070	0.23
1071	0.22
1072	0.21
1073	0.22
1074	0.23
1075	0.23
1076	0.18
1077	0.2
1078	0.22
1079	0.23
1080	0.21
1081	0.21
1082	0.19
1083	0.16
1084	0.13
1085	0.1
1086	0.07
1087	0.06
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.05
1091	0.04
1092	0.05
1093	0.05
1094	0.05
1095	0.04
1096	0.05
1097	0.05
1098	0.05
1099	0.07
1100	0.07
1101	0.07
1102	0.08
1103	0.12
1104	0.13
1105	0.16
1106	0.17
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.17
1110	0.18
1111	0.2
1112	0.21
1113	0.2
1114	0.2
1115	0.2
1116	0.19
1117	0.21
1118	0.25
1119	0.2
1120	0.21
1121	0.2
1122	0.22
1123	0.22
1124	0.22
1125	0.2
1126	0.17
1127	0.19
1128	0.18
1129	0.17
1130	0.18
1131	0.22
1132	0.25
1133	0.31
1134	0.31
1135	0.31
1136	0.33
1137	0.34
1138	0.34
1139	0.31
1140	0.29
1141	0.26
1142	0.27
1143	0.28
1144	0.28
1145	0.27
1146	0.24
1147	0.22
1148	0.19
1149	0.18
1150	0.17
1151	0.15
1152	0.19
1153	0.25
1154	0.3
1155	0.31
1156	0.31
1157	0.3
1158	0.29
1159	0.29
1160	0.26
1161	0.23
1162	0.24
1163	0.24
1164	0.25
1165	0.24
1166	0.24
1167	0.23
1168	0.18
1169	0.19
1170	0.15
1171	0.16
1172	0.18
1173	0.21
1174	0.23
1175	0.31
1176	0.38
1177	0.38

R4XDQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer