Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XFZ9

Protein Details
Accession R4XFZ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-121AAAQSAKQTKRRKSNEIMEENDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-403DKRKEERRKEAAK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MATRIIVKNLPPYLTQDAFTKHFSDYSSPTDSKLQTSKSGKSRRFGFVGFQSITEAESAVQHWNNTYVGSTKINAELARTVEEESATNYKRKRPAEDAVAAAQSAKQTKRRKSNEIMEENDPKFREFLRLNEKRSKSRTFLNDDEEFVQQAAVEEEPDVIETQDDMEYEPIPQKPVEEYVVIDHEPLPVEASEPIRVAVEVPQDADDAEWLRNRTSRILDLTDGTEEQMPRTNLISSAQTHSMQPIITDKSKSVSKIVPQGPVMAPVKSEEELKAERAASDAAAKVEAIKTIKDTARLFLRNLAFTVDEAALKTLFENYGGVQEVHIPQSANGTPKGNAYIHFDRANDAIAAYQDLDGKSFHGRLLHILPGQAKITIEKPQAPGAKLNVGDKRKEERRKEAAKSRFNWNSLFLNQDAVMENTAKKFGVSKSELLDASQSSAAVTMALAESSALNTIKKFFLSHGVNLQSFSQTRQKDDSILLFKNLPSHANEGELTKLVEGAGGVIRRIVIPDIGGLAIVEVVDGNQGKSVFGKLAYRKFGDGLIYLEKGPVNTFTSAVVPEKSTGKGEDTARTADASDDSDASTEMERATVFVKNLNFETRAPELTKVFESLKGFRQATVKTKPNPKEPGARLSMGFGFVEFANEADARTAINTMQGFSLDAHALTLSLSTGKSTDRKTQQGAAAGTAGTAGTKVIVKNLPFETTRGDVARLFGTYGSIKSIRVPKKYNAHLRGFAFLEFVSKREAKNAIEALEGTHLLGRRLVIQYAEAELRGDEGVDQLVQKTRSKRVALERAEGGRRKVGKVNLDGTEADAFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.34
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.33
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.28
12 0.28
13 0.31
14 0.36
15 0.34
16 0.36
17 0.41
18 0.4
19 0.41
20 0.43
21 0.4
22 0.42
23 0.48
24 0.54
25 0.57
26 0.66
27 0.65
28 0.67
29 0.7
30 0.67
31 0.66
32 0.59
33 0.56
34 0.53
35 0.55
36 0.48
37 0.41
38 0.36
39 0.32
40 0.3
41 0.23
42 0.17
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.14
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.2
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.23
66 0.21
67 0.2
68 0.18
69 0.19
70 0.17
71 0.18
72 0.24
73 0.24
74 0.29
75 0.31
76 0.38
77 0.46
78 0.5
79 0.53
80 0.53
81 0.59
82 0.62
83 0.63
84 0.59
85 0.54
86 0.49
87 0.41
88 0.34
89 0.27
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.29
94 0.38
95 0.47
96 0.58
97 0.65
98 0.71
99 0.75
100 0.81
101 0.82
102 0.81
103 0.77
104 0.72
105 0.73
106 0.65
107 0.61
108 0.51
109 0.41
110 0.35
111 0.31
112 0.32
113 0.26
114 0.33
115 0.39
116 0.46
117 0.52
118 0.6
119 0.65
120 0.66
121 0.7
122 0.68
123 0.61
124 0.62
125 0.64
126 0.62
127 0.62
128 0.6
129 0.56
130 0.52
131 0.5
132 0.42
133 0.34
134 0.25
135 0.2
136 0.13
137 0.11
138 0.1
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.18
163 0.19
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.2
168 0.19
169 0.17
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.17
200 0.19
201 0.21
202 0.23
203 0.25
204 0.25
205 0.27
206 0.27
207 0.26
208 0.25
209 0.23
210 0.2
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.15
224 0.18
225 0.2
226 0.2
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.16
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.21
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.23
242 0.25
243 0.33
244 0.36
245 0.36
246 0.34
247 0.36
248 0.32
249 0.35
250 0.32
251 0.23
252 0.2
253 0.17
254 0.19
255 0.16
256 0.17
257 0.12
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.15
279 0.16
280 0.2
281 0.21
282 0.22
283 0.28
284 0.29
285 0.28
286 0.3
287 0.31
288 0.26
289 0.26
290 0.24
291 0.17
292 0.15
293 0.17
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.13
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.19
324 0.16
325 0.15
326 0.21
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.25
331 0.23
332 0.22
333 0.22
334 0.14
335 0.11
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.14
