Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDY0

Protein Details
Accession R4XDY0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-33ASSNGSSNRPHKKVKQTKPKAGSSTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-20KK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MASEKRAASSNGSSNRPHKKVKQTKPKAGSSTDQVLLKDIEKFHALLSEQERDVEITSFVKFEPLEVNIKCLNSSADGMGYVGGYTAIVPFTMAGDKVSAKPYYINDSERILLCDLESITVKADGRDEASIRCKYFGKCSGCQMQEIPYQVQLAHKRKVVEDAFENFSNLAPDLLPVVGETIGSPIQYNYRTKITPHFDQPRRGFALGEYPQIGFNEKGRRKVMDIEECPIATEALNQGLTRERTKVLDNLKSFKRGATLLLRQHSTQTESGLSYSCVSDSKDIITEYIGKYKFQSPAGAFFQNNNAIMPLLTEYVRENLLKDELTSSDHPERFLVDAYCGSGLFSITCSNGFAAVNGVEISQDSVKWAKINAQTNGIENIEFLAGSAEALFEKIKFPPAQTSMILDPPRKGCDTIFLEQLLAFSPERIVYVSCCVQTQARDIGYILNHSSGKDYTVESIRGFDLFPNTYHVEGVCVLQKKHPSVQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.64
4 0.67
5 0.67
6 0.72
7 0.78
8 0.84
9 0.86
10 0.87
11 0.91
12 0.9
13 0.9
14 0.85
15 0.79
16 0.73
17 0.69
18 0.64
19 0.58
20 0.52
21 0.43
22 0.39
23 0.36
24 0.32
25 0.3
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.22
32 0.21
33 0.22
34 0.26
35 0.29
36 0.27
37 0.28
38 0.28
39 0.25
40 0.25
41 0.2
42 0.16
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.14
48 0.12
49 0.13
50 0.15
51 0.16
52 0.23
53 0.23
54 0.27
55 0.27
56 0.28
57 0.26
58 0.24
59 0.22
60 0.17
61 0.18
62 0.15
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.09
83 0.1
84 0.13
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.19
89 0.2
90 0.26
91 0.28
92 0.29
93 0.27
94 0.29
95 0.31
96 0.28
97 0.28
98 0.22
99 0.18
100 0.15
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.26
120 0.28
121 0.28
122 0.34
123 0.4
124 0.4
125 0.39
126 0.44
127 0.5
128 0.47
129 0.47
130 0.41
131 0.37
132 0.33
133 0.34
134 0.29
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.25
139 0.3
140 0.32
141 0.33
142 0.35
143 0.35
144 0.35
145 0.43
146 0.38
147 0.32
148 0.3
149 0.3
150 0.32
151 0.31
152 0.31
153 0.23
154 0.21
155 0.19
156 0.14
157 0.1
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.09
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.19
178 0.2
179 0.21
180 0.29
181 0.32
182 0.33
183 0.4
184 0.48
185 0.49
186 0.58
187 0.58
188 0.56
189 0.54
190 0.5
191 0.41
192 0.31
193 0.35
194 0.28
195 0.27
196 0.22
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.2
201 0.11
202 0.14
203 0.23
204 0.24
205 0.29
206 0.3
207 0.31
208 0.31
209 0.38
210 0.4
211 0.39
212 0.38
213 0.35
214 0.34
215 0.33
216 0.31
217 0.25
218 0.18
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.21
234 0.23
235 0.28
236 0.29
237 0.33
238 0.34
239 0.36
240 0.35
241 0.3
242 0.26
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.26
247 0.27
248 0.3
249 0.31
250 0.29
251 0.3
252 0.28
253 0.25
254 0.19
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.18
276 0.18
277 0.16
278 0.18
279 0.22
280 0.25
281 0.23
282 0.27
283 0.21
284 0.27
285 0.3
286 0.31
287 0.27
288 0.24
289 0.27
290 0.25
291 0.24
292 0.18
293 0.15
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.15
313 0.15
314 0.19
315 0.25
316 0.25
317 0.26
318 0.24
319 0.25
320 0.22
321 0.23
322 0.18
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.08
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.17
357 0.24
358 0.32
359 0.32
360 0.36
361 0.36
362 0.38
363 0.4
364 0.33
365 0.26
366 0.19
367 0.17
368 0.11
369 0.1
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.24
386 0.27
387 0.31
388 0.3
389 0.33
390 0.29
391 0.35
392 0.38
393 0.32
394 0.33
395 0.33
396 0.36
397 0.34
398 0.33
399 0.26
400 0.31
401 0.36
402 0.34
403 0.34
404 0.3
405 0.29
406 0.28
407 0.28
408 0.2
409 0.16
410 0.13
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.11
418 0.16
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.2
423 0.22
424 0.23
425 0.26
426 0.27
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.26
431 0.25
432 0.26
433 0.22
434 0.2
435 0.2
436 0.2
437 0.22
438 0.19
439 0.19
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.23
444 0.25
445 0.23
446 0.25
447 0.24
448 0.23
449 0.22
450 0.19
451 0.2
452 0.19
453 0.2
454 0.23
455 0.25
456 0.25
457 0.25
458 0.22
459 0.19
460 0.18
461 0.2
462 0.21
463 0.24
464 0.24
465 0.29
466 0.36
467 0.39