Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XEV9

Protein Details
Accession R4XEV9    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-232EDPLEPPKHRHRKVPRGPGSPBasic
580-601EEAEDNERRRKRNKTVKASKWDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-236PKHRHRKVPRGPGSPPPPI
324-410KEKKEEQLRLLAQRAREGRNARSPPRRSRSRSLSSGGSRSVSRSPPRRAGRDRSVSRRRRSHSSSEDENVRERERLRRERRQDAERA
587-596RRRKRNKTVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSALSRILPNPKHEDARPRKLYVEEDEESNISKSTAVVKQNGAPAYGHRQGWIPRAQEDFGDGGAYPEINMAQYPLEMGLKTKKAGAALALQVDADGKIQYDAIAKQGRDAQSSKIIHTSFKDLVPLRNRANAGELSLDRPTEEEVQATADRTNAALQMVVSGQLAASRPKTVKTQRKNEPTYVRYTPANQMGEASDVSHKQRIIKMVDLPEDPLEPPKHRHRKVPRGPGSPPPPIMHSPPRKISAKDQQDWMIPPSISNWKNAKGYTVPLEARLAADGRGLQDTSINDNFAKLSEALYMADRHAREEVRSRSQMQQRIAQREKEKKEEQLRLLAQRAREGRNARSPPRRSRSRSLSSGGSRSVSRSPPRRAGRDRSVSRRRRSHSSSEDENVRERERLRRERRQDAERAMRVGKMGREAQMKHLERENNRDVSEKIALGLAKPTASKEAMYDQRLFNQTAGMDSGFGADDSYNLYDKPLFANREAANAIYKPFQGQQDDEDETVENVTKDARFDVLGRAGQGFKGAEDVEAREGPVQFERDEGEDKFGVTQLLEEAKRANPSRTERDGADAGTASRGDEEAEDNERRRKRNKTVKASKWD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.62
3 0.69
4 0.7
5 0.65
6 0.62
7 0.61
8 0.61
9 0.57
10 0.54
11 0.45
12 0.41
13 0.4
14 0.37
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.17
22 0.23
23 0.26
24 0.29
25 0.31
26 0.35
27 0.41
28 0.41
29 0.36
30 0.3
31 0.3
32 0.34
33 0.37
34 0.32
35 0.27
36 0.31
37 0.34
38 0.41
39 0.43
40 0.37
41 0.36
42 0.4
43 0.39
44 0.35
45 0.33
46 0.27
47 0.2
48 0.19
49 0.14
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.12
66 0.18
67 0.2
68 0.21
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.23
73 0.23
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.14
82 0.1
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.1
90 0.16
91 0.21
92 0.21
93 0.23
94 0.29
95 0.3
96 0.31
97 0.32
98 0.3
99 0.33
100 0.35
101 0.34
102 0.34
103 0.33
104 0.31
105 0.32
106 0.35
107 0.28
108 0.27
109 0.32
110 0.28
111 0.35
112 0.39
113 0.43
114 0.4
115 0.43
116 0.43
117 0.37
118 0.39
119 0.32
120 0.26
121 0.24
122 0.22
123 0.19
124 0.2
125 0.19
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.13
132 0.12
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.13
156 0.14
157 0.17
158 0.25
159 0.34
160 0.44
161 0.51
162 0.6
163 0.67
164 0.76
165 0.8
166 0.79
167 0.78
168 0.71
169 0.68
170 0.61
171 0.54
172 0.45
173 0.43
174 0.4
175 0.38
176 0.35
177 0.28
178 0.26
179 0.24
180 0.23
181 0.2
182 0.16
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.22
190 0.26
191 0.27
192 0.28
193 0.31
194 0.32
195 0.34
196 0.31
197 0.3
198 0.25
199 0.23
200 0.2
201 0.2
202 0.19
203 0.18
204 0.24
205 0.33
206 0.43
207 0.45
208 0.55
209 0.6
210 0.69
211 0.77
212 0.82
213 0.81
214 0.76
215 0.77
216 0.76
217 0.71
218 0.64
219 0.57
220 0.47
221 0.41
222 0.37
223 0.39
224 0.4
225 0.41
226 0.42
227 0.43
228 0.48
229 0.47
230 0.47
231 0.5
232 0.5
