FuNGI

R4XJ14

Protein Details

Accession

R4XJ14

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-30	SSISIRAPKRKAPARPPPNKSNARPAVKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-30	RAPKRKAPARPPPNKSNARPAVKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSISIRAPKRKAPARPPPNKSNARPAVKKEPIEVPLDTRKWTSYTLRAGRTLSEDDGTRFNVMRFQAGKAISPASDFRRPVKLARRDLNELTADQIEEGGEEGEEASAAAAVALAATTAAVPPAAPAKPAYSVAPHGGQPLERKQFRKRTHEVYQQDEAVRQLRQEERFPWLLEDEGGKNVYQGSLEGGQGGTYVFLRLTADGFDVTPVSKFYRFGQRQKYQTMSLDEAEEKMKKHKSLPRWVMKDMEDGTRPGTPQDEPQRQYRMKTTSSNQKLNIKAEEQEEELDFNEDFADDEEQHGLVDDEEDNKELEERIKKEQLSANALGDADPEVENEADEATKLKLDKEGRRVQRFLEKLEKNNMYESDSNSNPYGSSSSDSEDEKDAKTSATTSTKGEDDEKKKSLEKSRDEKIRESVNKLQNQSRTTYNTPTGSTVISRTSSSSTLGNARAHARAKRTRPDLITLKLSPAVLAKFSDIPSSAAADKKRRAAGSDGYDSDRSQKKLRFQAAGSPSPPLSRAASPLAGSAGSRPVSPTGTPDPDKDLITAAELRALVTGAASSGGLSMKGLLRILRPKLAREPRNKTILGELMKAGGLAIVEGKLSIKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.81
3	0.86
4	0.87
5	0.87
6	0.89
7	0.88
8	0.83
9	0.83
10	0.82
11	0.81
12	0.8
13	0.78
14	0.78
15	0.77
16	0.73
17	0.67
18	0.64
19	0.58
20	0.55
21	0.48
22	0.44
23	0.45
24	0.45
25	0.42
26	0.37
27	0.36
28	0.34
29	0.37
30	0.37
31	0.35
32	0.44
33	0.49
34	0.51
35	0.52
36	0.51
37	0.48
38	0.47
39	0.43
40	0.34
41	0.29
42	0.26
43	0.25
44	0.27
45	0.26
46	0.24
47	0.21
48	0.19
49	0.22
50	0.21
51	0.26
52	0.25
53	0.25
54	0.29
55	0.28
56	0.3
57	0.27
58	0.28
59	0.21
60	0.22
61	0.24
62	0.25
63	0.31
64	0.32
65	0.33
66	0.4
67	0.42
68	0.47
69	0.54
70	0.57
71	0.59
72	0.66
73	0.68
74	0.67
75	0.67
76	0.64
77	0.56
78	0.46
79	0.39
80	0.32
81	0.25
82	0.18
83	0.16
84	0.11
85	0.09
86	0.09
87	0.06
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.03
96	0.03
97	0.03
98	0.03
99	0.03
100	0.03
101	0.02
102	0.02
103	0.02
104	0.02
105	0.03
106	0.03
107	0.03
108	0.03
109	0.03
110	0.04
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.11
115	0.13
116	0.15
117	0.17
118	0.17
119	0.16
120	0.18
121	0.2
122	0.21
123	0.2
124	0.2
125	0.2
126	0.2
127	0.23
128	0.29
129	0.35
130	0.39
131	0.43
132	0.51
133	0.6
134	0.66
135	0.71
136	0.69
137	0.69
138	0.73
139	0.78
140	0.74
141	0.7
142	0.66
143	0.6
144	0.53
145	0.46
146	0.38
147	0.31
148	0.26
149	0.2
150	0.21
151	0.23
152	0.25
153	0.28
154	0.28
155	0.31
156	0.34
157	0.34
158	0.3
159	0.25
160	0.22
161	0.19
162	0.2
163	0.15
164	0.14
165	0.14
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.11
170	0.08
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.06
181	0.04
182	0.05
183	0.04
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.14
201	0.25
202	0.31
203	0.38
204	0.48
205	0.52
206	0.56
207	0.6
208	0.61
209	0.52
210	0.5
211	0.46
212	0.38
213	0.32
214	0.28
215	0.24
216	0.21
217	0.21
218	0.19
219	0.15
220	0.19
221	0.22
222	0.22
223	0.3
224	0.35
225	0.42
226	0.51
227	0.6
228	0.64
229	0.65
230	0.65
231	0.61
232	0.55
233	0.51
234	0.42
235	0.35
236	0.26
237	0.22
238	0.22
239	0.19
240	0.18
241	0.14
242	0.14
243	0.11
244	0.17
245	0.26
246	0.32
247	0.33
248	0.38
249	0.46
250	0.45
