Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XIN4

Protein Details
Accession R4XIN4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-49ANYIHPRQFAQKHKHKNDLATFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_nucl 5, nucl 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006274  CarbamoylP_synth_ssu  
IPR002474  CarbamoylP_synth_ssu_N  
IPR036480  CarbP_synth_ssu_N_sf  
IPR029062  Class_I_gatase-like  
IPR035686  CPSase_GATase1  
IPR017926  GATASE  
Gene Ontology GO:0004088  F:carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) activity  
GO:0006207  P:'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process  
GO:0006541  P:glutamine metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00988  CPSase_sm_chain  
PF00117  GATase  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51273  GATASE_TYPE_1  
CDD cd01744  GATase1_CPSase  
Amino Acid Sequences MIRTLLSKTPKTVKSASKGLATQVSENANYIHPRQFAQKHKHKNDLATFTIKDGPVFKGTSFGAKRSISGEAVFTTSVVGYPESMTDPSYSGQILVFTQPLIGNYGVPSGEARDDHNLLKYFESGKIQAAGIICSDFATKYSHWTAVESLSDWCSREGVPAVSGVDTRAIVTYLREQGSSLAKINIGEEYDEDEDSAFSDPAAINLVRKVSTKHPYHIAAGGKQHIALIDCGVKENILRCLAGRGADVTVFPFDYPVQDVIHKFDGLFLSNGPGDPTHCDATVYNLRKTMEIYQGPIFGICLGHQLLALAAGAKTIKLKYGNRAHNIPCLNTVTGECSITSQNHGYAVDVKTLPSDWQESFINLNDQSNEGIIHKTRPIGSVQFHPEAKGGPSDPSYLFDNFIDQVARFTEGKKPEKAFTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.61
4 0.58
5 0.55
6 0.53
7 0.51
8 0.45
9 0.39
10 0.36
11 0.35
12 0.29
13 0.29
14 0.26
15 0.24
16 0.25
17 0.26
18 0.27
19 0.26
20 0.27
21 0.35
22 0.42
23 0.49
24 0.56
25 0.63
26 0.69
27 0.75
28 0.84
29 0.8
30 0.8
31 0.79
32 0.75
33 0.7
34 0.65
35 0.57
36 0.5
37 0.5
38 0.41
39 0.33
40 0.29
41 0.27
42 0.25
43 0.25
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.29
48 0.29
49 0.28
50 0.3
51 0.29
52 0.31
53 0.29
54 0.32
55 0.24
56 0.22
57 0.22
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.15
101 0.17
102 0.18
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.23
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.14
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.07
125 0.1
126 0.09
127 0.14
128 0.16
129 0.19
130 0.18
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.19
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.1
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.12
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.06
185 0.04
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.11
197 0.16
198 0.24
199 0.26
200 0.28
201 0.31
202 0.32
203 0.33
204 0.35
205 0.31
206 0.25
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.13
213 0.12
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.11
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.2
269 0.28
270 0.29
271 0.27
272 0.29
273 0.3
274 0.29
275 0.31
276 0.29
277 0.28
278 0.25
279 0.27
280 0.26
281 0.26
282 0.26
283 0.24
284 0.19
285 0.11
286 0.11
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.17
305 0.2
306 0.29
307 0.39
308 0.47
309 0.5
310 0.57
311 0.56
312 0.57
313 0.56
314 0.48
315 0.42
316 0.37
317 0.32
318 0.27
319 0.25
320 0.21
321 0.2
322 0.19
323 0.15
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.21
337 0.2
338 0.19
339 0.2
340 0.2
341 0.17
342 0.19
343 0.15
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.21
348 0.22
349 0.24
350 0.2
351 0.22
352 0.19
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.16
357 0.13
358 0.16
359 0.16
360 0.18
361 0.19
362 0.22
363 0.23
364 0.24
365 0.27
366 0.29
367 0.31
368 0.36
369 0.4
370 0.43
371 0.42
372 0.41
373 0.38
374 0.35
375 0.33
376 0.29
377 0.24
378 0.21
379 0.23
380 0.25
381 0.25
382 0.26
383 0.28
384 0.24
385 0.25
386 0.21
387 0.22
388 0.19
389 0.2
390 0.19
391 0.15
392 0.16
393 0.15
394 0.19
395 0.17
396 0.18
397 0.24
398 0.32
399 0.38
400 0.44
401 0.47