Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XAH7

Protein Details
Accession R4XAH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-297KAATRRYARKQIKWIRNKLLHydrophilic
394-418SSNGHRAKVKQAKKRQDFVDWKKSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MRDKTVVQVIGTTGVGKSQLGIELAKRLAGEIINSDSMQVYKGLDIITNKHPEQKRDGIVHHLLGFLDQNAEYRIGAYERDATGIIDRLHEAGKMPVVVGGTAYYSTSLVFQDMLPDTGATTPDLAGSIDARLEKTTSELYQDLQGIDPVMATRWHPKDHRKIRRSLEIYYTTGKRQSELYSEQRATGRLGPENVRYRTLFFWLWSDQSVLDTRLDARIDEMIETGLFGEIKSMHQSQDTSTPDFTRGIYQAIGYKEFHNFLQTGNEADRVAGTEAMKAATRRYARKQIKWIRNKLLLQCRQAGDDVQVVLLDATDLSKWDENVLARALKAIDDYATTGPFDPRTYCDPSLHDLLRPKVEKEFSANPDLWEKFVCDVCPTFTTNTKEGWTQHLSSNGHRAKVKQAKKRQDFVDWKKSQKLGSRSNSDSSRSSELSRPAVLTGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.19
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.13
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.13
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.13
32 0.15
33 0.19
34 0.25
35 0.31
36 0.32
37 0.39
38 0.43
39 0.45
40 0.51
41 0.54
42 0.54
43 0.53
44 0.54
45 0.53
46 0.52
47 0.51
48 0.43
49 0.36
50 0.29
51 0.24
52 0.22
53 0.15
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.15
66 0.14
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.15
71 0.19
72 0.18
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.15
141 0.17
142 0.22
143 0.28
144 0.37
145 0.47
146 0.57
147 0.67
148 0.66
149 0.72
150 0.73
151 0.78
152 0.73
153 0.65
154 0.61
155 0.54
156 0.5
157 0.46
158 0.42
159 0.33
160 0.34
161 0.31
162 0.24
163 0.22
164 0.21
165 0.22
166 0.26
167 0.3
168 0.33
169 0.33
170 0.34
171 0.33
172 0.32
173 0.29
174 0.26
175 0.23
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.26
180 0.32
181 0.31
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.27
186 0.29
187 0.22
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.18
226 0.2
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.14
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.14
268 0.19
269 0.23
270 0.3
271 0.4
272 0.47
273 0.54
274 0.64
275 0.68
276 0.74
277 0.79
278 0.81
279 0.78
280 0.78
281 0.76
282 0.73
283 0.73
284 0.7
285 0.63
286 0.6
287 0.53
288 0.46
289 0.42
290 0.34
291 0.26
292 0.21
293 0.17
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.05
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.12
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.15
313 0.13
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.13
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.16
331 0.21
332 0.27
333 0.28
334 0.29
335 0.31
336 0.34
337 0.39
338 0.36
339 0.35
340 0.35
341 0.36
342 0.42
343 0.41
344 0.38
345 0.38
346 0.4
347 0.37
348 0.38
349 0.42
350 0.39
351 0.42
352 0.42
353 0.37
354 0.41
355 0.4
356 0.34
357 0.27
358 0.24
359 0.21
360 0.23
361 0.22
362 0.18
363 0.19
364 0.21
365 0.22
366 0.23
367 0.23
368 0.28
369 0.32
370 0.31
371 0.33
372 0.31
373 0.33
374 0.33
375 0.37
376 0.35
377 0.32
378 0.33
379 0.39
380 0.39
381 0.39
382 0.47
383 0.44
384 0.44
385 0.44
386 0.43
387 0.46
388 0.54
389 0.6
390 0.6
391 0.67
392 0.73
393 0.8
394 0.86
395 0.8
396 0.8
397 0.82
398 0.81
399 0.82
400 0.78
401 0.75
402 0.74
403 0.73
404 0.68
405 0.66
406 0.65
407 0.64
408 0.67
409 0.69
410 0.66
411 0.7
412 0.68
413 0.63
414 0.57
415 0.52
416 0.5
417 0.44
418 0.43
419 0.42
420 0.44
421 0.44
422 0.42
423 0.38