Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XFN3

Protein Details
Accession R4XFN3    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-77DGPASTEPSRDKKKKQKKRKRDDVLLEDLYBasic
425-458EGERARAPHGERTRKKKKKSKKDTLRSKARAAAYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-68RDKKKKQKKRKR
94-101KKREEAKK
363-366RKLR
428-468RARAPHGERTRKKKKKSKKDTLRSKARAAAYRKADAGKATK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDPSLSALFAQSAGPVQKPVKKDRTIIEPLPITKPQQQSDAEAENPSDGPASTEPSRDKKKKQKKRKRDDVLLEDLYMSKLAEHPTKIAKSSDKKREEAKKNAIKPLGESESEDEPPKDQTSSAAADRDAANSSDSGSDSDAEGEQANMAHETTTGASDANGANMQHETQQRQDRELEKAKATVFVGNLPTSVISSHTDYKALKALFSEYGKVRSIRFRSIAFSELLPRKVAFVQGKFHPERDTLNAYVVFADATHARSSIALNGHLFLNRKHIRVDSVAHPAVHVNKRCVFVGSLPFDAEEELLWTHFAACGAIESVRVIRDKKTNVGKGFAYVQFKDASSVQNALLLNDKKMLLGEGKGARKLRVTKSSAMPSKHKADQRERDQLANPDLKPRDKAKLGRVKNLMGSQAAVKLKLMQREIAMEGERARAPHGERTRKKKKKSKKDTLRSKARAAAYRKADAGKATKGAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.24
4 0.29
5 0.35
6 0.44
7 0.5
8 0.53
9 0.58
10 0.58
11 0.63
12 0.66
13 0.62
14 0.6
15 0.56
16 0.53
17 0.53
18 0.51
19 0.46
20 0.46
21 0.5
22 0.45
23 0.46
24 0.45
25 0.44
26 0.47
27 0.47
28 0.41
29 0.35
30 0.33
31 0.28
32 0.26
33 0.21
34 0.16
35 0.11
36 0.13
37 0.12
38 0.18
39 0.18
40 0.23
41 0.28
42 0.36
43 0.47
44 0.52
45 0.62
46 0.67
47 0.77
48 0.83
49 0.89
50 0.92
51 0.93
52 0.96
53 0.97
54 0.96
55 0.96
56 0.95
57 0.91
58 0.88
59 0.78
60 0.67
61 0.57
62 0.46
63 0.36
64 0.26
65 0.18
66 0.09
67 0.1
68 0.14
69 0.17
70 0.18
71 0.21
72 0.28
73 0.3
74 0.32
75 0.33
76 0.38
77 0.44
78 0.53
79 0.6
80 0.59
81 0.61
82 0.68
83 0.74
84 0.75
85 0.75
86 0.76
87 0.75
88 0.76
89 0.8
90 0.74
91 0.64
92 0.57
93 0.54
94 0.47
95 0.38
96 0.33
97 0.29
98 0.28
99 0.29
100 0.29
101 0.22
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.18
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.19
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.15
155 0.16
156 0.22
157 0.29
158 0.3
159 0.32
160 0.36
161 0.34
162 0.39
163 0.44
164 0.41
165 0.35
166 0.36
167 0.34
168 0.32
169 0.3
170 0.24
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.21
189 0.19
190 0.16
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.23
202 0.25
203 0.26
204 0.28
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.28
209 0.22
210 0.19
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.22
219 0.18
220 0.17
221 0.2
222 0.22
223 0.29
224 0.29
225 0.3
226 0.26
227 0.24
228 0.24
229 0.24
230 0.25
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.14
237 0.1
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.11
256 0.2
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.26
263 0.29
264 0.23
265 0.27
266 0.28
267 0.26
268 0.26
269 0.24
270 0.29
271 0.31
272 0.29
273 0.26
274 0.29
275 0.31
276 0.31
277 0.31
278 0.25
279 0.22
280 0.27
281 0.25
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.18
287 0.15
288 0.08
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.11
307 0.12
308 0.15
309 0.21
310 0.24
311 0.31
312 0.39
313 0.45
314 0.45
315 0.47
316 0.44
317 0.39
318 0.42
319 0.39
320 0.34
321 0.27
322 0.27
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.2
327 0.18
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.2
338 0.21
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.12
343 0.12
344 0.17
345 0.21
346 0.24
347 0.29
348 0.31
349 0.3
350 0.35
351 0.41
352 0.42
353 0.45
354 0.47
355 0.48
356 0.54
357 0.62
358 0.63
359 0.61
360 0.59
361 0.56
362 0.58
363 0.59
364 0.57
365 0.56
366 0.6
367 0.66
368 0.69
369 0.73
370 0.69
371 0.66
372 0.65
373 0.62
374 0.59
375 0.55
376 0.47
377 0.45
378 0.48
379 0.46
380 0.47
381 0.46
382 0.47
383 0.47
384 0.54
385 0.55
386 0.61
387 0.64
388 0.68
389 0.68
390 0.63
391 0.61
392 0.57
393 0.49
394 0.4
395 0.35
396 0.27
397 0.29
398 0.27
399 0.22
400 0.19
401 0.24
402 0.27
403 0.32
404 0.32
405 0.28
406 0.28
407 0.31
408 0.32
409 0.29
410 0.27
411 0.22
412 0.22
413 0.23
414 0.23
415 0.2
416 0.2
417 0.21
418 0.23
419 0.31
420 0.4
421 0.47
422 0.55
423 0.66
424 0.76
425 0.81
426 0.89
427 0.9
428 0.91
429 0.91
430 0.94
431 0.94
432 0.94
433 0.95
434 0.96
435 0.96
436 0.96
437 0.91
438 0.87
439 0.83
440 0.79
441 0.76
442 0.71
443 0.69
444 0.65
445 0.63
446 0.6
447 0.55
448 0.49
449 0.47
450 0.46
451 0.42