251	0.47
252	0.46
253	0.41
254	0.37
255	0.4
256	0.4
257	0.43
258	0.49
259	0.52
260	0.49
261	0.51
262	0.51
263	0.48
264	0.46
265	0.36
266	0.31
267	0.28
268	0.26
269	0.2
270	0.17
271	0.15
272	0.13
273	0.12
274	0.1
275	0.09
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.1
300	0.14
301	0.16
302	0.21
303	0.25
304	0.25
305	0.28
306	0.31
307	0.3
308	0.31
309	0.29
310	0.25
311	0.21
312	0.21
313	0.18
314	0.15
315	0.11
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.04
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.12
332	0.19
333	0.24
334	0.32
335	0.41
336	0.48
337	0.53
338	0.54
339	0.51
340	0.53
341	0.49
342	0.45
343	0.47
344	0.41
345	0.4
346	0.47
347	0.48
348	0.4
349	0.41
350	0.37
351	0.31
352	0.29
353	0.28
354	0.25
355	0.22
356	0.23
357	0.21
358	0.21
359	0.16
360	0.16
361	0.14
362	0.1
363	0.11
364	0.1
365	0.12
366	0.13
367	0.14
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.15
373	0.14
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.13
378	0.16
379	0.17
380	0.16
381	0.18
382	0.19
383	0.2
384	0.24
385	0.28
386	0.3
387	0.35
388	0.36
389	0.37
390	0.4
391	0.45
392	0.49
393	0.5
394	0.53
395	0.54
396	0.6
397	0.66
398	0.65
399	0.62
400	0.58
401	0.59
402	0.54
403	0.54
404	0.55
405	0.55
406	0.57
407	0.57
408	0.57
409	0.53
410	0.51
411	0.47
412	0.42
413	0.41
414	0.39
415	0.4
416	0.39
417	0.35
418	0.35
419	0.34
420	0.3
421	0.25
422	0.22
423	0.19
424	0.16
425	0.16
426	0.15
427	0.15
428	0.16
429	0.16
430	0.16
431	0.16
432	0.15
433	0.18
434	0.22
435	0.21
436	0.21
437	0.23
438	0.26
439	0.3
440	0.31
441	0.35
442	0.4
443	0.46
444	0.53
445	0.56
446	0.58
447	0.56
448	0.61
449	0.59
450	0.55
451	0.54
452	0.46
453	0.43
454	0.38
455	0.35
456	0.27
457	0.23
458	0.2
459	0.14
460	0.14
461	0.14
462	0.15
463	0.15
464	0.17
465	0.15
466	0.15
467	0.15
468	0.17
469	0.17
470	0.19
471	0.24
472	0.29
473	0.33
474	0.38
475	0.42
476	0.4
477	0.41
478	0.42
479	0.44
480	0.44
481	0.46
482	0.42
483	0.41
484	0.41
485	0.38
486	0.41
487	0.39
488	0.36
489	0.37
490	0.4
491	0.45
492	0.54
493	0.6
494	0.57
495	0.52
496	0.58
497	0.59
498	0.59
499	0.51
500	0.45
501	0.39
502	0.35
503	0.35
504	0.27
505	0.24
506	0.19
507	0.22
508	0.22
509	0.24
510	0.23
511	0.23
512	0.21
513	0.18
514	0.16
515	0.14
516	0.16
517	0.14
518	0.14
519	0.15
520	0.16
521	0.19
522	0.19
523	0.23
524	0.25
525	0.32
526	0.34
527	0.34
528	0.39
529	0.39
530	0.39
531	0.34
532	0.29
533	0.21
534	0.22
535	0.23
536	0.16
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.14
541	0.13
542	0.1
543	0.08
544	0.08
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.08
554	0.1
555	0.12
556	0.13
557	0.14
558	0.2
559	0.28
560	0.32
561	0.38
562	0.38
563	0.42
564	0.52
565	0.61
566	0.64
567	0.67
568	0.72
569	0.72
570	0.77
571	0.73
572	0.64
573	0.6
574	0.58
575	0.51
576	0.45
577	0.37
578	0.31
579	0.3
580	0.28
581	0.2
582	0.13
583	0.09
584	0.07
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.07

R4XJ14

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer