Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XH52

Protein Details
Accession R4XH52    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-240QEQWQELEKREKKRRSVQQQKLKAAGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-194KKGGRDLFKGSGKK
223-228REKKRR
249-290AKKLKASEAPKAIKSKKDAPATRKVSGASARKASGSRKVSVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MPAKRKQAEVAKSAEPTETTQDEFTAFESGSDEEESSVGDETEMSAEKRAELLKGFDSDSESDDEAQGDEDNRIIELSNLTPTISSALTKKKKVDETGILYIGRIPHGFYEEEMTSYFSQFGTILNLRMSRSKKTGRSKHYAFIEFGDRGVAEIVAQTMHNYLLASHLLQVILLTPEEFKKKGGRDLFKGSGKKFKAVPWAQIAKDRVESPKTQEQWQELEKREKKRRSVQQQKLKAAGIDYEYESPAAKKLKASEAPKAIKSKKDAPATRKVSGASARKASGSRKVSVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.33
3 0.29
4 0.3
5 0.26
6 0.24
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.18
12 0.14
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.17
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.18
44 0.2
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.12
53 0.12
54 0.1
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.21
75 0.27
76 0.31
77 0.35
78 0.4
79 0.45
80 0.47
81 0.5
82 0.47
83 0.48
84 0.48
85 0.46
86 0.39
87 0.34
88 0.31
89 0.26
90 0.19
91 0.13
92 0.09
93 0.08
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.19
116 0.21
117 0.2
118 0.25
119 0.31
120 0.38
121 0.48
122 0.56
123 0.57
124 0.64
125 0.63
126 0.64
127 0.63
128 0.56
129 0.46
130 0.39
131 0.35
132 0.27
133 0.24
134 0.18
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.17
168 0.19
169 0.27
170 0.34
171 0.37
172 0.4
173 0.47
174 0.52
175 0.53
176 0.56
177 0.5
178 0.51
179 0.47
180 0.46
181 0.4
182 0.37
183 0.41
184 0.39
185 0.41
186 0.41
187 0.45
188 0.42
189 0.46
190 0.45
191 0.36
192 0.36
193 0.34
194 0.3
195 0.28
196 0.29
197 0.3
198 0.37
199 0.37
200 0.39
201 0.41
202 0.4
203 0.41
204 0.45
205 0.46
206 0.42
207 0.51
208 0.54
209 0.6
210 0.67
211 0.7
212 0.73
213 0.75
214 0.81
215 0.81
216 0.86
217 0.86
218 0.87
219 0.89
220 0.87
221 0.81
222 0.71
223 0.6
224 0.5
225 0.42
226 0.33
227 0.25
228 0.21
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.18
235 0.19
236 0.18
237 0.2
238 0.24
239 0.32
240 0.4
241 0.44
242 0.48
243 0.54
244 0.58
245 0.61
246 0.66
247 0.62
248 0.6
249 0.62
250 0.63
251 0.62
252 0.67
253 0.7
254 0.67
255 0.73
256 0.73
257 0.69
258 0.62
259 0.54
260 0.5
261 0.5
262 0.52
263 0.48
264 0.46
265 0.45
266 0.45
267 0.48
268 0.47
269 0.49
270 0.45