Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XHH8

Protein Details
Accession R4XHH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67KDAMRSLKKRLGNKNPNVQLLHydrophilic
174-197LRCRTAFTFRNRKHHCRNCGNVFCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR017073  HGS/VPS27  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
IPR000306  Znf_FYVE  
IPR017455  Znf_FYVE-rel  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF01363  FYVE  
PF02809  UIM  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
PS50179  VHS  
PS50178  ZF_FYVE  
CDD cd21385  GAT_Vps27  
cd16979  VHS_Vps27  
Amino Acid Sequences MSWFSGSNPLDELVEKATDDSLPSDMEDLTLNLEICDRIRSKAVTAKDAMRSLKKRLGNKNPNVQLLALNLCDLCIKNGGSHFLIEIASREFVDNLLSLLRAPTGINHDVRQRLLELIQGWALAFESRPELGYMMTVYHNLRSEGLQFPPEERVAAAFVDTAAPPDWADSDVCLRCRTAFTFRNRKHHCRNCGNVFCGQCSTQSMTLPQLGINEPVRVCDDCHAKRGQNASATTVPQRRSKAVPDYQAQTPKRHVSRAGDTEDLDLKRALELSLAESGSAKPPATQTLPAAAGARAAEIEDEDEDMKAAIAASLKDSSANKATGSYAYPVLDTREGRRKEVLSSPLPSSQQKVIQPSVINLQDIQPVDQENIKLFANLVDRLKVDTPGAILRDPQIQELYDGISALRPKVARSLAETVGKYESLVETHSKLATVVKYYDRILESRLTATYSQSQQYGSQYEDPSRTSRNYDDAEAHSYYGQTPQYHHSEINGHSGYDYRNSGSQNYQAGDQGYSSHAPSYPDTLPANSVYSAAKKDARQVQEPEQPKEEVSLIDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.13
4 0.14
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.22
27 0.24
28 0.27
29 0.33
30 0.37
31 0.37
32 0.39
33 0.43
34 0.44
35 0.48
36 0.49
37 0.52
38 0.52
39 0.53
40 0.57
41 0.57
42 0.61
43 0.66
44 0.72
45 0.74
46 0.78
47 0.82
48 0.81
49 0.78
50 0.7
51 0.6
52 0.51
53 0.43
54 0.36
55 0.26
56 0.2
57 0.15
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.17
66 0.21
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.15
92 0.19
93 0.21
94 0.24
95 0.29
96 0.31
97 0.32
98 0.31
99 0.26
100 0.23
101 0.21
102 0.22
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.18
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.24
166 0.29
167 0.37
168 0.48
169 0.54
170 0.64
171 0.69
172 0.76
173 0.78
174 0.8
175 0.81
176 0.79
177 0.82
178 0.81
179 0.78
180 0.72
181 0.66
182 0.57
183 0.48
184 0.41
185 0.32
186 0.23
187 0.2
188 0.2
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.14
205 0.14
206 0.16
207 0.23
208 0.22
209 0.27
210 0.29
211 0.28
212 0.31
213 0.35
214 0.33
215 0.3
216 0.29
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.3
221 0.31
222 0.31
223 0.3
224 0.32
225 0.31
226 0.31
227 0.34
228 0.38
229 0.38
230 0.41
231 0.39
232 0.4
233 0.42
234 0.48
235 0.45
236 0.39
237 0.38
238 0.4
239 0.39
240 0.37
241 0.36
242 0.33
243 0.38
244 0.4
245 0.39
246 0.33
247 0.31
248 0.31
249 0.32
250 0.27
251 0.21
252 0.16
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.09
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.17
321 0.25
322 0.27
323 0.28
324 0.31
325 0.3
326 0.31
327 0.36
328 0.37
329 0.31
330 0.33
331 0.33
332 0.33
333 0.35
334 0.32
335 0.29
336 0.26
337 0.28
338 0.28
339 0.3
340 0.28
341 0.29
342 0.28
343 0.26
344 0.29
345 0.25
346 0.22
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.13
357 0.1
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.12
363 0.13
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.15
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.15
376 0.12
377 0.12
378 0.13
379 0.18
380 0.18
381 0.18
382 0.17
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.18
397 0.2
398 0.19
399 0.23
400 0.28
401 0.29
402 0.34
403 0.34
404 0.3
405 0.29
406 0.27
407 0.22
408 0.18
409 0.15
410 0.1
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.16
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.22
424 0.22
425 0.26
426 0.25
427 0.24
428 0.23
429 0.23
430 0.22
431 0.22
432 0.21
433 0.2
434 0.18
435 0.21
436 0.24
437 0.25
438 0.25
439 0.24
440 0.25
441 0.24
442 0.27
443 0.26
444 0.24
445 0.26
446 0.27
447 0.29
448 0.3
449 0.31
450 0.31
451 0.33
452 0.32
453 0.31
454 0.31
455 0.34
456 0.35
457 0.35
458 0.36
459 0.35
460 0.37
461 0.34
462 0.32
463 0.25
464 0.23
465 0.21
466 0.21
467 0.21
468 0.18
469 0.2
470 0.24
471 0.3
472 0.32
473 0.32
474 0.3
475 0.32
476 0.33
477 0.39
478 0.34
479 0.28
480 0.26
481 0.27
482 0.26
483 0.25
484 0.25
485 0.18
486 0.21
487 0.23
488 0.26
489 0.27
490 0.31
491 0.31
492 0.3
493 0.3
494 0.28
495 0.28
496 0.25
497 0.22
498 0.18
499 0.17
500 0.17
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.18
505 0.2
506 0.24
507 0.22
508 0.25
509 0.27
510 0.26
511 0.27
512 0.26
513 0.27
514 0.21
515 0.21
516 0.19
517 0.21
518 0.22
519 0.25
520 0.29
521 0.28
522 0.36
523 0.44
524 0.47
525 0.51
526 0.54
527 0.59
528 0.62
529 0.68
530 0.65
531 0.6
532 0.55
533 0.48
534 0.45
535 0.38