Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XDS5

Protein Details
Accession R4XDS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-434ANAAREEKKKERKFDSRTDKPFDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-423AREREAANAAREEKKKERK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPPKKNKGAKISLAEFNESAGGGSNWADEMDDMPSAQPGFASAQPGFASQSSGYGASSGGGGGYGSERRTYESSTPRDPIFATNSRGADMERAGWTTRAEVPMPDRPPYTAHIGNLTFDASEAEISDFFSGAGAKVKGVRLMRDRETDRPRGFGYVEFEDLDSLKAALPLSGSPLAGRDVRVTVAEAPKQGFGDREPERDLDWGSARGSKGPLAPLDRPSRGYESRSGGYESRGGGSSFDRESRGGGYESARREYEPREARAPREPERDLDWGSARSRGPLPPAETSQREGGYQSRPGYGERRDSERRPYGGERRDSERRERDSGPDLDWSSRKGPLSPSAEGGASGPAERRKLSLAPRSAADGTSTPASLASPVSTRASPFGAARAVDTSAAEKKAEEKRQQLAREREAANAAREEKKKERKFDSRTDKPFDILRRTEDMSLEDDKEAQNVDAKADAELAAIEKQDHAAASSEAAPESDGWTSINKNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.5
3 0.41
4 0.34
5 0.25
6 0.19
7 0.14
8 0.12
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.18
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.17
35 0.18
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.05
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.24
58 0.3
59 0.37
60 0.42
61 0.45
62 0.48
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.37
67 0.35
68 0.34
69 0.33
70 0.35
71 0.35
72 0.34
73 0.33
74 0.3
75 0.25
76 0.2
77 0.19
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.19
88 0.23
89 0.3
90 0.33
91 0.33
92 0.3
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.33
97 0.27
98 0.25
99 0.28
100 0.28
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.13
124 0.18
125 0.19
126 0.24
127 0.26
128 0.32
129 0.36
130 0.41
131 0.44
132 0.48
133 0.54
134 0.57
135 0.52
136 0.49
137 0.46
138 0.41
139 0.38
140 0.32
141 0.3
142 0.23
143 0.23
144 0.2
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.14
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.14
179 0.11
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.17
201 0.19
202 0.24
203 0.28
204 0.28
205 0.29
206 0.29
207 0.32
208 0.3
209 0.3
210 0.29
211 0.28
212 0.28
213 0.27
214 0.27
215 0.22
216 0.21
217 0.21
218 0.17
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.26
243 0.27
244 0.28
245 0.33
246 0.35
247 0.37
248 0.43
249 0.46
250 0.43
251 0.44
252 0.42
253 0.37
254 0.39
255 0.4
256 0.33
257 0.29
258 0.25
259 0.21
260 0.21
261 0.23
262 0.19
263 0.18
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.21
268 0.23
269 0.22
270 0.25
271 0.28
272 0.27
273 0.28
274 0.28
275 0.25
276 0.22
277 0.2
278 0.2
279 0.19
280 0.22
281 0.21
282 0.2
283 0.21
284 0.22
285 0.26
286 0.26
287 0.31
288 0.29
289 0.35
290 0.39
291 0.41
292 0.48
293 0.5
294 0.47
295 0.44
296 0.48
297 0.5
298 0.52
299 0.55
300 0.5
301 0.5
302 0.57
303 0.56
304 0.59
305 0.59
306 0.57
307 0.56
308 0.54
309 0.51
310 0.5
311 0.48
312 0.4
313 0.36
314 0.32
315 0.3
316 0.29
317 0.28
318 0.23
319 0.25
320 0.24
321 0.21
322 0.22
323 0.27
324 0.32
325 0.3
326 0.3
327 0.27
328 0.27
329 0.25
330 0.22
331 0.15
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.17
340 0.22
341 0.29
342 0.34
343 0.37
344 0.37
345 0.37
346 0.4
347 0.38
348 0.33
349 0.28
350 0.2
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.21
383 0.3
384 0.38
385 0.42
386 0.44
387 0.51
388 0.59
389 0.66
390 0.69
391 0.68
392 0.65
393 0.67
394 0.62
395 0.56
396 0.54
397 0.49
398 0.42
399 0.38
400 0.37
401 0.37
402 0.39
403 0.44
404 0.48
405 0.57
406 0.62
407 0.66
408 0.71
409 0.74
410 0.79
411 0.82
412 0.83
413 0.83
414 0.83
415 0.82
416 0.74
417 0.66
418 0.64
419 0.61
420 0.59
421 0.51
422 0.48
423 0.45
424 0.46
425 0.46
426 0.41
427 0.35
428 0.31
429 0.31
430 0.28
431 0.23
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.16
437 0.18
438 0.17
439 0.17
440 0.18
441 0.18
442 0.17
443 0.17
444 0.17
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.13
459 0.15
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.12
465 0.14
466 0.13
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.19