Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XBM9

Protein Details
Accession R4XBM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-192LVSMHGKHRKRARSNPVAPSPRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-202KHRKRARSNPVAPSPRWLKDVSSKKKV
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008862  Tcp11  
Pfam View protein in Pfam  
PF05794  Tcp11  
Amino Acid Sequences MHRRDSIMNKSDTQPHPKNADLPLQEYHGSSTIEDFDATAAALSRLSVLAESSRTDGSASPLLNLDSTYETSTLSSCPSPAKRPSETFDTTLQSSDMKRLRIEVAQHSPLRDTSHIFAQDFVEVDVEPEHSCKDKLVGLGLNCALAPHATSNERPLLDENRPFTLDGCSLVSMHGKHRKRARSNPVAPSPRWLKDVSSKKKVGHSESKALNAVRHRHRDLSSIPKPPITQQTLKELELNEVFKNAQLRHDIVHDPNLQFRPNTDGERGAKKRHEANKYWRSVVYELDTIQSVPKSKLGRTRLSVMFQEMKDILLSLVPVSEKVTLEVSFDHELFLQTLSHGLFSVAAFAQFMSSLMKRHCAPMRDEAIDDTVRQIECATTSLDFVEALRSTFDVLEMMKLDVANHQLRTLRGYLLSTSIEFEKSWFLRKYHTGVQSIESGKSWFQATLPAIETQTSSLDYRACFSKGYTSLFSASAQKSQIPTTFNFDTSRIMSLKKDVRELVYLNLSLLIFKQTNKTCTVAELSAIKVELLTLMSTELSRSTERWVDAVPNIALQILRSSQGSSSNHTPLPSGKDLQFVISWLTTHMNEKSTIFSMVEARVLAALNKLVYHELTVVSTNGQKEPSTIDWGLLESSRNEVQNVSRRMAAVAEYHWKVHGSNYVQWSRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.61
4 0.6
5 0.61
6 0.56
7 0.59
8 0.51
9 0.47
10 0.42
11 0.4
12 0.39
13 0.34
14 0.32
15 0.26
16 0.24
17 0.2
18 0.2
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.14
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.09
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.21
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.15
53 0.13
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.2
65 0.24
66 0.31
67 0.39
68 0.45
69 0.49
70 0.53
71 0.57
72 0.57
73 0.57
74 0.53
75 0.49
76 0.46
77 0.4
78 0.36
79 0.32
80 0.26
81 0.23
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.26
86 0.28
87 0.3
88 0.31
89 0.35
90 0.35
91 0.39
92 0.44
93 0.45
94 0.43
95 0.42
96 0.4
97 0.39
98 0.32
99 0.28
100 0.23
101 0.28
102 0.31
103 0.29
104 0.29
105 0.26
106 0.25
107 0.22
108 0.19
109 0.13
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.19
124 0.22
125 0.2
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.18
130 0.17
131 0.13
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.1
136 0.12
137 0.13
138 0.17
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.24
143 0.26
144 0.3
145 0.35
146 0.33
147 0.32
148 0.33
149 0.32
150 0.29
151 0.27
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.16
159 0.14
160 0.21
161 0.29
162 0.31
163 0.38
164 0.46
165 0.56
166 0.62
167 0.71
168 0.74
169 0.76
170 0.8
171 0.82
172 0.84
173 0.8
174 0.71
175 0.68
176 0.63
177 0.55
178 0.49
179 0.41
180 0.34
181 0.38
182 0.48
183 0.5
184 0.52
185 0.54
186 0.54
187 0.6
188 0.63
189 0.61
190 0.6
191 0.57
192 0.56
193 0.55
194 0.55
195 0.51
196 0.46
197 0.42
198 0.38
199 0.4
200 0.41
201 0.45
202 0.45
203 0.47
204 0.47
205 0.48
206 0.48
207 0.5
208 0.48
209 0.48
210 0.46
211 0.43
212 0.43
213 0.42
214 0.45
215 0.41
216 0.39
217 0.34
218 0.42
219 0.43
220 0.43
221 0.41
222 0.34
223 0.3
224 0.28
225 0.27
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.18
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.2
