Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XJ78

Protein Details
Accession R4XJ78    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-353TEDAKVARKKERRESKSAKKKDTLRFEPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-345VARKKERRESKSAKKK
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 10.166, nucl 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNSIASSKAQPNNAWLFDIVKVSDSLAVSTSTNNIAIFDTETLAIRQNIQKAHEDVITGLVNSNDANLIYSSSRDGTVKCWDMRSRQAIRNYRPTAGVLSVAHHPALDKVAVGTELKGTDAIVSVYDSRSPNALVSYPDSHGEDVTSLSWHMHNNLLLSGGGDGIINVIDTTVVDEDDAILQVFNHGSSIHLAQFVGKNEVLAFSHMETASLYKMSYNQEEVPRDEVKEFGDVRSKLAMDYAISFGAGAPATLFTGSSAGHISIIPFNISTMEFEPDQRIDMESGTEVIRSVHVDHAPDSLSGPLLYAASEDGILRAYSKHGSITEDAKVARKKERRESKSAKKKDTLRFEPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.34
3 0.3
4 0.28
5 0.29
6 0.22
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.17
11 0.15
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.12
29 0.12
30 0.15
31 0.14
32 0.17
33 0.2
34 0.23
35 0.26
36 0.28
37 0.32
38 0.32
39 0.34
40 0.31
41 0.28
42 0.23
43 0.24
44 0.21
45 0.16
46 0.15
47 0.12
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.22
65 0.27
66 0.27
67 0.31
68 0.34
69 0.37
70 0.45
71 0.5
72 0.5
73 0.51
74 0.59
75 0.63
76 0.66
77 0.72
78 0.67
79 0.6
80 0.54
81 0.48
82 0.41
83 0.32
84 0.28
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.1
93 0.12
94 0.1
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.15
205 0.18
206 0.23
207 0.25
208 0.26
209 0.28
210 0.26
211 0.26
212 0.24
213 0.21
214 0.17
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.22
219 0.21
220 0.22
221 0.24
222 0.23
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.12
261 0.14
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.15
266 0.15
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.14
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.19
285 0.18
286 0.17
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.2
310 0.22
311 0.26
312 0.26
313 0.28
314 0.28
315 0.33
316 0.37
317 0.37
318 0.44
319 0.48
320 0.54
321 0.62
322 0.72
323 0.72
324 0.78
325 0.84
326 0.85
327 0.89
328 0.9
329 0.88
330 0.86
331 0.88
332 0.87
333 0.87