FuNGI

R4XEQ8

Protein Details

Accession

R4XEQ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-110	PLAKMKEQIKRRRSKAPSKDKHLDSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-103	KEQIKRRRSKAPSK

Subcellular Location(s)

cyto 10, cyto_nucl 10, nucl 8, mito 4, plas 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR004859 Xrn1_N
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03159 XRN_N

Amino Acid Sequences

MGIKEKGFADWVAATFPDVVRELGSSDKAYFDTVCIDVNPLLHTCMRTSATEARFVKALFADLDRCLRLTIPSSTVYLAVDGSPPLAKMKEQIKRRRSKAPSKDKHLDSSQITPGCTFQLRVTEYLHYYAARYLATKNHPLQLRFIVDGAATAGEGEAKIMRYLYNNIHNLQERSVAVFSGDSDVVVQSLLSSVQDIYVLRPGVFNSIAISISRLRQVIIAETGGLKLVKMSNVIKDFSVMIMFSGNDYMHKLRGGRISKTWPVYKKFRQEAITSSKWYDRYLVLPGDTFDIEVLQELLTRIRRLTIRAAFVPDMKISLAMLGLSGTSMVSRPELESDESHSDVELDNINKEKRSPHYTPHIFNYLQSLLWTLAMYSTGRCPDVTFTQLGEYLSIEQILTFIARDIKHSRAPTIPEVEGITSLLTILCPISLLGVNKVHLVPASWRPVFSSDFVRDLCHSMINDATLKTGSERVKTLIYHIGQHVVSVVDPASAIIQLLTYGAAPLVLSRGNRPRPRWALPWQELGTSNAEIWDGVEIMQPQLSPDDYLFVREYVERQAAPEDHASIAHMTPSTWPFVPRANKPHAFAKRTKGLTKARSPQYLKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.15
4	0.15
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.13
9	0.14
10	0.15
11	0.18
12	0.17
13	0.17
14	0.18
15	0.18
16	0.19
17	0.18
18	0.15
19	0.16
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.16
24	0.15
25	0.16
26	0.17
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.18
31	0.16
32	0.2
33	0.22
34	0.21
35	0.25
36	0.32
37	0.31
38	0.4
39	0.4
40	0.37
41	0.37
42	0.36
43	0.33
44	0.25
45	0.25
46	0.18
47	0.19
48	0.19
49	0.19
50	0.23
51	0.21
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.18
56	0.2
57	0.21
58	0.2
59	0.21
60	0.22
61	0.22
62	0.22
63	0.2
64	0.16
65	0.13
66	0.11
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.11
73	0.11
74	0.11
75	0.17
76	0.26
77	0.32
78	0.42
79	0.52
80	0.6
81	0.7
82	0.75
83	0.79
84	0.8
85	0.83
86	0.84
87	0.85
88	0.85
89	0.85
90	0.89
91	0.82
92	0.8
93	0.72
94	0.68
95	0.6
96	0.55
97	0.52
98	0.45
99	0.41
100	0.35
101	0.31
102	0.28
103	0.25
104	0.21
105	0.15
106	0.2
107	0.22
108	0.23
109	0.25
110	0.25
111	0.26
112	0.26
113	0.26
114	0.19
115	0.18
116	0.18
117	0.17
118	0.14
119	0.13
120	0.13
121	0.19
122	0.24
123	0.3
124	0.32
125	0.37
126	0.41
127	0.41
128	0.42
129	0.41
130	0.39
131	0.33
132	0.3
133	0.24
134	0.19
135	0.18
136	0.15
137	0.09
138	0.06
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.1
150	0.14
151	0.18
152	0.25
153	0.27
154	0.28
155	0.32
156	0.35
157	0.34
158	0.32
159	0.3
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.17
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.13
191	0.13
192	0.12
193	0.09
194	0.1
195	0.1
196	0.09
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.13
201	0.12
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.1
218	0.11
219	0.15
220	0.18
221	0.19
222	0.17
223	0.17
224	0.17
225	0.14
226	0.13
227	0.08
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.11
239	0.11
240	0.13
241	0.22
242	0.25
243	0.25
244	0.28
245	0.33
246	0.36
247	0.4
248	0.42
249	0.4
250	0.43
251	0.49
252	0.52
253	0.56
254	0.56
255	0.57
256	0.54
257	0.5
258	0.5
259	0.49
260	0.46
261	0.38
262	0.35
263	0.32
264	0.3
265	0.29
266	0.25
267	0.18
268	0.16
269	0.18
270	0.17
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.12
276	0.1
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.1
290	0.11
291	0.13
292	0.2
293	0.21
294	0.23
295	0.23
296	0.26
297	0.24
298	0.24
299	0.23
300	0.16
301	0.13
302	0.1
303	0.09
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.02
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.08
322	0.1
323	0.1
324	0.14
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.12
331	0.12
332	0.11
333	0.09
334	0.09
335	0.13
336	0.14
337	0.13
338	0.14
339	0.17
340	0.2
341	0.28
342	0.29
343	0.32
344	0.42
345	0.47
346	0.49
347	0.49
348	0.48
349	0.41
350	0.38
351	0.37
352	0.27
353	0.22
354	0.19
355	0.16
356	0.11
357	0.12
358	0.11
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.08
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.12
370	0.15
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.15
375	0.16
376	0.15
377	0.13
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.09
390	0.09
391	0.13
392	0.17
393	0.2
394	0.25
395	0.27
396	0.29
397	0.28
398	0.33
399	0.33
400	0.34
401	0.3
402	0.26
403	0.26
404	0.23
405	0.2
406	0.16
407	0.11
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.05
418	0.07
419	0.08
420	0.11
421	0.13
422	0.13
423	0.15
424	0.15
425	0.14
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.18
430	0.25
431	0.24
432	0.24
433	0.25
434	0.28
435	0.29
436	0.27
437	0.27
438	0.22
439	0.25
440	0.25
441	0.26
442	0.24
443	0.25
444	0.24
445	0.2
446	0.18
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.17
451	0.14
452	0.14
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.18
457	0.19
458	0.19
459	0.21
460	0.22
461	0.25
462	0.25
463	0.27
464	0.28
465	0.26
466	0.27
467	0.27
468	0.29
469	0.26
470	0.25
471	0.23
472	0.15
473	0.14
474	0.11
475	0.1
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.06
494	0.08
495	0.09
496	0.15
497	0.25
498	0.35
499	0.43
500	0.47
501	0.56
502	0.61
503	0.67
504	0.67
505	0.67
506	0.68
507	0.65
508	0.7
509	0.61
510	0.56
511	0.51
512	0.46
513	0.4
514	0.3
515	0.26
516	0.17
517	0.16
518	0.13
519	0.12
520	0.1
521	0.07
522	0.07
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.12
530	0.12
531	0.11
532	0.11
533	0.14
534	0.13
535	0.17
536	0.18
537	0.16
538	0.17
539	0.17
540	0.19
541	0.2
542	0.24
543	0.21
544	0.21
545	0.26
546	0.26
547	0.28
548	0.29
549	0.25
550	0.22
551	0.22
552	0.22
553	0.18
554	0.17
555	0.16
556	0.13
557	0.12
558	0.16
559	0.18
560	0.21
561	0.2
562	0.21
563	0.21
564	0.3
565	0.37
566	0.41
567	0.48
568	0.54
569	0.57
570	0.6
571	0.68
572	0.69
573	0.69
574	0.67
575	0.68
576	0.67
577	0.69
578	0.69
579	0.68
580	0.68
581	0.7
582	0.74
583	0.75
584	0.74
585	0.77

R4XEQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer