Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XG39

Protein Details
Accession R4XG39    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-208SKADVKSKKLKKTGPGRVKKVAKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-49KPRQAKKSRPAKAATAGNGVKKPSVKSTTKPGAGA
184-206NSKADVKSKKLKKTGPGRVKKVA
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 11.333, cyto 5.5, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSNLDQSLDAILAAKPRQAKKSRPAKAATAGNGVKKPSVKSTTKPGAGAKAAVAKTLAKVPESSKIIVHGLPADVTEKQIKEYMTAEIGPVARCELAYNAQGKSKGSATIVFRKDSNQNYAQKACALLNGRSVDSTGPKPLKMRVEIITEVPQPGLADRLGGLPKSVAQAVAKGQKKSGAVVPNSKADVKSKKLKKTGPGRVKKVAKTAEELDAEMSDYFATK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.22
3 0.28
4 0.37
5 0.44
6 0.52
7 0.58
8 0.68
9 0.74
10 0.74
11 0.74
12 0.7
13 0.7
14 0.68
15 0.61
16 0.58
17 0.52
18 0.5
19 0.48
20 0.43
21 0.38
22 0.34
23 0.34
24 0.33
25 0.38
26 0.37
27 0.39
28 0.48
29 0.53
30 0.53
31 0.53
32 0.48
33 0.45
34 0.42
35 0.39
36 0.3
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.21
41 0.17
42 0.16
43 0.2
44 0.19
45 0.13
46 0.15
47 0.16
48 0.23
49 0.25
50 0.25
51 0.21
52 0.22
53 0.23
54 0.21
55 0.2
56 0.14
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.1
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.11
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.15
95 0.16
96 0.24
97 0.26
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.3
102 0.29
103 0.31
104 0.29
105 0.32
106 0.35
107 0.35
108 0.34
109 0.29
110 0.27
111 0.22
112 0.19
113 0.17
114 0.14
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.2
127 0.24
128 0.28
129 0.27
130 0.29
131 0.26
132 0.29
133 0.29
134 0.3
135 0.29
136 0.25
137 0.23
138 0.2
139 0.17
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.11
157 0.15
158 0.24
159 0.28
160 0.27
161 0.27
162 0.3
163 0.31
164 0.31
165 0.33
166 0.31
167 0.31
168 0.38
169 0.4
170 0.4
171 0.42
172 0.41
173 0.36
174 0.36
175 0.39
176 0.39
177 0.46
178 0.51
179 0.58
180 0.65
181 0.7
182 0.72
183 0.76
184 0.8
185 0.81
186 0.83
187 0.81
188 0.82
189 0.84
190 0.79
191 0.78
192 0.74
193 0.66
194 0.61
195 0.57
196 0.54
197 0.47
198 0.42
199 0.35
200 0.28
201 0.26
202 0.2
203 0.16