239 0.25
240 0.26
241 0.24
242 0.28
243 0.29
244 0.27
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.24
250 0.2
251 0.24
252 0.26
253 0.35
254 0.38
255 0.37
256 0.37
257 0.38
258 0.45
259 0.48
260 0.53
261 0.51
262 0.59
263 0.63
264 0.64
265 0.62
266 0.55
267 0.5
268 0.43
269 0.37
270 0.3
271 0.21
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.25
284 0.3
285 0.34
286 0.35
287 0.41
288 0.38
289 0.39
290 0.37
291 0.33
292 0.32
293 0.27
294 0.26
295 0.2
296 0.17
297 0.15
298 0.14
299 0.1
300 0.06
301 0.06
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.17
346 0.21
347 0.21
348 0.24
349 0.29
350 0.33
351 0.31
352 0.31
353 0.27
354 0.26
355 0.24
356 0.2
357 0.14
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.12
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.19
397 0.15
398 0.13
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.14
410 0.14
411 0.2
412 0.22
413 0.22
414 0.25
415 0.29
416 0.33
417 0.36
418 0.4
419 0.37
420 0.35
421 0.36
422 0.38
423 0.36
424 0.31
425 0.24
426 0.2
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.1
431 0.09
432 0.13
433 0.13
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.12
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.13
451 0.13
452 0.19
453 0.21
454 0.24
455 0.24
456 0.23
457 0.24
458 0.25
459 0.25
460 0.25
461 0.23
462 0.22
463 0.21
464 0.21
465 0.21
466 0.23
467 0.25
468 0.21
469 0.22
470 0.26
471 0.26
472 0.26
473 0.26
474 0.25
475 0.24
476 0.23
477 0.25
478 0.19
479 0.19
480 0.18
481 0.24
482 0.29
483 0.29
484 0.31
485 0.3
486 0.31
487 0.33
488 0.33
489 0.29
490 0.26
491 0.24
492 0.2
493 0.2
494 0.17
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.11
499 0.12
500 0.2
501 0.23
502 0.26
503 0.28
504 0.3
505 0.26
506 0.28
507 0.31
508 0.23
509 0.21
510 0.2
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.14
515 0.1
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.09
527 0.11
528 0.11
529 0.15
530 0.19
531 0.2
532 0.21
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.25
537 0.21
538 0.17
539 0.17
540 0.16
541 0.15
542 0.11
543 0.13
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.12
548 0.12
549 0.2
550 0.21
551 0.25
552 0.29
553 0.33
554 0.34
555 0.33
556 0.33
557 0.3
558 0.35
559 0.34
560 0.32
561 0.29
562 0.32
563 0.32
564 0.32
565 0.29
566 0.22
567 0.21
568 0.17
569 0.16
570 0.13
571 0.16
572 0.15
573 0.18
574 0.2
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.23
579 0.22
580 0.23
581 0.19
582 0.18
583 0.2
584 0.19
585 0.2
586 0.16
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.1
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.13
602 0.14
603 0.13
604 0.14
605 0.17
606 0.18
607 0.19
608 0.2
609 0.19
610 0.19
611 0.24
612 0.25
613 0.28
614 0.26
615 0.25
616 0.24
617 0.25
618 0.25
619 0.21
620 0.19
621 0.13
622 0.17
623 0.2
624 0.2
625 0.2
626 0.21
627 0.28
628 0.36
629 0.4
630 0.37
631 0.36
632 0.35
633 0.35
634 0.34
635 0.28
636 0.21
637 0.21
638 0.27
639 0.26
640 0.27
641 0.27
642 0.27
643 0.25
644 0.26
645 0.31
646 0.28
647 0.33
648 0.41