Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XH61

Protein Details
Accession R4XH61    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-313TPARRGPLSDKEKKYRRDNDLCSYCGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSHPDQQPIPAGGFDRVTSERLMAELARLQHQVDSQGPATTPSQGVTPELLASLASAFTAAAPPRSPGYSGDNSLKLKEPEVFNGGRKDLERFLAALLLKFSAERKRFPDDHSKITYAMSLLRGDAFEIVQNQIVQDVDNLGSFQDFRSSLERAFGDPDSAQTAMLELENLRQRGSIVKYNAEFHRLENILHLNDIAKLAFYRRGVSDHIKNILSEKLEKYDTFEAFEKAVTQLDANLYVRKQDQRYSVRGTAPRHHHGRGDNTGPRGPAVITEQTHTPMEIDAVISTPARRGPLSDKEKKYRRDNDLCSYCGGSGHYANSCPEKKKKFTAAKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.2
6 0.19
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.12
11 0.13
12 0.15
13 0.16
14 0.19
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.21
19 0.23
20 0.22
21 0.24
22 0.21
23 0.22
24 0.21
25 0.22
26 0.22
27 0.2
28 0.18
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.16
55 0.23
56 0.25
57 0.28
58 0.31
59 0.35
60 0.35
61 0.36
62 0.38
63 0.31
64 0.29
65 0.3
66 0.27
67 0.25
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.26
75 0.26
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.17
80 0.16
81 0.18
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.13
89 0.18
90 0.2
91 0.24
92 0.27
93 0.35
94 0.37
95 0.41
96 0.5
97 0.46
98 0.51
99 0.51
100 0.49
101 0.41
102 0.39
103 0.35
104 0.24
105 0.21
106 0.16
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.06
134 0.08
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.16
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.07
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.15
162 0.18
163 0.2
164 0.19
165 0.22
166 0.23
167 0.27
168 0.27
169 0.27
170 0.24
171 0.19
172 0.24
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.2
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.14
192 0.18
193 0.24
194 0.28
195 0.28
196 0.31
197 0.3
198 0.29
199 0.29
200 0.27
201 0.23
202 0.21
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.26
209 0.24
210 0.24
211 0.24
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.17
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.18
228 0.23
229 0.25
230 0.27
231 0.35
232 0.39
233 0.44
234 0.49
235 0.5
236 0.51
237 0.54
238 0.54
239 0.54
240 0.56
241 0.58
242 0.56
243 0.54
244 0.52
245 0.52
246 0.54
247 0.52
248 0.53
249 0.5
250 0.48
251 0.49
252 0.44
253 0.39
254 0.32
255 0.25
256 0.19
257 0.19
258 0.21
259 0.19
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.24
264 0.22
265 0.18
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.16
280 0.22
281 0.32
282 0.42
283 0.5
284 0.57
285 0.65
286 0.74
287 0.8
288 0.83
289 0.83
290 0.83
291 0.83
292 0.82
293 0.83
294 0.8
295 0.73
296 0.65
297 0.57
298 0.47
299 0.37
300 0.31
301 0.24
302 0.2
303 0.22
304 0.21
305 0.22
306 0.24
307 0.32
308 0.36
309 0.4
310 0.48
311 0.53
312 0.58
313 0.66
314 0.74