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.15
358 0.16
359 0.14
360 0.12
361 0.1
362 0.11
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.23
368 0.26
369 0.26
370 0.26
371 0.22
372 0.24
373 0.22
374 0.25
375 0.26
376 0.25
377 0.26
378 0.27
379 0.33
380 0.39
381 0.47
382 0.48
383 0.51
384 0.58
385 0.64
386 0.68
387 0.7
388 0.71
389 0.69
390 0.67
391 0.66
392 0.61
393 0.55
394 0.49
395 0.43
396 0.36
397 0.3
398 0.29
399 0.2
400 0.17
401 0.15
402 0.15
403 0.12
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.09
414 0.15
415 0.17
416 0.18
417 0.2
418 0.22
419 0.22
420 0.2
421 0.2
422 0.13
423 0.12
424 0.11
425 0.09
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.16
448 0.18
449 0.19
450 0.23
451 0.25
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.19
456 0.17
457 0.18
458 0.21
459 0.19
460 0.21
461 0.24
462 0.24
463 0.24
464 0.25
465 0.28
466 0.25
467 0.25
468 0.24
469 0.21
470 0.21
471 0.22
472 0.22
473 0.18
474 0.15
475 0.17
476 0.16
477 0.17
478 0.17
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.12
483 0.09
484 0.08
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.03
507 0.03
508 0.02
509 0.02
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.15
521 0.19
522 0.24
523 0.28
524 0.28
525 0.28
526 0.28
527 0.28
528 0.24
529 0.19
530 0.16
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.15
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.12
544 0.13
545 0.14
546 0.13
547 0.11
548 0.12
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.2
555 0.21
556 0.23
557 0.24
558 0.24
559 0.23
560 0.22
561 0.2
562 0.16
563 0.14
564 0.12
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.09
578 0.1
579 0.1
580 0.13
581 0.14
582 0.16
583 0.18
584 0.2
585 0.21
586 0.19
587 0.23
588 0.22
589 0.24
590 0.23
591 0.24
592 0.22
593 0.23
594 0.23
595 0.21
596 0.2
597 0.21
598 0.23
599 0.23
600 0.28
601 0.33
602 0.32
603 0.32
604 0.36
605 0.36
606 0.4
607 0.46
608 0.48
609 0.48
610 0.57
611 0.61
612 0.65
613 0.68
614 0.65
615 0.67
616 0.63
617 0.64
618 0.58
619 0.54
620 0.45
621 0.41
622 0.37
623 0.28
624 0.23
625 0.16
626 0.12
627 0.1
628 0.12
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.06
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.11
647 0.14
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.11
661 0.16
662 0.2
663 0.29
664 0.35
665 0.41
666 0.45
667 0.5
668 0.5
669 0.52
670 0.49
671 0.4
672 0.34
673 0.28
674 0.24
675 0.18
676 0.14
677 0.07
678 0.06
679 0.04
680 0.05
681 0.07
682 0.07
683 0.12
684 0.16
685 0.17
686 0.22
687 0.24
688 0.27
689 0.26
690 0.27
691 0.27
692 0.25
693 0.28
694 0.24
695 0.24
696 0.21
697 0.22
698 0.23
699 0.18
700 0.17
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.17
706 0.16
707 0.16
708 0.22
709 0.32
710 0.36
711 0.43
712 0.48
713 0.52
714 0.61
715 0.71
716 0.75
717 0.74
718 0.73
719 0.72
720 0.68
721 0.65
722 0.56
723 0.46
724 0.37
725 0.28
726 0.27
727 0.2
728 0.19
729 0.21
730 0.22
731 0.22
732 0.26
733 0.31
734 0.27
735 0.34
736 0.36
737 0.31
738 0.3
739 0.3
740 0.26
741 0.24
742 0.22
743 0.15
744 0.15
745 0.15
746 0.14
747 0.15
748 0.14
749 0.16
750 0.18
751 0.19
752 0.17
753 0.18
754 0.18
755 0.21
756 0.21
757 0.17
758 0.15
759 0.14
760 0.14
761 0.13
762 0.11
763 0.08
764 0.08
765 0.09
766 0.09
767 0.1
768 0.1
769 0.16
770 0.19
771 0.25
772 0.3
773 0.38
774 0.45
775 0.48
776 0.54
777 0.59
778 0.66
779 0.65
780 0.66
781 0.64
782 0.63
783 0.68
784 0.64
785 0.57
786 0.55
787 0.53
788 0.51
789 0.52
790 0.51
791 0.51
792 0.54
793 0.57
794 0.51
795 0.51
796 0.47
797 0.42