233 0.51
234 0.49
235 0.48
236 0.44
237 0.43
238 0.42
239 0.36
240 0.29
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.24
245 0.22
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.3
250 0.3
251 0.3
252 0.23
253 0.24
254 0.22
255 0.24
256 0.2
257 0.19
258 0.2
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.11
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.2
295 0.24
296 0.27
297 0.3
298 0.32
299 0.37
300 0.43
301 0.47
302 0.42
303 0.44
304 0.44
305 0.51
306 0.51
307 0.5
308 0.51
309 0.55
310 0.56
311 0.57
312 0.54
313 0.53
314 0.58
315 0.59
316 0.53
317 0.51
318 0.5
319 0.46
320 0.48
321 0.42
322 0.34
323 0.32
324 0.34
325 0.29
326 0.32
327 0.32
328 0.32
329 0.4
330 0.45
331 0.47
332 0.53
333 0.58
334 0.62
335 0.68
336 0.73
337 0.7
338 0.73
339 0.75
340 0.72
341 0.7
342 0.63
343 0.61
344 0.54
345 0.5
346 0.42
347 0.35
348 0.28
349 0.26
350 0.26
351 0.25
352 0.3
353 0.35
354 0.4
355 0.48
356 0.54
357 0.6
358 0.63
359 0.66
360 0.68
361 0.7
362 0.71
363 0.72
364 0.77
365 0.77
366 0.79
367 0.79
368 0.75
369 0.73
370 0.73
371 0.72
372 0.69
373 0.67
374 0.64
375 0.59
376 0.59
377 0.52
378 0.5
379 0.43
380 0.36
381 0.32
382 0.28
383 0.33
384 0.38
385 0.47
386 0.52
387 0.6
388 0.66
389 0.74
390 0.79
391 0.78
392 0.75
393 0.73
394 0.73
395 0.65
396 0.61
397 0.52
398 0.45
399 0.39
400 0.35
401 0.27
402 0.22
403 0.22
404 0.23
405 0.27
406 0.27
407 0.33
408 0.4
409 0.41
410 0.38
411 0.42
412 0.45
413 0.42
414 0.5
415 0.49
416 0.43
417 0.42
418 0.42
419 0.36
420 0.34
421 0.33
422 0.25
423 0.19
424 0.17
425 0.16
426 0.14
427 0.16
428 0.12
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.2
437 0.26
438 0.29
439 0.31
440 0.29
441 0.35
442 0.37
443 0.36
444 0.29
445 0.24
446 0.21
447 0.19
448 0.19
449 0.13
450 0.1
451 0.09
452 0.1
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.16
466 0.2
467 0.21
468 0.22
469 0.3
470 0.29
471 0.32
472 0.32
473 0.28
474 0.25
475 0.23
476 0.23
477 0.18
478 0.18
479 0.17
480 0.2
481 0.23
482 0.23
483 0.24
484 0.25
485 0.29
486 0.31
487 0.29
488 0.26
489 0.23
490 0.2
491 0.19
492 0.17
493 0.11
494 0.09
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.13
502 0.18
503 0.21
504 0.21
505 0.21
506 0.22
507 0.22
508 0.21
509 0.22
510 0.17
511 0.12
512 0.14
513 0.13
514 0.12
515 0.13
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.21
524 0.21
525 0.17
526 0.18
527 0.19
528 0.19
529 0.23
530 0.22
531 0.23
532 0.21
533 0.22
534 0.21
535 0.2
536 0.18
537 0.14
538 0.13
539 0.11
540 0.17
541 0.17
542 0.17
543 0.19
544 0.21
545 0.3
546 0.32
547 0.34
548 0.35
549 0.43
550 0.51
551 0.55
552 0.57
553 0.5
554 0.53
555 0.51
556 0.43
557 0.37
558 0.29
559 0.23
560 0.21
561 0.2
562 0.14
563 0.13
564 0.12
565 0.1
566 0.11
567 0.13
568 0.14
569 0.2
570 0.25
571 0.29
572 0.38
573 0.44
574 0.5
575 0.55
576 0.62
577 0.67
578 0.73
579 0.8
580 0.83
581 0.87