Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X7Z5

Protein Details
Accession R4X7Z5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
418-438DEAAKPKSRVKVFKGKRQEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-435AAKPKSRVKVFKGKRQ
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MQALKEDDIEQVDTEEPILRRHRVVKDNTAGLPRYVVRHARVPKPRTVPMNKTEEEIGLTAKLLSTIESTVEGCKKELEVLYKDRNRRRRDLVALNMADSSKQDPALIKMQADIERLQRIATDRHTRFMKNNEVPGRMVPHITDYSENTRHLNGKIHDALRTPADDQLSTLADILTRTKTAPSVKSFNIMISRLSRLRQNVAAWVIFQTMLRLKYQPDAYTISSVLNLCIASGSYTDFSKILTAAREQRRIHKLLNPTRIRSSRGLVLMGTIIKGCVKFGRMRRAEVYITLMKAERIKANVEILTAMIQGYSDQGDWDRGRPHLRRLMTLPWDRKVVATLIKYCRACNRAELESKVRELAALKGVQVDDDDDDLSLLPLHFKTKGLDVPDHFKMPRKNDIGVLMKRPQRSQPEAGRQDEAAKPKSRVKVFKGKRQEALGKWA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.16
4 0.21
5 0.27
6 0.28
7 0.32
8 0.4
9 0.48
10 0.52
11 0.59
12 0.62
13 0.64
14 0.67
15 0.66
16 0.64
17 0.57
18 0.48
19 0.44
20 0.36
21 0.33
22 0.33
23 0.35
24 0.32
25 0.4
26 0.47
27 0.53
28 0.61
29 0.62
30 0.65
31 0.67
32 0.7
33 0.71
34 0.72
35 0.71
36 0.69
37 0.73
38 0.64
39 0.59
40 0.54
41 0.45
42 0.38
43 0.3
44 0.23
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.15
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.2
64 0.23
65 0.24
66 0.26
67 0.33
68 0.42
69 0.49
70 0.57
71 0.63
72 0.69
73 0.7
74 0.72
75 0.73
76 0.71
77 0.73
78 0.73
79 0.72
80 0.73
81 0.66
82 0.59
83 0.51
84 0.43
85 0.34
86 0.26
87 0.2
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.16
93 0.22
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.23
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.2
105 0.18
106 0.19
107 0.21
108 0.26
109 0.33
110 0.31
111 0.38
112 0.41
113 0.42
114 0.44
115 0.47
116 0.51
117 0.45
118 0.53
119 0.51
120 0.5
121 0.48
122 0.45
123 0.42
124 0.33
125 0.28
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.23
133 0.25
134 0.26
135 0.24
136 0.25
137 0.27
138 0.27
139 0.3
140 0.25
141 0.28
142 0.32
143 0.32
144 0.31
145 0.3
146 0.29
147 0.24
148 0.24
149 0.18
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.12
167 0.16
168 0.2
169 0.23
170 0.27
171 0.27
172 0.3
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.22
177 0.19
178 0.17
179 0.19
180 0.18
181 0.19
182 0.2
183 0.19
184 0.22
185 0.23
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.17
191 0.16
192 0.14
193 0.11
194 0.1
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.1
231 0.19
232 0.24
233 0.32
234 0.32
235 0.4
236 0.45
237 0.47
238 0.46
239 0.43
240 0.48
241 0.49
242 0.58
243 0.54
244 0.51
245 0.56
246 0.56
247 0.54
248 0.46
249 0.4
250 0.35
251 0.32
252 0.29
253 0.22
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.12
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.15
266 0.22
267 0.32
268 0.33
269 0.37
270 0.39
271 0.41
272 0.4
273 0.35
274 0.34
275 0.26
276 0.24
277 0.21
278 0.19
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.16
283 0.15
284 0.17
285 0.17
286 0.2
287 0.19
288 0.17
289 0.15
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.08
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.11
303 0.12
304 0.16
305 0.17
306 0.2
307 0.28
308 0.3
309 0.37
310 0.4
311 0.41
312 0.41
313 0.43
314 0.48
315 0.49
316 0.55
317 0.52
318 0.47
319 0.48
320 0.45
321 0.41
322 0.35
323 0.29
324 0.26
325 0.25
326 0.3
327 0.33
328 0.39
329 0.4
330 0.4
331 0.44
332 0.41
333 0.38
334 0.37
335 0.37
336 0.37
337 0.42
338 0.45
339 0.44
340 0.45
341 0.45
342 0.39
343 0.34
344 0.28
345 0.24
346 0.22
347 0.21
348 0.18
349 0.17
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.15
370 0.19
371 0.23
372 0.26
373 0.31
374 0.33
375 0.39
376 0.41
377 0.44
378 0.4
379 0.44
380 0.47
381 0.47
382 0.53
383 0.5
384 0.49
385 0.47
386 0.54
387 0.56
388 0.54
389 0.55
390 0.53
391 0.54
392 0.56
393 0.56
394 0.56
395 0.56
396 0.58
397 0.6
398 0.63
399 0.68
400 0.72
401 0.72
402 0.67
403 0.59
404 0.57
405 0.53
406 0.5
407 0.46
408 0.44
409 0.45
410 0.5
411 0.58
412 0.61
413 0.64
414 0.65
415 0.69
416 0.73
417 0.79
418 0.83
419 0.81
420 0.79
421 0.79
422 0.79